[發明專利]一種食管癌新輔助放化療療效評估的生物標記

在審

• 申請號: 202010781059.4
• 申請日: 2020-08-06
• 公開（公告）號: CN112195241A
• 公開（公告）日: 2021-01-08
• 發明（設計）人: 汪建林;朱宏明;尹麗;陳杰
• 申請（專利權）人: 常州市第二人民醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;G01N33/574
• 代理公司: 北京卓嵐智財知識產權代理事務所(特殊普通合伙) 11624
• 代理人: 蔣真

本發明公開了一種食管癌新輔助放化療療效評估的生物標記。MMP12蛋白作為生物標記物在制備食管癌新輔助放化療療效評估試劑、試劑盒或檢測裝置中的應用。MMP12的異常表達水平與食管鱗癌的TNM分期、淋巴結轉移、生存時間顯著相關(P0.05)，本發明通過微陣列數據分析確定了預測食管鱗癌患者nCRT反應的新生物標記物，MMP12可能是ESCC患者有用的腫瘤生物標志物和治療靶點。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，特別是涉及一種食管癌新輔助放化療療效評估的生物標記。

背景技術

食管癌多數患者晚期診斷預后差，一旦發生轉移，5年生存率將降至4％。對于局部晚期ESCC，術前新放化療(nCRT)是治療的主要組成部分。然而，病人在手術后常有疾病復發。同時，nCRT的預后也不同，nCRT 反應的患者生存時間更長，而無反應的患者預后更差。重要的是，nCRT可能增加術后并發癥，臨床參數(TNM分級、腫瘤位置)不能預測nCRT的反應。因此，通過識別新的生物標記物來預測nCRT反應，將有助于ESCC的管理。此外，它將幫助臨床醫生停止非有效治療，從而避免過度治療這些無反應的病人。

近年來，基因芯片分析和RNA測序技術的發展為探索基因表達變異與臨床預后的關系提供了有利的信息。本研究在RNA測序和生物信息學分析的基礎上，對ESCC中nCRT應答組和非應答組的差異表達基因(DEGs) 或差異表達miRNA進行了鑒定。此外，我們還構建了蛋白質相互作用(PPI)網絡和miRNA mRNA網絡，以探索與疾病進展相關的候選基因。Cox回歸分析探討ESCC患者生存時間與候選基因或miRNAs的相關性。ESCC 數據集的生物信息學分析示意圖如圖1所示。本發明探討了ESCC的轉錄組表達模式，識別具有預后價值的新的生物標記物可以更好地了解ESCC的進展。

發明內容

本發明的技術方案如下：

MMP12蛋白作為生物標記物在制備食管癌新輔助放化療療效評估試劑、試劑盒或檢測裝置中的應用。

本發明提供了一種食管癌新輔助放化療療效評估的生物標記。在本發明中，術前新放化療(nCRT)是治療局部晚期食管癌的標準方法。然而，對于許多患者，nCRT的結果是不同的。在整合PPI網絡和miRNA mRNA 網絡后，我們篩選出8個與疾病進展相關的候選基因，包括腫瘤壞死因子、AKR1C1、AKR1C2、ICAM1、GPR68、 GNB4、SERPINE1和MMP12。此外，MMP12的異常表達水平與食管鱗癌的TNM分期、淋巴結轉移、生存時間顯著相關(P0.05)，本發明通過微陣列數據分析確定了預測食管鱗癌患者nCRT反應的新生物標記物，MMP12 可能是ESCC患者有用的腫瘤生物標志物和治療靶點。

檢測MMP12蛋白表達的產品在食管癌新輔助放化療療效評估中的應用。

一種食管癌新輔助放化療療效檢測試劑盒，包括與MMP12蛋白特異性結合的檢測物。

所述檢測物優選自與MTHFD2蛋白特異性結合的抗體或者與MTHFD2編碼基因特異性結合的引物或探針。