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[發(fā)明專利]一種基于深度學習的計算新冠肺炎病變區(qū)域占比的方法在審

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 202010531416.1 申請日: 2020-06-11
公開(公告)號: CN111738997A 公開(公告)日: 2020-10-02
發(fā)明(設(shè)計)人: 梁廷波;盛吉芳;吳煒 申請(專利權(quán))人: 浙江大學
主分類號: G06T7/00 分類號: G06T7/00;G06T7/136;G06T7/187;G06T7/62
代理公司: 北京盛凡智榮知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11616 代理人: 鄭豐平
地址: 310012 浙江*** 國省代碼: 浙江;33
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 一種 基于 深度 學習 計算 肺炎 病變 區(qū)域 方法
【權(quán)利要求書】:

1.一種基于深度學習的計算新冠肺炎病變區(qū)域占比的方法,其特征在于,包括以下步驟:

對原始CT圖像集進行歸一化處理,以適應深度學習模型的數(shù)據(jù)輸入;

將訓練集中CT圖像數(shù)據(jù)分別輸入到2DUnet和2.5DUnet兩種網(wǎng)絡(luò)學習模型中,預測出肺部病變區(qū)域的二值掩模和肺部整個區(qū)域的二值掩模;

計算訓練集預測的二值掩模與真實標簽掩模之間的相似性,選取最優(yōu)網(wǎng)絡(luò)學習模型;

使用最優(yōu)網(wǎng)絡(luò)學習模型對訓練集中的CT圖像進行肺部病變區(qū)域掩模和肺部整個區(qū)域掩模的預測,并計算出病變區(qū)域掩模和整個區(qū)域掩模之間的占比。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于深度學習計算新冠肺炎體積占比的方法,其特征在于,所述原始CT圖像處理方法包括:

a、將原始CT圖像的Hu值轉(zhuǎn)換到[-1200,600]的區(qū)間;

b、對于小于-1200和大于600的Hu值則分別設(shè)置為-1200和600;

c、將上述區(qū)間的Hu值矩陣歸一化到[0,255],以適應深度學習模型數(shù)據(jù)的輸入。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于深度學習計算新冠肺炎體積占比的方法,其特征在于,所述網(wǎng)絡(luò)學習模型采用的真實標簽掩模包括病變區(qū)域標簽掩模和全部區(qū)域標簽掩模,其中:

使用-750和-200兩個閾值進行肺部分割,將-200得到的掩模減去-750得到的掩模,最終的掩模作為病變區(qū)域標簽掩模;

人工對肺部整個區(qū)域進行標注,作為全部區(qū)域標簽掩模。

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于深度學習計算新冠肺炎體積占比的方法,其特征在于,所述網(wǎng)絡(luò)學習模型預測的肺部病變區(qū)域二值掩模為濾除正常軟組織的二值掩模,濾除方法包括:

通過連通域?qū)⑸傻亩笛谀7譃椴煌膮^(qū)塊,再利用基于resnet18的二分類模型判斷每個區(qū)塊掩模包含的病變區(qū)域掩模和正常軟組織掩模,最后將正常軟組織掩模濾除。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于深度學習計算新冠肺炎體積占比的方法,其特征在于,所述二值掩模與真實標簽掩模之間的相似性采用Dice系數(shù)進行計算,用來選取相似性最高的網(wǎng)絡(luò)學習模型,Dice系數(shù)計算公式如下:

其中,A代表使用網(wǎng)絡(luò)學習模型預測出來的二值掩模,B為真實標簽掩模。

6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于深度學習計算新冠肺炎體積占比的方法,其特征在于,所述病變區(qū)域掩模和整個區(qū)域掩模之間的占比PoIR計算公式如下:

其中volume of infected regions代表預測的肺部病變區(qū)域二值掩模,volume ofintact lung代表預測的整個肺部區(qū)域的二值掩模。

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