[發(fā)明專利]黃褐棉纖維長度相關(guān)QTL及其應(yīng)用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010782425.8 | 申請日： | 2020-08-06 |
| 公開（公告）號： | CN111793714A | 公開（公告）日： | 2020-10-20 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 汪保華;孫康泰;陳奇;莊智敏;曹云英;李德全;常燕;單婷玉;陳艷 | 申請（專利權(quán)）人： | 南通大學(xué) |
| 主分類號： | C12Q1/6895 | 分類號： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 暫無信息 | 代理人： | 暫無信息 |
| 地址： | 226019 *** | 國省代碼： | 江蘇;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 黃褐 棉纖維 長度 相關(guān) qtl 及其 應(yīng)用 | ||
本發(fā)明涉及植物遺傳領(lǐng)域，具體涉及黃褐棉纖維長度相關(guān)QTL及其應(yīng)用，本發(fā)明所述的黃褐棉纖維長度相關(guān)QTL qUHM?3?1，所述黃褐棉纖維長度相關(guān)QTL qUHM?3?1位于3號染色體，其鄰近的分子標(biāo)記為BNL3267。基于該QTL，可分子標(biāo)記輔助選育纖維長度表現(xiàn)突出的棉花材料。本發(fā)明的黃褐棉纖維長度相關(guān)QTL，在三個不同世代的群體中都被檢測到，具有不依賴環(huán)境的穩(wěn)定性。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及植物遺傳領(lǐng)域，具體涉及黃褐棉纖維長度相關(guān)QTL及其應(yīng)用。
背景技術(shù)
棉屬(Gossypium L.)包含四個栽培種，即草棉(G.herbaceum)，亞洲棉(G.arboreum)，陸地棉(G.hirsutum)和海島棉(G.barbadense)，是世界上最重要的紡織纖維的來源，而其中絕大多數(shù)棉花產(chǎn)量來自陸地棉栽培種。經(jīng)過長期的人類選育改良，現(xiàn)代陸地棉栽培種具備高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)等諸多適合人類需要的優(yōu)良特性；然而，人類選擇這些優(yōu)良性狀的同時也導(dǎo)致了棉花遺傳多樣性的喪失。有研究表明，現(xiàn)代陸地棉基因庫已經(jīng)十分有限，陸地棉品種的開發(fā)面臨著嚴(yán)重的遺傳多樣性的瓶頸。在異源棉花四倍體里，除陸地棉與海島棉是栽培種以外，其余都是野生棉。黃褐棉作為野生異源四倍體棉，與陸地棉遺傳距離較遠(yuǎn)，因此很可能存在一些新的基因位點(diǎn)，可以用于陸地棉的遺傳改良。研究表明黃褐棉種質(zhì)漸滲的陸地棉株系其纖維品質(zhì)性狀尤其是纖維長度存在著豐富的遺傳變異。因此如能將黃褐棉的優(yōu)質(zhì)基因?qū)腙懙孛蓿瑢欣谔岣哧懙孛薜睦w維品質(zhì)。
本申請擬對黃褐棉與陸地棉回交高世代群體及其后續(xù)選擇構(gòu)建的導(dǎo)入系開展遺傳評價，發(fā)掘黃褐棉的優(yōu)異纖維品質(zhì)基因。
發(fā)明內(nèi)容
針對以上問題，本發(fā)明提供了黃褐棉纖維長度相關(guān)QTL及其應(yīng)用，在三個不同世代的群體中都被檢測到，具有不依賴環(huán)境的穩(wěn)定性。
為了實(shí)現(xiàn)上述目的，本發(fā)明采用的技術(shù)方案如下：
本發(fā)明的目的是提供黃褐棉纖維長度相關(guān)QTLqUHM-3-1，所述黃褐棉纖維長度相關(guān)QTLqUHM-3-1位于3號染色體，其鄰近的分子標(biāo)記為BNL3267。
本發(fā)明的又一目的是提供黃褐棉纖維長度相關(guān)QTLqUHM-3-1的特異性SSR引物，所述引物的序列為：
本發(fā)明的另一目的是提供黃褐棉纖維長度相關(guān)QTLqUHM-3-1的應(yīng)用。
本發(fā)明還提供了一種獲得黃褐棉纖維長度相關(guān)QTL的方法，所述方法包括以下步驟：
(1)以陸地棉PD94042為受體親本、以黃褐棉(G.mustelinum)為供體親本雜交，并以陸地棉PD94042為輪回親本回交三代，再自交構(gòu)建回交高世代群體，在BC3F2:3及BC3F2:4世代，進(jìn)行回交高世代QTL分析；回交高世代群體數(shù)據(jù)分析包括：
(1-1)利用SSR分子標(biāo)記鑒定BC3F2群體的基因型；
(1-2)對BC3F2:3及BC3F2:4世代開展纖維品質(zhì)表型鑒定；
(1-3)構(gòu)建遺傳圖譜與QTL定位；
綜合回交高世代群體基因型數(shù)據(jù)，以各分子標(biāo)記對應(yīng)的序列，比對四倍體陸地棉基因組數(shù)據(jù)庫，獲得各分子標(biāo)記的基因組位置，以此為參考信息，對標(biāo)記間的連鎖關(guān)系進(jìn)行分析，構(gòu)建分子標(biāo)記的遺傳連鎖圖譜，再將基因型數(shù)據(jù)與表型數(shù)據(jù)相結(jié)合，開展黃褐棉纖維長度QTL定位；
(2)選出覆蓋棉花全基因組的導(dǎo)入系，導(dǎo)入系群體數(shù)據(jù)分析包括：
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