[發明專利]一種腦卒中用藥基因位點聯合檢測的方法及其引物組、探針組和試劑盒

在審

• 申請號: 202010719690.1
• 申請日: 2020-07-23
• 公開（公告）號: CN111893174A
• 公開（公告）日: 2020-11-06
• 發明（設計）人: 裘敏燕
• 申請（專利權）人: 上海聯吉醫學檢驗所有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 上海申新律師事務所 31272
• 代理人: 郎祺

本發明的涉及一種用于腦卒中用藥基因位點聯合檢測的引物組及探針組，利用生物信息學知識和相關生物信息學軟件，對公開數據庫中所能檢索到的多個SNP位點序列信息進行同源性分析、周邊SNP分析、頻度分析、堿基含量分析及SNP周邊序列分析后，設計特異的PCR引物及基因型特異性的熒光標記探針系統并進行優化，所述引物組序列為SEQ ID NO:1?SEQ ID NO:128；所述探針組序列為SEQ ID NO:129?SEQ ID NO:256；再涉及一種用于腦卒中用藥基因位點聯合檢測的試劑盒；還涉及一種腦卒中用藥基因位點聯合檢測的方法。本發明利用基于OpenArray納升流控芯片的實時熒光定量PCR檢測技術實現腦卒中用藥SNP位點的檢測分型，其優勢在于通量大，特異性及靈敏度高，結果穩定，重復性好，檢測速度快。

技術領域

本發明涉及分子生物學基因技術領域，尤其涉及一種腦卒中用藥基因位點聯合檢測的方法及其引物組、探針組和試劑盒。

背景技術

“腦卒中”又稱“中風”、“腦血管意外”，是一種急性腦血管疾病，是由于腦部血管突然破裂或因血管阻塞導致血液不能流入大腦而引起腦組織損傷的一組疾病，包括缺血性和出血性卒中。

腦卒中是我國成年人致殘的首要原因，其同時具有高致殘率、高發病率、高復發率、高死亡率、高經濟負擔的特點。中國現有腦卒中患者約1300萬，其中75％的幸存者有不同程度殘疾，40％為重度殘疾。高危人群現有3300萬，每年新增約200萬人，防控形式非常嚴峻。

腦卒中病因復雜，主要高危因素有血栓、高血壓(其中75％為H型高血壓)、糖尿病、高血脂等。針對不同高危因素，開展有針對性、個體化的治療和干預，是降低腦卒中復發率的有效措施，可以防止近40％的腦卒中發生，預防效果最顯著。

腦卒中患者基因型差異，對導致對特定藥物的代謝能力不同，從而直接關系到藥物療效和毒副作用的強弱。若藥物在體內代謝較慢，代謝產物不易排出體外，容易積聚而引起藥物性肝炎，嚴重者則引起藥物中毒；若藥物在體內代謝過快，就會導致常規劑量療效降低或者無效，延誤病情。因此，臨床醫生在給個體用藥時，結合個人的遺傳因素，可以提高用藥的有效率，避免藥物不良反應的發生。

目前尚沒有報道基于OpenArray納升流控芯片的實時熒光定量PCR檢測技術專門用于腦卒中用藥基因位點的聯合檢測。因此亟需一種腦卒中用藥基因位點聯合檢測的方法及其引物組、探針組和試劑盒。

發明內容

本發明的目的是針對現有技術中的不足，提供一種腦卒中用藥基因位點聯合檢測的方法及其引物組、探針組和試劑盒。

為實現上述目的，本發明采取的技術方案是：

本發明的第一方面是提供一種用于腦卒中用藥基因位點聯合檢測的引物組及探針組，利用生物信息學知識和相關生物信息學軟件，對公開數據庫中所能檢索到的多個SNP位點序列信息進行同源性分析、周邊SNP分析、頻度分析、堿基含量分析及SNP周邊序列分析后，設計特異的PCR引物及基因型特異性的熒光標記探針系統并進行優化，所述引物組序列為SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:128；所述探針組序列為SEQ ID NO:129-SEQ ID NO:256：

基因與位點對應關系如下：