[發明專利]一種藥物靶點預測方法、裝置、設備及介質

有效

• 申請號: 202010594103.0
• 申請日: 2020-06-28
• 公開（公告）號: CN111477287B
• 公開（公告）日: 2020-11-20
• 發明（設計）人: 雷濤;呂慧
• 申請（專利權）人: 天云融創數據科技（北京）有限公司
• 主分類號: G16C20/50
• 分類號: G16C20/50;G16C20/70;G06K9/62
• 代理公司: 北京開陽星知識產權代理有限公司 11710
• 代理人: 安偉

本公開實施例公開了一種藥物靶點預測方法、裝置、設備及介質，其中該方法包括：獲取待預測藥物配體分子；根據待預測藥物配體分子與設定數量的代表性配體分子特征之間的三維指紋相似度關系，確定待預測藥物配體分子的特征數據；采用藥物靶點預測算法對待預測藥物配體分子的特征數據進行數據處理，得到待預測藥物配體分子的藥物靶點，其中，藥物靶點預測算法對應的樣本數據庫基于藥物配體分子與設定數量的代表性配體分子特征的三維指紋相似度確定。采用上述技術方案，特征數據的信息更加全面以及維度降低，并且由于藥物靶點預測算法的樣本數據庫基于多個代表性配體分子特征得到，使得采用該藥物靶點預測算法進行藥物靶點預測時，準確率和效率更高。

技術領域

本公開涉及數據處理技術領域，尤其涉及一種藥物靶點預測方法、裝置、設備及介質。

背景技術

藥物研究過程中一個重要的環節就是新藥的篩選，而建立一個新藥的篩選系統的關鍵就是尋找藥物作用靶點來提供干預治療。藥物靶點是藥物與機體生物大分子作用而產生藥理學作用并達到防治疾病目的的由生物分子形成的特殊位點，是藥物發揮作用的基礎，在新藥篩選中具有十分重要的意義。預測藥物靶點不但對藥物分子初期成藥性的評價有著不可替代的作用，而且對藥物成熟后老藥新用等領域都有著重大的意義，但因為藥物的通量、準確度、成本等限制，實驗方法的應用難以廣泛地展開。藥物化合物的活性尋找是一件讓人費心費力的事情，尤其天然產物研究更是困難重重。一種新的藥物從篩選到上市成功，據統計，花費高達2.0-3.5億美元，且平均需要歷經10到14年的時間。目前，臨床階段候選藥物的淘汰率高達90%。

作為一類低成本且快速的方法，利用計算機預測藥物靶點的方法正受到越來越多的重視。藥物靶點預測可以采用一定計算方法，對化合物的潛在作用靶點或藥理作用進行預測。傳統計算機藥物靶點預測方法包括基于反向對接的藥物靶點預測方法和單純基于分子指紋相似度的藥物靶點預測方法，但是反向對接技術依賴蛋白的晶體結構，并且打分函數對預測準確性的影響非常大；而基于分子指紋相似度的藥物靶點預測方法的樣本數據的準確性有待提高。

發明內容

為了解決上述技術問題或者至少部分地解決上述技術問題，本公開提供了一種藥物靶點預測方法、裝置、設備及介質，可以優化現有的藥物靶點預測方案，提高準確性。

本公開實施例提供了一種藥物靶點預測方法，包括：

獲取待預測藥物配體分子；

根據所述待預測藥物配體分子與設定數量的代表性配體分子特征之間的三維指紋相似度關系，確定所述待預測藥物配體分子的特征數據；

采用藥物靶點預測算法對所述待預測藥物配體分子的特征數據進行數據處理，得到所述待預測藥物配體分子的藥物靶點，其中，所述藥物靶點預測算法對應的樣本數據庫基于藥物配體分子與所述設定數量的代表性配體分子特征的三維指紋相似度確定。

本公開實施例還提供了一種藥物靶點預測裝置，包括：

待預測數據獲取模塊，用于獲取待預測藥物配體分子；

待預測特征確定模塊，根據所述待預測藥物配體分子與設定數量的代表性配體分子特征之間的三維指紋相似度關系，確定所述待預測藥物配體分子的特征數據；

數據處理模塊，用于采用藥物靶點預測算法對所述待預測藥物配體分子的特征數據進行數據處理，得到所述待預測藥物配體分子的藥物靶點，其中，所述藥物靶點預測算法對應的樣本數據庫基于藥物配體分子與所述設定數量的代表性配體分子特征的三維指紋相似度確定。

本公開實施例還提供了一種電子設備，所述電子設備包括：處理器；用于存儲所述處理器可執行指令的存儲器；所述處理器，用于從所述存儲器中讀取所述可執行指令，并執行所述指令以實現如本公開實施例提供的藥物靶點預測方法。