[發(fā)明專利]一種腫瘤生物標(biāo)志物及其應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010564875.X
• 申請(qǐng)日: 2020-06-19
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN111733240B
• 公開(kāi)（公告）日: 2021-05-07
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 茍啟桁;謝鈺鑫;陳念永
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 四川大學(xué)華西醫(yī)院
• 主分類號(hào): C12Q1/6886
• 分類號(hào): C12Q1/6886
• 代理公司: 成都科海專利事務(wù)有限責(zé)任公司 51202
• 代理人: 李俊

本發(fā)明提供了一種腫瘤生物標(biāo)志物及其應(yīng)用，涉及生物標(biāo)志物技術(shù)領(lǐng)域。所述腫瘤生物標(biāo)志物為環(huán)狀RNA，所述環(huán)狀RNA的堿基序列選自SEQ ID NO.1中所示的序列。本發(fā)明的SEQ ID NO.1所示序列的環(huán)狀RNA與鼻咽癌或頭頸部腫瘤相關(guān)，可作為RARS?MAD1L1融合基因的判斷標(biāo)志，該環(huán)狀RNA在血液及其相關(guān)樣本中能夠穩(wěn)定、恒定的存在，具有高度特異性和有效性，可作為鼻咽癌和頭頸部腫瘤等頭頸部腫瘤檢測(cè)的有效生物標(biāo)志物。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物標(biāo)志物技術(shù)領(lǐng)域，尤其是涉及一種腫瘤生物標(biāo)志物及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma,NPC)起源于鼻咽上皮細(xì)胞，在東南亞、北非、中東等地區(qū)最為常見(jiàn)。其中，超過(guò)70％的患者由于癥狀隱匿及高侵襲性首次確診即為局部晚期。雖然鼻咽癌對(duì)放化療敏感，但局部復(fù)發(fā)和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移仍是鼻咽癌治療失敗的主要原因。近年來(lái)，針對(duì)腫瘤分子機(jī)制的研究取得了令人滿意的效果。然而，針對(duì)鼻咽癌分子分型的研究并不深入，發(fā)現(xiàn)新的腫瘤標(biāo)志和治療靶點(diǎn)對(duì)鼻咽癌的治療及預(yù)防復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移是至關(guān)重要的。

基因融合是由兩個(gè)或多個(gè)基因的編碼區(qū)首尾相連，置于同一套調(diào)控序列(包括啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、核糖體結(jié)合序列、終止子等)控制之下，構(gòu)成的嵌合基因。腫瘤特異的融合基因是理想的分子診斷標(biāo)志和治療靶標(biāo)，如BCR-ABL存在于大多數(shù)慢性粒細(xì)胞白血病中并可使用伊馬替尼靶向治療；EML4-ALK基因融合非小細(xì)胞肺癌的克唑替尼靶向治療等。近來(lái)發(fā)現(xiàn)染色體重排產(chǎn)生的融合基因不僅在血液腫瘤及軟組織肉瘤發(fā)生中起關(guān)鍵作用，而在部分上皮性癌中也可能起驅(qū)動(dòng)作用。2018年，曾木圣等人在鼻咽癌中首次發(fā)現(xiàn)Chr5q34上的精氨酰-tRNA合成酶(RARS)基因正鏈的第1-7號(hào)外顯子與Chr7p22.3上的有絲分裂停滯缺陷1-樣蛋白1(MAD1L1)基因的負(fù)鏈第19號(hào)外顯子的染色體間融合，融合位點(diǎn)主要發(fā)生在RARS基因的7號(hào)外顯子和MAD1L1的19號(hào)外顯子。通過(guò)臨床標(biāo)本的檢測(cè)，明確了10.03％(35/349)鼻咽癌和10.7％(9/84)頭頸腫瘤的檢測(cè)率，同時(shí)發(fā)現(xiàn)了在DNA水平的斷裂位點(diǎn)和蛋白水平的表達(dá)。RARS-MAD1L1融合基因能夠增強(qiáng)鼻咽癌的增殖、克隆形成能力和干細(xì)胞標(biāo)志物的表達(dá)，增加側(cè)群細(xì)胞比例以及放化療的抵抗，并加劇誘導(dǎo)基因組不穩(wěn)定性，RARS-MAD1L1與AIMP2相互作用，激活FUBP1/c-Myc通路，且RARS-MAD1L1陽(yáng)性的鼻咽癌及頭頸腫瘤標(biāo)本中c-Myc和ABCG2表達(dá)水平更高，因此明確了RARS-MAD1L1融合基因可作為一個(gè)新的腫瘤標(biāo)志物，為鼻咽癌的靶向治療提供了潛在新靶標(biāo)。

本申請(qǐng)人發(fā)現(xiàn)現(xiàn)有技術(shù)至少存在以下技術(shù)問(wèn)題：然后目前已知檢測(cè)RARS-MAD1L1融合基因的方案是通過(guò)FISH技術(shù)，但是該檢測(cè)技術(shù)存在以下問(wèn)題：1、檢測(cè)相對(duì)復(fù)雜，對(duì)人員、設(shè)備、檢測(cè)過(guò)程、結(jié)果判讀要求較高，存在主客觀因素偏倚；2、存在假陽(yáng)性的可能性；3、陽(yáng)性閾值的選擇對(duì)檢測(cè)的敏感性及特異性也會(huì)產(chǎn)生影響。研究報(bào)道，當(dāng)參考值設(shè)定為≥10％時(shí)，特異性只有23％，這種較低的特異性可能與＜2個(gè)信號(hào)距離的標(biāo)準(zhǔn)設(shè)定有關(guān)，當(dāng)參考值提高到20％時(shí)，特異性上升至66％，而敏感性卻只有64％。更重要的是，RARS-MAD1L1融合基因未能從鼻咽癌及頭頸腫瘤患者的外周血中檢測(cè)出，目前只能通過(guò)患者組織FISH檢測(cè)才能明確患者具備RARS-MAD1L1融合基因，這對(duì)于鼻咽癌患者治療及預(yù)后的判斷增加了難度。