[發明專利]基于圖像處理算法的腫瘤間質比判定方法及系統在審
| 申請號: | 202010738520.8 | 申請日: | 2020-07-28 |
| 公開(公告)號: | CN111815624A | 公開(公告)日: | 2020-10-23 |
| 發明(設計)人: | 耿道穎;于澤寬;陳子昂;李郁欣;張軍;尹波;吳昊;耿巖;胡斌;陸逸平;李海慶;周書怡;曹鑫;樸思蓉 | 申請(專利權)人: | 復旦大學附屬華山醫院 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06T5/00;G06T5/20;G06T5/40;G06T7/11;G06T7/136;G06T7/90 |
| 代理公司: | 上海漢聲知識產權代理有限公司 31236 | 代理人: | 胡晶 |
| 地址: | 200040 上*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 圖像 處理 算法 腫瘤 間質 判定 方法 系統 | ||
1.一種基于圖像處理算法的腫瘤間質比判定方法,其特征在于,包括:
步驟M1:讀取腫瘤病理切片HE免疫組化圖像;
步驟M2:選取圖像的平均灰度值和圖像的模糊程度在預設范圍內的圖像;
步驟M3:基于圖像預處理算法對選取的圖像進行預處理,得到預處理后的圖像;
步驟M4:對預處理后的圖像進行分割;
步驟M5:得到分割結果并標注,計算腫瘤間的質比。
2.根據權利要求1所述的基于圖像處理算法的腫瘤間質比判定方法,其特征在于,所述步驟M3包括:
步驟M3.1:對HE免疫組化圖像進行灰度化處理,對圖像數據進行歸一化;
步驟M3.2:對圖像進行歸一化處理后,通過中值濾波處理對圖像進行第一次降噪;
步驟M3.3:對圖像進行第一次降噪處理后,通過直方圖均衡化處理增強圖像對比度;
步驟M3.4:對圖像進行直方圖均衡化處理后,通過開閉運算和雙邊濾波處理對圖像進行第二次降噪。
3.根據權利要求1所述的基于圖像處理算法的腫瘤間質比判定方法,其特征在于,所述步驟M4包括:對預處理后的圖像按照閾值和/或區域進行分割;
所述對預處理后的圖像按照閾值進行分割是基于閾值的分割,采用改進的OTSU法計算閾值,通過閾值分割腫瘤圖像的實質、間質部分并標注;
所述對預處理后的圖像按照區域進行分割,采用區域生長算法通過對腫瘤空白區域的手動標注來進行分割;
所述改進的OTSU法是在OTSU算法的基礎上對OTSU法的遍歷范圍根據癌腫瘤圖像特征進行改進的算法。
4.根據權利要求3所述的基于圖像處理算法的腫瘤間質比判定方法,其特征在于,所述對預處理后的圖像按照閾值進行分割包括:
預設表示腫瘤圖像壞死區域特征的近白色參數;將圖像灰度最小值和近白色參數作為遍歷條件,計算得到使圖像類間方差最大的像素值,并將使圖像類間方差最大的像素值設為閾值A,將像素灰度值小于閾值A的圖像區域劃分為實質區域;近白色參數作為閾值B,將像素灰度值大于閾值B的圖像區域劃分為間質區域;通過閾值A和閾值B分割并標注腫瘤圖像的區域,包括:實質區域、壞死區域和間質區域。
5.根據權利要求3所述的基于圖像處理算法的腫瘤間質比判定方法,其特征在于,所述對預處理后的圖像按照區域進行分割包括:按照區域分割是使用區域生長的算法進行分割的方法,通過以對圖像每塊壞死區域點擊一點作為種子點,以每塊區域的種子點的灰度值K與圖像像素灰度平均值O的絕對值P作為判斷條件,當種子點周圍像素點灰度值與種子點灰度值的絕對值小于P時,則劃分到一個區域內,使這個區域不斷生長,直到周圍沒有滿足條件的像素點為止,分割出來的壞死區域中所有像素點的灰度平均值作為近白色參數,使用改進的OTSU算法計算閾值分割圖像實質部分,則圖像其余區域則為圖像間質區域。
6.根據權利要求1所述的基于圖像處理算法的腫瘤間質比判定方法,其特征在于,所述步驟M5包括:對腫瘤間質比的計算,在各區域分割并標注成功的基礎上,腫瘤的間質比為腫瘤圖像的間質部分面積與整體面積的比例。
7.一種基于圖像處理算法的腫瘤間質比判定系統,其特征在于,包括:
模塊M1:讀取腫瘤病理切片HE免疫組化圖像;
模塊M2:選取圖像的平均灰度值和圖像的模糊程度在預設范圍內的圖像;
模塊M3:基于圖像預處理算法對選取的圖像進行預處理,得到預處理后的圖像;
模塊M4:對預處理后的圖像進行分割;
模塊M5:得到分割結果并標注,計算腫瘤間的質比。
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