[發明專利]一種基于超高效液相色譜串聯高分辨質譜的細胞脂質組學分析方法在審
| 申請號: | 202010556568.7 | 申請日: | 2020-06-17 |
| 公開(公告)號: | CN111679026A | 公開(公告)日: | 2020-09-18 |
| 發明(設計)人: | 邱靜;王昕璐;賈琪;錢永忠 | 申請(專利權)人: | 中國農業科學院農業質量標準與檢測技術研究所 |
| 主分類號: | G01N30/88 | 分類號: | G01N30/88 |
| 代理公司: | 北京超凡宏宇專利代理事務所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 王煥 |
| 地址: | 100000 北*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 高效 色譜 串聯 分辨 細胞 脂質組學 分析 方法 | ||
1.一種基于超高效液相色譜串聯高分辨質譜的細胞脂質組學分析方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)將細胞用PBS調整密度至5×105細胞/mL以上,進行超聲破碎,得到細胞懸液;將所述細胞懸液用甲醇-二氯甲烷溶液提取兩次,合并提取后的有機相,并用氮氣吹干,用復溶溶液復溶,通過濾膜后獲得待測樣品;
(2)將所述待測樣品通過超高效液相色譜-四極桿-靜電場軌道阱傅里葉轉換質譜進行分離和測定;
(3)利用Thermo Fisher Scientific Q-Exactive Plus System Xcalibur軟件和脂質化合物分析軟件Lipidsearch,結合母離子、二級碎片離子信息、保留時間信息與數據庫進行匹配,鑒定細胞中的脂質化合物;
(4)利用QI軟件分析不同種類細胞中脂質化合物的差異;
所述方法不使用標準品。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(1)中,所述甲醇-二氯甲烷溶液的體積比為1.5-3:0.8-1,優選地,所述甲醇-二氯甲烷溶液的體積比為2:1。
3.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(1)中,復溶溶液選自甲醇或乙腈,優選甲醇;所述復溶溶液的體積為0.4-0.8mL,優選為0.5mL。
4.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(1)中,所述濾膜為希波氏0.2μm PTFE濾膜。
5.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,在步驟(2)后,通過軟件Thermo XcaliburQual Browser確定數據采集情況。
6.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述超高效液相色譜利用流動相A和流動相B進行梯度洗脫;
所述流動相A包括:乙腈和水、甲酸以及甲酸銨;
所述流動相B包括:乙腈和異丙醇、甲酸以及甲酸銨;
優選地,所述流動相A為體積比6:4的乙腈:水+0.1v/v%甲酸+10mM甲酸銨溶液;
所述流動相B為體積比1:9的乙腈:異丙醇+0.1v/v%甲酸+10mM甲酸銨溶液。
7.根據權利要求6所述的方法,其特征在于,所述梯度洗脫的程序為:
0~1.5min時,流動相B 40v/v%;
1.5~5min時,流動相B 40v/v%升至85v/v%;
5~14min時,流動相B 85v/v%升至97v/v%;
14~16min時,流動相B 97v/v%;
16~16.5min時,流動相B 97v/v%升至40v/v%;
16.5~21min時,流動相B 40v/v%。
8.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述超高效液相色譜采用C18色譜柱進行,優選地采用Waters X-bridge C18色譜柱;更優選地,所述色譜柱長度為100mm,內徑為2.1mm,填料粒徑為3.5μm。
9.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述質譜的條件選自a~d中的至少一個:
a.加熱電噴霧離子源,分別采用正、負模式采集;正、負離子模式下的電壓均為4.00KV;
b.離子傳輸管溫度為320℃;
c.鞘氣壓力分別為40psi和30psi,輔助氣壓力均為10arb,輔助氣加熱溫度均為300℃;
d.掃描模式為Full MS,儀器分辨率設置為70,000,-dd/MS2,分辨率17,500,NCE 30eV,掃描范圍200-1500m/z;
其中上述條件a~c中涉及的各個數值參數的浮動范圍為該數值參數±10%。
10.權利要求1-9中任一項所述的方法在不同細胞類型的脂質組學分析方面的應用。
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