[發明專利]一種預測鼻咽癌預后的腫瘤微環境成分標志物組合及系統

有效

• 申請號: 202010633755.0
• 申請日: 2020-07-02
• 公開（公告）號: CN111910000B
• 公開（公告）日: 2022-07-01
• 發明（設計）人: 馬駿;陳雨沛;柳娜;孫穎;李文斐;呂佳蔚;王雅琴;李曉敏;李君炎;張磐磐;黎映琴;唐玲瓏;毛燕萍;周冠群;何慶梅;楊曉靜
• 申請（專利權）人: 中山大學腫瘤防治中心（中山大學附屬腫瘤醫院;中山大學腫瘤研究所）
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11;G16B30/00;G16H50/20
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 許飛

1.用于預測鼻咽癌預后的腫瘤微環境成分標志物組合，選自細胞周期增殖成分和五種免疫細胞成分中的至少一組，其中：

所述細胞周期增殖成分的特征基因為DEPDC1、DLGAP5、HJURP、PBK、TOP2A、GTSE1、ASPM、CDC20、CEP55、CKAP2L、HMMR、NEK2、BIRC5、CCNA2、MKI67、FAM64A、KIF4A、KIF2C、CENPF、AURKB、KIF14、NUF2、ESCO2、NUSAP1、NCAPG、CDCA3、CDCA5、CENPE、KIF20A和CENPA；所述細胞周期增殖成分高表達時，鼻咽癌患者的預后相比于低表達組患者要更差；

所述五種免疫細胞成分分別為巨噬細胞成分、漿細胞樣樹突狀細胞成分、CLEC9A+ 樹突狀細胞成分、自然殺傷細胞成分和漿細胞成分，

所述巨噬細胞成分的特征基因為APOE、APOC1、RNASE1、CTSL、C1QA、C1QB、C1QC、CTSD、ADAMDEC1、SPP1、FTL、NUPR1、GPNMB、FCGR3A、CCL8、PLD3、LGMN、GLUL、CTSC、CD163、PSAP、CTSB、CCL3、HES1、MMP9、MS4A4A、IFIT1、ACP5、PLA2G7、CD68、MAFB、CD14、IFI6、TREM2、MS4A7、PRDX1、ASAH1、LGALS3、CCL4、IFI27、MARCKS、CREG1、CD81、SLC40A1、CTSS、FCER1G、CXCL9；所述巨噬細胞成分高表達時，鼻咽癌患者的預后相比于低表達組患者要更好；

所述漿細胞樣樹突狀細胞成分的特征基因為PTGDS、GZMB、IGJ、TCL1A、LILRA4、PLAC8、ITM2C、IRF7、PPP1R14B、TCF4、TSPAN13、CLIC3、SELL、PLD4、UGCG、CCDC50、C12orf75、BCL11A、MZB1、PTCRA、SPIB、LRRC26、SMPD3、MAP1A、ALOX5AP、SCT、PTPRS、IL3RA、APP、CYB561A3、SEC61B、SPCS1、CLEC4C、SLC15A4、HIGD1A、NUCB2、MPEG1、LTB、GAPT、IDH3A、LAMP5、C10orf118、TRAF4和OFD1；所述漿細胞樣樹突狀細胞成分高表達時，鼻咽癌患者的預后相比于低表達組患者要更好；

所述CLEC9A+ 樹突狀細胞成分的特征基因為RGCC、CPVL、CLEC9A、CPNE3、C1orf54、DNASE1L3、SNX3、CCND1、IRF8、LGALS2、CLNK、CST3、NAAA、SERPINB1、PPT1和XCR1；所述CLEC9A⁺樹突狀細胞成分高表達時，鼻咽癌患者的預后相比于低表達組患者要更好；

所述自然殺傷細胞成分的特征基因為GNLY、TYROBP、KLRC1、FCER1G、XCL1、XCL2、KLRD1、CTSW、IFITM3、HOPX、KLRF1、KLRC2和PRF1；所述自然殺傷細胞成分高表達時，鼻咽癌患者的預后相比于低表達組患者要更好；

所述漿細胞成分的特征基因為IGJ、XBP1、MZB1、SSR4、DERL3、FKBP11、HSP90B1、ITM2C、SEC11C、PRDX4、FKBP2、HERPUD1、JUN、SSR3、VIMP、SDF2L1、SELK、SPCS2、MANF、C19orf10、SPCS3、HSPA5、IFI6、PPIB、RRBP1、SEC61B、DNAJB9、PIM2、SPCS1、CD63、PDIA4、ERLEC1、NUCB2、TNFRSF17、SEC61G、LMAN1、JSRP1、TMEM258、TMEM59、RPN2、RABAC1、SDC1、LGALS1、KDELR2、CRELD2、IFI27、SUB1、PSAP、GSTP1、CD38、NPC2、TMED10、ARF4、NEAT1、KRTCAP2、TMED9、SELM、PDIA6、SLAMF7、HM13、P4HB、SRGN、TMED2、TXNDC15、CD27、KDELR1、TRAM1、HLA-C、CD59、TMBIM6和TIMP1；所述漿細胞成分高表達時，鼻咽癌患者的預后相比于低表達組患者要更好。

2.定量腫瘤微環境成分標志物組合的mRNA表達量的試劑在制備鼻咽癌預后確定試劑中的應用，其特征在于：所述腫瘤微環境成分標志物組合如權利要求1所述。