[發明專利]一種快速構建血漿DNA測序文庫的方法和試劑盒在審
| 申請號: | 202010641329.1 | 申請日: | 2014-06-24 |
| 公開(公告)號: | CN111748606A | 公開(公告)日: | 2020-10-09 |
| 發明(設計)人: | 陳迪;李亞麗;李天成;石燕濱;張江花;吳凱 | 申請(專利權)人: | 北京貝瑞和康醫學檢驗實驗室有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6806 | 分類號: | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
| 代理公司: | 北京市金杜律師事務所 11256 | 代理人: | 孟凡宏;謝燕軍 |
| 地址: | 100015 北京市朝陽區京*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 快速 構建 血漿 dna 序文 方法 試劑盒 | ||
1.用于構建血漿DNA測序文庫的方法,其特征在于,包括以下步驟:
1)抽提血漿DNA;
2)任選將血漿DNA進行末端補平,獲得末端補平后的血漿DNA;
3)將任選末端補平后的血漿DNA進行3’懸A,獲得3’懸A后的血漿DNA;
4)將3’懸A后的血漿DNA與測序接頭連接,獲得連接產物;
5)對連接產物進行純化,獲得純化產物。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,步驟4)通過選自以下的一種或兩種酶來進行:T4 DNA連接酶和T7 DNA連接酶。
3.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述測序接頭為雙鏈的測序接頭。
4.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述3’懸A采用klenow ex-酶、Taq酶、或klenow ex-酶與Taq酶的組合。
5.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述步驟2)和3)之間進行純化步驟;或所述步驟2)和3)在一個反應體系中進行,中間沒有純化步驟。
6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述步驟2)采用T4DNA聚合酶進行;且所述步驟3)采用Taq酶進行。
7.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述步驟3)和4)之間進行純化步驟;或步驟2)、3)和4)在一個反應體系中進行,中間沒有純化步驟。
8.根據權利要求7所述的方法,其特征在于,所述步驟2)采用T4DNA聚合酶進行;所述步驟3)采用Taq酶進行;且所述步驟4)采用T4 DNA連接酶和T7 DNA連接酶進行。
9.用于構建血漿DNA測序文庫的試劑盒,其特征在于,包含:
-任選地將血漿DNA進行末端補平的試劑,包括dNTP、用于末端補平的酶、和末端補平緩沖液;
-進行3’懸A的試劑,包括dATP、用于末端懸A的酶、和末端懸A緩沖液;
-與測序接頭連接的試劑,包括測序接頭、連接酶、和連接緩沖液;和
-對連接產物進行純化的試劑和裝置。
10.根據權利要求9所述的試劑盒,其特征在于,所述連接酶選自以下中的一種或兩種:T4 DNA連接酶和T7 DNA連接酶。
11.根據權利要求9所述的試劑盒,其特征在于,所述測序接頭為雙鏈的測序接頭。
12.根據權利要求9所述的試劑盒,其特征在于,所述所述用于末端懸A的酶為klenowex-酶、Taq酶、或klenow ex-酶與Taq酶的組合。
13.根據權利要求9所述的試劑盒,其特征在于,所述用于末端補平的酶為T4 DNA聚合酶。
14.根據權利要求12或13所述的試劑盒,其特征在于,所述用于末端補平的酶為T4 DNA聚合酶;所述用于末端懸A的酶為Taq酶。
15.根據權利要求9所述的試劑盒,其特征在于,所述用于末端補平的酶為T4 DNA聚合酶;所述用于末端懸A的酶為Taq酶;用于連接的酶為T4 DNA連接酶和T7 DNA連接酶;且用于連接的接頭為雙鏈接頭。
16.根據權利要求9所述的試劑盒,其特征在于,所述對連接產物進行純化的試劑選自無菌dH2O或洗脫緩沖液;對連接產物進行純化的裝置選自純化柱、Qiagen柱、純化磁珠或Beckman Ampure XP beads。
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