[發(fā)明專利]基于空間可分離性的利用基因檢測的疾病預(yù)測方法及系統(tǒng)在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010616721.0 | 申請日： | 2020-07-01 |
| 公開（公告）號： | CN111755076A | 公開（公告）日： | 2020-10-09 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 杜強;李德軒;郭雨晨;聶方興;張興;唐超 | 申請（專利權(quán)）人： | 北京小白世紀(jì)網(wǎng)絡(luò)科技有限公司 |
| 主分類號： | G16B40/20 | 分類號： | G16B40/20;G16H50/30 |
| 代理公司： | 北京八月瓜知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11543 | 代理人： | 李斌 |
| 地址： | 100083 北京市海淀區(qū)*** | 國省代碼： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 基于 空間 可分離 利用 基因 檢測 疾病 預(yù)測 方法 系統(tǒng) | ||
1.基于空間可分離性的利用基因檢測的疾病預(yù)測方法，其特征在于，包括以下步驟：
獲取人體基因及基因檢測數(shù)據(jù)；系統(tǒng)通過MAX函數(shù)確定每個基因?qū)?yīng)的各種病種的值域，對比每個基因的各個病種的值域范圍是否發(fā)生重疊，確定獲得具有能甄別特定病種的基因；系統(tǒng)提取各具有能甄別特定病種的基因的數(shù)值，將對應(yīng)的各基因的行數(shù)據(jù)進行標(biāo)準(zhǔn)化處理；根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化處理后的各具有能甄別特定病種的基因的行數(shù)據(jù)，系統(tǒng)計算每個具有能甄別特定病種的基因?qū)?yīng)的每個病種的數(shù)值范圍的均值及該基因?qū)?yīng)的所有病種數(shù)值范圍的均值；再計算該具有能甄別特定病種的基因?qū)?yīng)的所有病種數(shù)值范圍的均值與該基因能甄別的病種數(shù)值范圍的均值的距離期望，即獲得各具有能甄別特定病種的基因的離散值；將各離散值進行排序，剔除顯著低于0.1的具有能甄別特定病種的基因，獲得顯著基因；將顯著基因按照其能甄別的病種進行分類，并對同一類顯著基因的離散值進行正則化，得到正則化后的離散值；系統(tǒng)通過python的基本命令語句計算得到各顯著基因所能甄別的病種的數(shù)值范圍的值域及剩下的病種的數(shù)值范圍的值域，確定每個顯著基因的閾值；對每個顯著基因?qū)?yīng)的病種設(shè)置一個初始預(yù)測得分為0；系統(tǒng)將每個顯著基因的數(shù)值與閾值進行比較，得到每個病種對應(yīng)的最終預(yù)測得分，根據(jù)預(yù)測得分，判斷患病的幾率。
2.如權(quán)利要求1所述的基于空間可分離性的利用基因檢測的疾病預(yù)測方法，其特征在于，所述系統(tǒng)通過MAX函數(shù)確定每個基因?qū)?yīng)的各種病種的值域，對比每個基因的各個病種的值域范圍是否發(fā)生重疊，確定獲得具有能甄別特定病種的基因具體為：
對基因檢測數(shù)據(jù)以基因為單位進行遍歷，通過MAX函數(shù)確定每個基因?qū)?yīng)的各種病種的最大值和最小值，確定其值域范圍；根據(jù)比對單個基因?qū)?yīng)的各個病種的值域范圍是否發(fā)生重疊，若沒有發(fā)生重疊，則該基因為具有能甄別特定病種的基因。
3.如權(quán)利要求1所述的基于空間可分離性的利用基因檢測的疾病預(yù)測方法，其特征在于，所述將對應(yīng)的各基因的行數(shù)據(jù)進行標(biāo)準(zhǔn)化處理包括如下步驟：
首先通過max函數(shù)算出單個具有能甄別特定病種的基因?qū)?yīng)的行數(shù)據(jù)的最大值和最小值，通過最大值減去最小值得到差值，再將該行數(shù)據(jù)減去最小值并與差值相除，得到該行數(shù)據(jù)的正則值。
4.如權(quán)利要求1所述的基于空間可分離性的利用基因檢測的疾病預(yù)測方法，其特征在于，所述對同一類顯著基因的離散值進行正則化包括步驟：
確定病種對應(yīng)的所有顯著基因的離散值的最大值，使用每個顯著基因的離散值除以其最大值，得到正則化后的離散值。
5.如權(quán)利要求1所述的基于空間可分離性的利用基因檢測的疾病預(yù)測方法，其特征在于，所述確定每個顯著基因的閾值包括以下步驟：
系統(tǒng)通過python的基本命令語句計算得到該顯著基因所能甄別的病種的數(shù)值范圍的最大值a和最小值b；
再計算剩下的病種的數(shù)值范圍的最大值c和最小值d，每個顯著基因的閾值確認(rèn)包括以下兩種情況：
第一種情況是b＞c時，那么顯著基因的閾值等于b-(a-b)/(a-b+c-d)*(b-c)；
第二種情況是a＜d時，那么顯著基因的閾值等于a+(a-b)/(a-b+c-d)*(d-a)。
6.如權(quán)利要求1所述的基于空間可分離性的利用基因檢測的疾病預(yù)測方法，其特征在于，所述系統(tǒng)將每個顯著基因的數(shù)值與其閾值進行比較，得到每個病種對應(yīng)的最終預(yù)測得分包括以下兩種情況：
第一種情況：顯著基因所能甄別的病種的數(shù)值范圍最大值小于其閾值，因此該病種的最終得分為預(yù)測得分加上該顯著基因?qū)?yīng)的正則化后的離散值；反之，丟棄該顯著基因；
第二種情況：如果該顯著基因所能甄別的病種的數(shù)值范圍最小值大于其閾值，那么該病種的最終得分為預(yù)測得分應(yīng)該加上該顯著基因?qū)?yīng)的正則化后的離散值，反之丟棄該顯著基因。
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