[發明專利]一種荒漠植物綿刺的微衛星位點及其擴增引物與應用

有效

• 申請號: 202010714292.0
• 申請日: 2020-07-21
• 公開（公告）號: CN111808982B
• 公開（公告）日: 2023-03-31
• 發明（設計）人: 郭洋楠;賀安民;常建鴻;李斌;張保衛;智穎飆
• 申請（專利權）人: 神華神東煤炭集團有限責任公司;內蒙古大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6806;C12Q1/686;C12N15/11
• 代理公司: 北京邦信陽專利商標代理有限公司 11012
• 代理人: 耿蕾

本發明公開了一種荒漠植物綿刺的微衛星位點及其擴增引物與應用。本發明公開的綿刺微衛星位點包括微衛星位點Pm1～Pm11中的一種或多種，Pm1～Pm11的序列分別如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:11所示。本發明公開的綿刺微衛星位點及其擴增引物在對綿刺的保護遺傳學研究、種質資源調查和輔助育種等方面中都起到重要作用，同時也為植物抗旱機制的研究提供基礎材料。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，涉及荒漠植物綿刺的微衛星位點及其擴增引物與應用。

背景技術

綿刺(Potaninia mongolica Maxim)是薔薇科、綿刺屬植物，是分布于中國內蒙古的一種超耐旱也極耐鹽堿的植物。綿刺是飼料植物，青鮮時駱駝、羊、馬、驢等喜食。綿刺荒漠為中國的東阿拉善至西鄂爾多斯地區的主要放牧場地。

我國是世界上荒漠化和沙化面積大、分布廣、危害重的國家之一，嚴重的土地荒漠化、沙化威脅著我國生態安全和經濟社會的可持續發展，威脅中華民族的生存和發展。根據第三次全國荒漠化監測的數據來看，我國荒漠化面積達到了263.62萬Km²，占我國國土面積的27.46％。綿刺的超強抗旱性和可飼食性使其成為植物抗旱機制和飼料應用的良好研究對象，綿刺的多態性研究可為這些研究提供基礎數據。

微衛星標記(microsatellite)，又稱為短串聯重復序列(short tandem repeats,STRs)或簡單重復序列(simple sequence repeats)，是均勻分布于真核生物基因組中的簡單重復序列，由2～6個核苷酸的串聯重復片段構成，由于重復單位的重復次數在個體間呈高度變異性并且數量豐富，因此微衛星標記的應用非常廣泛。微衛星位點通常通過PCR擴增，擴增產物通過電泳分析并根據大小分離等位基因進行檢測。PCR擴增后的等位微衛星可用熒光標記的方法進行檢測，在適合的引物的5’端加上不同的熒光標記，對產物所對應的峰圖進行分析，從而得到相應的結果。

發明內容

本發明基于對綿刺的分子遺傳學研究結果，提供綿刺的微衛星位點及其擴增引物，以用于綿刺的育種和品種鑒定和檢測。

在一個方面，本發明提供綿刺(Potaninia mongolica Maxim)微衛星位點，包括微衛星位點Pm1～Pm11中的一種或多種，例如其中的4、5、6、7、8、9、 10或11種，Pm1～Pm11的序列分別如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:11所示。

在另一個方面，本發明還提供上述綿刺微衛星位點的擴增引物。

在一些實施方案中，上述擴增引物中，

用于擴增Pm1的引物對如SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13所示；

用于擴增Pm2的引物對如SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:15所示；

用于擴增Pm3的引物對如SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:17所示；

用于擴增Pm4的引物對如SEQ ID NO:18和SEQ ID NO:19所示；

用于擴增Pm5的引物對如SEQ ID NO:20和SEQ ID NO:21所示；

用于擴增Pm6的引物對如SEQ ID NO:22和SEQ ID NO:23所示；

用于擴增Pm7的引物對如SEQ ID NO:24和SEQ ID NO:25所示；

用于擴增Pm8的引物對如SEQ ID NO:26和SEQ ID NO:27所示；

用于擴增Pm9的引物對如SEQ ID NO:28和SEQ ID NO:29所示；

用于擴增Pm10的引物對如SEQ ID NO:30和SEQ ID NO:31所示；