[發(fā)明專利]用于檢測自閉癥基因組拷貝數(shù)變異的引物組、探針組及試劑盒

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202010432955.X
• 申請日: 2020-05-22
• 公開（公告）號: CN111575366A
• 公開（公告）日: 2020-08-25
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 廖生赟
• 申請（專利權(quán)）人: 深圳市億立方生物技術(shù)有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

本發(fā)明公開了一種用于檢測自閉癥患者基因組變異的引物組、探針組及試劑盒，通過引物組SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8和探針SEQ ID NO.9~SEQ ID NO.12可以檢測自閉癥相關(guān)的SHANK3、CHRNA7、GABRB3基因拷貝數(shù)的變異。本發(fā)明具有靈敏度高，檢測時(shí)間短，成本低廉的特點(diǎn)。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉遺傳病檢測領(lǐng)域，特別涉及用于檢測自閉癥患者相關(guān)基因拷貝數(shù)變異的引物組、探針組及試劑盒。

背景技術(shù)

自閉癥又稱孤獨(dú)癥（autism）是常見神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育失調(diào)導(dǎo)致的廣泛性發(fā)育障礙，是復(fù)雜的遺傳性多基因神經(jīng)精神紊亂疾病。1943年，美國醫(yī)生Kanner報(bào)道了11例行為異常的患者，并命名為“早期嬰兒孤獨(dú)癥”，認(rèn)為是兒童精神分裂癥的一個(gè)亞型。經(jīng)歷了七十多年的研究，學(xué)術(shù)界和臨床醫(yī)生對自閉癥的定義和認(rèn)識已經(jīng)發(fā)生了較大變化，對自閉癥的認(rèn)識已經(jīng)從最初的看成一種心理疾病轉(zhuǎn)變?yōu)榭醋饕环N生理疾病。而自閉癥囊括的范圍也逐漸增大，2013年美國精神障礙診斷與統(tǒng)計(jì)手冊（Diagnostic and Statistical Manual ofMental Disorders）第五版（簡稱DSM-Ⅴ），修訂了自閉癥的定義，統(tǒng)稱為自閉癥譜系障礙（Autism Spectrum Disorder，簡稱ASD）。

自閉癥的主要臨床行為表現(xiàn)包括人際交流障礙、語言障礙和重復(fù)性刻板行為，病人同時(shí)在智力、感覺和情緒等方面也有相應(yīng)的特征。患兒從出生開始就可以表現(xiàn)出與其他正常兒童不同的差異。自閉癥在兒童的發(fā)病率為1%～2%，男性是女性4倍，根據(jù)WHO統(tǒng)計(jì)，在中國有150萬-780萬的孤獨(dú)癥患者。患有自閉癥的兒童不僅身心健康受到損傷，且也給家庭帶來沉重的經(jīng)濟(jì)和精神壓力，因此自閉癥在我國已經(jīng)成為了一個(gè)急需關(guān)注的公共健康問題。

影響自閉癥發(fā)生的基因有許多。在調(diào)查分析自閉癥患者在基因組水平上的變異后，發(fā)現(xiàn)存在多種類型和多位點(diǎn)的變異，既有染色體區(qū)域的缺失重復(fù)，也有基因上的SNP。這些變異既有從父母遺傳的也有新發(fā)的。對變異的基因進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)變異主要發(fā)生在與突觸、染色質(zhì)重構(gòu)、轉(zhuǎn)錄、神經(jīng)遞質(zhì)傳遞有關(guān)的基因上。但單個(gè)基因在自閉癥群體中出現(xiàn)的概率不足1%。對神經(jīng)細(xì)胞連接因子基因進(jìn)行研究，發(fā)現(xiàn)SHANK1、SHANK2、SHANK3，NRXN1、NRXN2、NRXN3，NLGN3、NLGN4等基因都與自閉癥發(fā)生有關(guān)。

傳統(tǒng)的自閉癥篩查方法主要是根據(jù)自閉癥診斷標(biāo)準(zhǔn)，對待檢者進(jìn)行人際關(guān)系、語言交流、知覺等方面的表象觀察，并依照標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行確診。這些方法的不足之處是只能患者進(jìn)行初步的自閉癥篩查，無法對患者基因變異進(jìn)行確診，而且在診斷時(shí)容易發(fā)生漏診和誤診的情況，延誤患者治療，造成重癥自閉癥兒童的出現(xiàn)。因此，市場上迫切需要一種準(zhǔn)確、快捷、成本低廉的自閉癥診斷方法，對患者進(jìn)行快速確診。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的主要目的在于提出一種準(zhǔn)確、快速、靈敏的用于檢測自閉癥患者多基因拷貝數(shù)變異的引物組、探針組及試劑盒。

本發(fā)明的目的是針對現(xiàn)有技術(shù)中的不足，提供一種用于檢測自閉癥患者多基因拷貝數(shù)變異的引物組。

本發(fā)明的第二目的是，提供一種提供一種用于檢測自閉癥患者多基因拷貝數(shù)變異的探針組。

本發(fā)明的第三目的是，提供一種提供一種用于檢測自閉癥患者多基因拷貝數(shù)變異的試劑盒。

為實(shí)現(xiàn)上述目的，本發(fā)明采取的技術(shù)方案是：一種用于檢測自閉癥患者多基因拷貝數(shù)變異的PCR引物組，所述的引物組檢測的基因包括NRXN1、SHANK3和CHRNA7基因。

進(jìn)一步地，所述的引物組還包括檢測內(nèi)參基因RPP30的引物SEQ ID NO.7和SEQ IDNO.8。

為實(shí)現(xiàn)上述第二個(gè)目的，本發(fā)明采取的技術(shù)方案是：所述探針組包括SEQ ID NO.9~ SEQ ID NO.12，每一條探針兩端分別帶有熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)。