[發明專利]一種prep基因缺失型斑馬魚的構建方法有效
| 申請號: | 202010574627.3 | 申請日: | 2020-06-22 |
| 公開(公告)號: | CN111575320B | 公開(公告)日: | 2022-11-29 |
| 發明(設計)人: | 陸輝強;黃勇;廖信軍;賈坤;曹子崗;程波;鐘科元;馬進澤 | 申請(專利權)人: | 贛南師范大學 |
| 主分類號: | C12N15/90 | 分類號: | C12N15/90;C12N15/85;A01K67/027 |
| 代理公司: | 西安銘澤知識產權代理事務所(普通合伙) 61223 | 代理人: | 崔瑞迎 |
| 地址: | 341000 江西省贛州市蓉江*** | 國省代碼: | 江西;36 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 prep 基因 缺失 斑馬 構建 方法 | ||
1.prep基因在構建肝臟再生缺陷斑馬魚模型中的應用,其特征在于,所述肝臟再生缺陷斑馬魚模型的構建方法包括如下步驟:
S1、查詢斑馬魚prep基因的基因組DNA序列,并分析其功能結構域,根據CRISPR/Cas9敲除原理,在prep基因第3外顯子找到prep基因的靶位點,序列為5’-GGTCTCGCACTGCTCCAGGAAGG-3’,并設計靶位點長引物和gRNA接頭引物,靶位點長引物序列為5’-TaatacgactcactatagGGTCTCGCACTGCTCCAGGAAGG gttttagagctagaaatagc-3’;gRNA接頭引物序列為5’-AGCACCGACTCGGTGCCACTT-3’;
S2、primer star PCR獲得gRNA的體外轉錄模板:
S3、根據S2獲得的gRNA的體外轉錄模板進行體外轉錄,并提取純化,獲得純化的gRNA;
S4、將純化的gRNA和Cas9蛋白顯微注射至斑馬魚一細胞期的受精卵,培養獲得穩定遺傳prep純合突變斑馬魚品系,即肝臟再生缺陷斑馬魚模型。
2.根據權利要求1所述的應用,其特征在于, S2中,反應體系總體積50ul,體系如下:
gRNA cDNA1ul,靶位點長引物1ul,gRNA接頭引物1ul,dNTP Mix 4ul,5×Primer starbuffer 10ul,Primer star酶1ul,ddH2O 32ul。
3.根據權利要求2所述的應用,其特征在于, S2中,反應程序為:
98℃2min;重復35個循環以下步驟:98℃15s,58℃15s,72℃20s;72℃5min;72℃30min。
4.根據權利要求3所述的應用,其特征在于, S3中,反應體系為:
模板DNA10ul,10×RNA polymerase Reaction buffer2ul,25mM rNTP Mix 0.8ul,RNase Inhibitor 0.5ul,T7 RNA polymerase 2ul,RNase free H2O4.7 ul。
5.根據權利要求4所述的應用,其特征在于, S3中,反應程序為:
37℃,3小時。
6.根據權利要求5所述的應用,其特征在于,S4的培養具體包括以下步驟
S1、將顯微注射的受精卵培養孵化,Sanger測序檢測靶位點的有效性,篩選出有基因突變的,記作F0代,飼養至成魚;
S2、將F0代成魚與WT側交得到F1代;
S3、利用基因型鑒定的方法確定prep基因敲除的F1代突變體;
S4、從F1代突變體中挑選相同突變類型的F1代進行交配得到F2代;
S5、基因型鑒定F2代中prep基因敲除的純合子即為能穩定遺傳prep純合突變斑馬魚品系,即肝臟再生缺陷斑馬魚模型。
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