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[發(fā)明專利]基于彌散張量成像的大腦張量模板構(gòu)建方法有效

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 202010542976.7 申請日: 2020-06-15
公開(公告)號: CN111738999B 公開(公告)日: 2022-04-19
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 劉繼欣;李睿梟;薛倩雯;穆俊婭 申請(專利權(quán))人: 西安電子科技大學(xué)
主分類號: G06T7/00 分類號: G06T7/00;G06T7/33;G06T5/00;G06T5/50
代理公司: 陜西電子工業(yè)專利中心 61205 代理人: 陳宏社;王品華
地址: 710071*** 國省代碼: 陜西;61
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 基于 彌散 張量 成像 大腦 模板 構(gòu)建 方法
【權(quán)利要求書】:

1.一種基于彌散張量成像的大腦張量模板構(gòu)建方法,其特征在于,包括如下步驟:

(1)對采集的多個(gè)被試個(gè)體的彌散張量圖像進(jìn)行預(yù)處理:

(1a)利用核磁共振采集M個(gè)被試個(gè)體的維度為4D的大腦矢狀位的彌散張量圖像,得到彌散張量圖像集DTI,DTI={DTI1,DTI2,...,DTIi,...,DTIM},其中DTIi表示第i個(gè)被試個(gè)體的大小為I×J×K×(n+m)的彌散張量圖像,包括n個(gè)大小為I×J×K維度為3D的未施加敏感梯度方向的圖像B0,以及m個(gè)大小為I×J×K維度為3D的施加敏感梯度脈沖方向的擴(kuò)散加權(quán)圖像DWI,DTIi={B01,B02,...,B0l,...,B0n;DWI1,DWI2,...,DWIk,...,DWIm},M≥1,I和J分別表示每幅二維圖像的長度和寬度,I≥1,J≥1,K表示采集層數(shù),K≥1,n≥1,m≥6,B0l表示第l個(gè)未施加敏感梯度方向的圖像,DWIk表示第k個(gè)施加敏感梯度脈沖方向的擴(kuò)散加權(quán)圖像;

(1b)利用圖像處理軟件對每個(gè)DTIi進(jìn)行去腦殼處理,并對每個(gè)去腦殼處理的圖像進(jìn)行渦流矯正后再進(jìn)行頭動(dòng)矯正,得到預(yù)處理后的彌散張量圖像集DTI′,DTI′={DTI1′,DTI2′,...,DTIi′,...,DTIM′},其中DTIi′表示DTIi的預(yù)處理彌散張量圖像;

(2)獲取未施加敏感梯度方向的平均圖像集:

計(jì)算DTIi′中n個(gè)未施加敏感梯度方向的圖像B0對應(yīng)位置體素灰度值的平均值,得到未施加敏感梯度方向的平均圖像集B0′,B0′={B0′1,B0′2,...,B0′i,...,B0′M},其中B0i′表示DTIi′對應(yīng)的大小為I×J×K的平均圖像;

(3)獲取張量圖像集和FA圖像集:

(3a)利用B0i′和DTIi′中的m個(gè)施加敏感梯度脈沖方向的擴(kuò)散加權(quán)圖像DWI,計(jì)算DTIi′中每個(gè)體素v的二階張量Dv,v∈{v1,v2,...,vs,...,vI×J×K},其中vs表示大小為I×J×K的圖像中的第s個(gè)體素;

(3b)將DTIi′中所有體素上的二階張量組合成格式為NIFTI的大小為I×J×K×6的4D張量圖像子集DTi,并將所有張量圖像子集組合成DTI′對應(yīng)的大小為I×J×K×6×M的5D張量圖像集DT,DT={DT1,DT2,...,DTi,...,DTM},其中DTi表示DTIi′對應(yīng)的張量圖像子集,DTi={tensor1,tensor2,...,tensorj,...,tensor6},tensorj表示所有體素上的二階張量中第j個(gè)元素組成的大小為I×J×K的張量圖像;

(3c)通過每個(gè)體素v的二階張量Dv,計(jì)算DTIi′中每個(gè)體素v的各向異性分?jǐn)?shù)FA*值,并將所有體素的FA*值組合成格式為NIFTI的大小為I×J×K的FAi圖像,則DTI′的FA圖像表示為FA={FA1,FA2,...,FAi,...,FAM};

(4)確定標(biāo)準(zhǔn)模板:

將腦成像國際聯(lián)盟ICBM模板作為標(biāo)準(zhǔn)模板,并讀取該標(biāo)準(zhǔn)模板的NIFTI格式的大小為I′×J′×K′的FA圖像和大小為I′×J′×K′的0、1二值掩模mask圖像,其中I′表示標(biāo)準(zhǔn)模板2D圖像的長度,I′≥1,J′表示標(biāo)準(zhǔn)模板2D圖像的寬度,J′≥1,K′表示標(biāo)準(zhǔn)模板的層數(shù),K′≥1;

(5)對個(gè)體FA圖像進(jìn)行迭代配準(zhǔn):

(5a)設(shè)迭代次數(shù)為t,最大迭代次數(shù)為T,T≥1,配準(zhǔn)目標(biāo)模板為It,并令t=1,令I(lǐng)t為標(biāo)準(zhǔn)模板的NIFTI格式的FA圖像;

(5b)將每個(gè)FAi圖像與It進(jìn)行線性配準(zhǔn),并將每個(gè)線性配準(zhǔn)結(jié)果與It進(jìn)行非線性配準(zhǔn),得到非線性配準(zhǔn)圖像集A,A={A1,A2,...,Ai,...,AM},其中Ai表示第i個(gè)大小為I′×J′×K′的非線性配準(zhǔn)圖像;

(5c)計(jì)算非線性配準(zhǔn)圖像集A中所有非線性配準(zhǔn)圖像對應(yīng)位置體素的灰度值的平均值,得到大小為I′×J′×K′的平均圖像B,并將B中每個(gè)體素的灰度值與mask圖像對應(yīng)位置體素的灰度值相乘,得到大小為I′×J′×K′的中間FA模板C;

(5d)判斷t=T是否成立,若是,則C為最終的FA模板,否則,令t=t+1,It=C,并執(zhí)行步驟(5b);

(6)獲取每個(gè)FAi圖像與FA模板的非線性配準(zhǔn)參數(shù):

將每個(gè)大小為I×J×K的FAi圖像與大小為I′×J′×K′的FA模板進(jìn)行線性配準(zhǔn),并將每個(gè)線性配準(zhǔn)結(jié)果與FA模板進(jìn)行非線性配準(zhǔn),得到非線性配準(zhǔn)參數(shù)集warp,warp={warp1,warp2,...,warpi,...,warpM},其中warpi表示FAi與FA模板的非線性配準(zhǔn)參數(shù);

(7)獲取標(biāo)準(zhǔn)空間下的平均圖像集B0′和張量圖像集DT:

利用warpi對B0i′進(jìn)行轉(zhuǎn)換,得到標(biāo)準(zhǔn)空間下的平均圖像集B0″,B0″={B01″,B02″,...,B0i″,...,B0M″},同時(shí)利用warpi對DTi進(jìn)行轉(zhuǎn)換,并對轉(zhuǎn)換后的DTi進(jìn)行張量重定向,得到標(biāo)準(zhǔn)空間下的張量圖像集DT′,DT′={DT1′,DT2′,...,DTi′,...,DTM′},其中B0i″表示B0i′標(biāo)準(zhǔn)空間下的大小為I′×J′×K′的平均圖像,DTi′表示DTi′標(biāo)準(zhǔn)空間下的大小為I′×J′×K′×6的4D張量圖像集;

(8)獲取平均圖像meanB0和平均張量圖像集meanDT:

(8a)將標(biāo)準(zhǔn)空間下的平均圖像集B0″中所有圖像對應(yīng)位置體素的灰度值進(jìn)行平均,得到大小為I′×J′×K′的平均圖像meanB0;

(8b)將標(biāo)準(zhǔn)空間下的張量圖像集DT′中所有tensorj圖像對應(yīng)位置體素的灰度值進(jìn)行平均,得到平均張量圖像集meanDT,其中meanDT={tensor1′,tensor2′,...,tensorj′,...,tensor6′},tensorj′表示所有DTi′的第j個(gè)張量圖像進(jìn)行平均得到的大小為I′×J′×K′的平均張量圖像;

(9)獲取大腦張量模板:

利用平均圖像meanB0中每個(gè)體素v′的灰度值和平均張量圖像集meanDT中每個(gè)體素v′的灰度值計(jì)算擴(kuò)散加權(quán)圖像上每個(gè)體素v′的灰度值,將所有體素上的灰度值組成擴(kuò)散加權(quán)圖像集DWI′,DWI′={DWI1′,DWI2′,...,DWIq′,...,DWIm′},并對平均圖像meanB0和擴(kuò)散加權(quán)圖像集DWI′由上到下進(jìn)行組合,得到大小為I′×J′×K′×(m+1)的4D大腦張量模板DTI′,DTI′={meanB0;DWI1′,DWI2′,...,DWIq′,...,DWIm′}其中DWIq′表示由meanB0和meanDT計(jì)算得到的第q個(gè)大小為I′×J′×K′的擴(kuò)散加權(quán)圖像,v′∈{v′1,v′2,...,v′p,...,v′I′×J′×K′},其中v′p表示大小為I′×J′×K′的圖像中的第p個(gè)體素。

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1、專利原文基于中國國家知識產(chǎn)權(quán)局專利說明書;

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