[發(fā)明專利]一種不同剩余采食量對(duì)蛋鴨腸道微生物組成、功能差異分析方法

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010467334.5
• 申請(qǐng)日: 2020-05-28
• 公開（公告）號(hào): CN111549108B
• 公開（公告）日: 2023-08-04
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 田勇;楊華;李國(guó)勤;白天;趙阿勇;曾濤;李肖梁;盧立志;沈軍達(dá);陳黎;沐建煜;屠炳江;李浙烽;呂見濤;陶爭(zhēng)榮;徐堅(jiān)
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院
• 主分類號(hào): C12Q1/6869
• 分類號(hào): C12Q1/6869
• 代理公司: 北京睿智保誠(chéng)專利代理事務(wù)所(普通合伙) 11732
• 代理人: 周新楣

本發(fā)明公開了一種不同剩余采食量對(duì)蛋鴨腸道微生物組成、功能差異分析方法，屬于微生物技術(shù)領(lǐng)域，該方法通過比較不同剩余采食量個(gè)體之間盲腸菌群，找出候選的差異菌群，為以后提高蛋鴨養(yǎng)殖經(jīng)濟(jì)效益提供一些思路。本發(fā)明的分析結(jié)果證明盲腸腸道菌群的豐度和多樣性與剩余采食量相關(guān)。在不同剩余采食量的紹興鴨群體中，Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)以及Simpson指數(shù)都有顯著差異，在β多樣性指數(shù)中，根據(jù)T檢驗(yàn)結(jié)果在屬水平篩選出18個(gè)顯著差異菌群，其中LRFI組有17個(gè)菌群顯著高于HRFI組，且大多數(shù)為降解碳水化合物以及產(chǎn)生丁酸鹽和丙酸鹽的菌群，從營(yíng)養(yǎng)的角度來看，提高了飼糧的利用效率并且能量轉(zhuǎn)化也相對(duì)提高。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于微生物技術(shù)領(lǐng)域，具體地說，涉及一種不同剩余采食量對(duì)蛋鴨腸道微生物組成、功能差異分析方法。

背景技術(shù)

目前，腸道微生物在動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)中的作用受到越來越多的關(guān)注，益生菌、酶制劑等被添加進(jìn)動(dòng)物飼料中，探究腸道微生物消化吸收、能量代謝中的作用。益生菌和酶制劑有利于腸道益生菌的增殖，抗生素則用來治療細(xì)菌感染，畜牧生產(chǎn)過程中存在抗生素等藥物濫用的問題，導(dǎo)致耐藥細(xì)菌的出現(xiàn)，同之前能夠殺滅細(xì)菌的藥物的治療效果明顯降低，甚至可能沒有效果，超級(jí)細(xì)菌會(huì)給畜禽和人類的健康帶來更大的威脅，，可能會(huì)導(dǎo)致不可控的后果^[79-81]。因此減少抗生素在動(dòng)物飼料中的使用已成為改善牲畜健康的一個(gè)非常重要的措施，在減抗和無抗的研究過程中，人們發(fā)現(xiàn)機(jī)體內(nèi)的微生物協(xié)同機(jī)體免疫保衛(wèi)機(jī)體健康因此腸道微生物的研究越來越受關(guān)注。動(dòng)物生產(chǎn)性能的縱向挖掘進(jìn)程緩慢，因此學(xué)者們想在橫向上有所突破，研究腸道微生物和生產(chǎn)性能的關(guān)系，進(jìn)而通過改變腸道微生物提高生產(chǎn)性能。

腸道菌群是宿主代謝(如葡萄糖處理)的既定調(diào)節(jié)因子。盡管公眾都承認(rèn)腸道菌群會(huì)對(duì)宿主葡萄糖穩(wěn)態(tài)產(chǎn)生影響，但其潛在機(jī)制尚不清楚。腸道微生物群也是腸道衍生血清素合成的有效中介，而這種血清素的外周來源本身就是葡萄糖穩(wěn)態(tài)的調(diào)節(jié)器。Martin?AM通過藥物抑制和改變基因抑制內(nèi)臟來源的血清素合成，發(fā)現(xiàn)由抗生素引起的微生物區(qū)系組成變化所引起的宿主葡萄糖處理的改善依賴于外周血清素的合成。胃腸道微生物群對(duì)動(dòng)物的整體健康和生產(chǎn)性能有重要的影響，這推動(dòng)了學(xué)者對(duì)胃腸道微生物群組成、影響微生物組成的因素、以及微生物群對(duì)健康、生長(zhǎng)性能和宿主行為的影響的深入研究，養(yǎng)豬生產(chǎn)研究主要集中在評(píng)估飼料添加劑和飲食調(diào)整來選擇性改變胃腸道微生物從而提高健康水平和飼料轉(zhuǎn)換效率。糞便微生物群移植(FMT)作為一種可能的通過操縱胃腸道微生物群來改善豬的預(yù)后的工具，這是一個(gè)新型的研究方向，這個(gè)治療手段存在一定的局限，首先就是內(nèi)在生物安全性和監(jiān)管問題，因?yàn)楣w不被需要的的微生物群永遠(yuǎn)不可能被完全篩除。然而，考慮到FMT在人類疾病治療方面的成功，這種策略在豬生產(chǎn)中的應(yīng)用也值得研究。此外，F(xiàn)MT有利于對(duì)特定結(jié)果產(chǎn)生至關(guān)重要的特定菌群的鑒定，從而開發(fā)出可用于靶向治療的克隆體庫(kù)。Zhang?Y等研究飼糧中添加糞腸球菌(Enterococcus?faecalis)對(duì)蛋雞產(chǎn)蛋、產(chǎn)蛋質(zhì)量和盲腸菌群的影響，結(jié)果發(fā)現(xiàn)添加糞腸球菌不會(huì)對(duì)雞產(chǎn)蛋率、蛋品質(zhì)造成影響，但可以顯著提高飼料轉(zhuǎn)化率，并且顯著影響腸道菌群的結(jié)構(gòu)，添加糞球菌組疣微菌門(Verrucomicrobia)和藍(lán)藻菌門(Cyanobacteria)的相對(duì)豐度顯著提高,糞桿菌屬(Faecalibacterium)、克里斯滕森菌屬(Christensenellaceae)、瘤胃球菌P屬(Coprostanoligenes)相對(duì)豐度顯著提高。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于提出了一種不同剩余采食量對(duì)蛋鴨腸道微生物組成、功能差異分析方法，該方法通過比較不同剩余采食量個(gè)體之間盲腸菌群，找出候選的差異菌群，為以后提高蛋鴨養(yǎng)殖經(jīng)濟(jì)效益提供一些思路。

其技術(shù)方案如下：

一種不同剩余采食量對(duì)蛋鴨腸道微生物組成、功能差異分析方法，包括以下步驟：

步驟1、腸道內(nèi)容物細(xì)菌總DNA提取

1).將不同組別的內(nèi)容物樣本放入2ml離心管中。