[發(fā)明專利]評(píng)估女性惡性腫瘤風(fēng)險(xiǎn)的突變基因群、文庫(kù)及試劑盒

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• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010572421.7
• 申請(qǐng)日: 2020-06-22
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN111635942A
• 公開(kāi)（公告）日: 2020-09-08
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 徐盈;楊紅;張建芳;李佳;郭芬芬;宋婷婷;黎昱;李春艷;鄭嬌
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中國(guó)人民解放軍空軍軍醫(yī)大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/6886
• 分類號(hào): C12Q1/6886;C12Q1/6858;C40B40/06;C40B50/06
• 代理公司: 成都九鼎天元知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 51214
• 代理人: 韓雪

本發(fā)明公開(kāi)了評(píng)估女性惡性腫瘤風(fēng)險(xiǎn)的突變基因群、文庫(kù)及試劑盒，屬于生物醫(yī)學(xué)分子檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明的一組評(píng)估女性惡性腫瘤風(fēng)險(xiǎn)的突變基因群，包括ATM、BRCA1、BRCA2、BRIP1、CDH1、CHEK2、EPCAM、MLH1、MSH2、MSH6、NBN、NF1、PALB2、PMS2、PTEN、RAD51C、RAD51D、STK11、TP53、BARD1、MRE11A、MUTYH、RAD50、XRCC2和FANCC5共25個(gè)基因中的一種或幾種。本發(fā)明能對(duì)女性惡性腫瘤相關(guān)遺傳學(xué)標(biāo)識(shí)進(jìn)行廣泛的篩查和檢驗(yàn)，準(zhǔn)確率更高，為女性惡性腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測(cè)、預(yù)防和診斷提供依據(jù)。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于生物醫(yī)學(xué)分子檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及評(píng)估女性惡性腫瘤風(fēng)險(xiǎn)的突變基因群、文庫(kù)及試劑盒。

背景技術(shù)

乳腺癌是一種起源于乳腺上皮組織的惡性腫瘤，占女性腫瘤的四分之一，嚴(yán)重危害婦女的健康。近年來(lái)，隨著早期篩查的增加和治療方法的改善，乳腺癌的生存和預(yù)后得到了明顯改善，但總體情況仍不理想。根據(jù)統(tǒng)計(jì)，2012年全世界大約有170萬(wàn)例乳腺癌新病例和52萬(wàn)例與乳腺癌相關(guān)的死亡，到2018年，乳腺癌新病例數(shù)增加到210萬(wàn)例，死亡人數(shù)是大約630,000。隨著生活方式和生育模式的改變，乳腺癌的發(fā)病率和死亡率正不斷攀升，日益成為全球嚴(yán)重的健康負(fù)擔(dān)。卵巢癌也是女性生殖器官常見(jiàn)的惡性腫瘤之一，高居女性生殖惡性腫瘤死亡率首位。據(jù)統(tǒng)計(jì)，晚期卵巢癌患者的5年生存率僅為20％-30％，而早期卵巢癌5年生存率超過(guò)90％。已有的研究發(fā)現(xiàn)癌癥本質(zhì)上是一類遺傳物質(zhì)損傷導(dǎo)致的基因病疾病，多種癌癥都具有顯著的家族聚集性，其中有5％-10％的腫瘤具有明確的遺產(chǎn)性。ACOG發(fā)布了遺產(chǎn)性腫瘤篩查指南指出遺產(chǎn)性腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估是確認(rèn)患者和家屬是否可能發(fā)展為某些類型癌癥的關(guān)鍵。乳腺癌和卵巢癌的發(fā)生與家族遺傳史密切相關(guān)。研究顯示，當(dāng)女性有一個(gè)一級(jí)親屬(母親、女兒或姐妹)患有乳腺癌和卵巢癌時(shí)，其乳腺癌和卵巢癌的患病風(fēng)險(xiǎn)會(huì)比一般人群高1.75倍；當(dāng)有兩個(gè)或兩個(gè)以上一級(jí)親屬患有乳腺癌和卵巢癌時(shí)，其乳腺癌和卵巢癌的患病風(fēng)險(xiǎn)會(huì)比一般人群高2.5倍以上。因此，乳腺癌、卵巢癌在內(nèi)的遺產(chǎn)性癌癥綜合征的快速準(zhǔn)確的檢測(cè)及其風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估是目前國(guó)內(nèi)外研究的熱點(diǎn)。

臨床上對(duì)乳腺癌/卵巢癌檢測(cè)方法檢測(cè)主要包括X線診斷、超聲顯像檢查、細(xì)胞學(xué)及組織學(xué)診斷等，這些方法盡管已經(jīng)提高了乳腺癌/卵巢癌診斷率，但這些檢測(cè)方法針對(duì)性不強(qiáng)，檢出率低，不能早期診斷出癌癥最精確的臨床腫瘤檢查只能發(fā)現(xiàn)0.5cm以上的腫塊，腫塊發(fā)現(xiàn)時(shí)，往往已經(jīng)錯(cuò)失最佳治療時(shí)機(jī)。另外，一些基因水平的檢測(cè)手段如熒光原位雜交(FISH)、實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-time PCR)、基因芯片和Sanger測(cè)序等被用于乳腺癌/卵巢癌分子學(xué)水平診斷。FISH檢測(cè)法能直接和準(zhǔn)確的判斷靶基因是否存在擴(kuò)增，但是檢測(cè)過(guò)程繁瑣、價(jià)格昂貴；基因芯片技術(shù)可檢測(cè)人數(shù)多，位點(diǎn)多，時(shí)間短，但是僅用于已公布的基因位點(diǎn)，價(jià)格高；Real-time PCR法檢測(cè)靈敏，但對(duì)實(shí)驗(yàn)體系要求較高，結(jié)果的重復(fù)性較差。隨著越來(lái)越多與女性惡性腫瘤相關(guān)的易感基因被鑒定，現(xiàn)有的檢測(cè)方法均無(wú)法滿足女性惡性腫瘤早篩查，早診斷，早治療的臨床需求。

因此，提供一組基因群，有助于女性惡性腫瘤的篩查、診斷，成為了本領(lǐng)域技術(shù)人員亟待解決的問(wèn)題。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的之一在于，提供一組評(píng)估女性惡性腫瘤風(fēng)險(xiǎn)的突變基因群，有助于有助于女性惡性腫瘤的篩查、診斷及治療。

本發(fā)明的目的之二在于，提供一種基于高能量測(cè)序檢測(cè)女性惡性腫瘤的DNA文庫(kù)。

本發(fā)明的目的之三在于，提供該DNA文庫(kù)的構(gòu)建方法。

本發(fā)明的目的之四在于，提供該DNA文庫(kù)的應(yīng)用。

本發(fā)明的目的之五在于，提供一種評(píng)估女性惡性腫瘤風(fēng)險(xiǎn)的試劑盒。

為實(shí)現(xiàn)上述目的，本發(fā)明采用的技術(shù)方案如下：