[發明專利]基于生物學網絡數據的藥物作用靶點篩選方法、裝置、電子設備及存儲介質

有效

• 申請號: 202010429918.3
• 申請日: 2020-05-20
• 公開（公告）號: CN111785333B
• 公開（公告）日: 2022-02-25
• 發明（設計）人: 王湘;趙洪磊;王瑩瑩;王麗麗;章慧潔
• 申請（專利權）人: 中國醫學科學院阜外醫院深圳醫院
• 主分類號: G16C20/50
• 分類號: G16C20/50;G16B5/00
• 代理公司: 深圳市瑞方達知識產權事務所(普通合伙) 44314
• 代理人: 張亞菊

本發明涉及基于生物學網絡數據的藥物作用靶點篩選方法、裝置、電子設備及存儲介質包括：得到復雜疾病對應的多種基礎疾病和/或癥狀并檢索獲取多個第一生物基因集合，進行并集運算以得到復雜疾病對應的第二生物基因集合；建立若干背景生物網絡數據集并根據第二生物基因集合獲取復雜疾病的第一生物網絡數據；基于預設藥物獲取對應的網絡數據所對應的名稱列表以獲取預設藥物的第三生物網絡數據；獲取第一、第三生物網絡數據的網絡節點的對應關系，并根據獲取的有向性生物網絡對第一、第三生物網絡數據的交集建立對應的復合網絡；獲取復合網絡中滿足條件的節點作為預設藥物的藥物作用靶點。實施本發明能夠提高藥物作用靶點確定的準確性。

技術領域

本發明涉及藥物作用靶點的篩選技術領域，更具體地說，涉及一種基于生物學網絡數據的藥物作用靶點篩選方法、裝置、電子設備及存儲介質。

背景技術

復雜疾病的相關藥物較多，且藥物的候選靶基因多而繁雜，故合理有效的縮小范圍是急需解決的重要問題。而從復雜疾病的發病機制作為切入點進行分析，則將起到事半功倍的效果。近年來多組學數據的大量涌現及分析技術的興起，為該領域的發展帶來了機遇與挑戰。其中，轉錄組學層面的分析是后續蛋白質組學分析、代謝組學分析、宏基因組學分析的起點與基礎，故在轉錄組學層面的有效分析，可以最大限度的減少后續分析的盲目性。而為實現這一目標，通過計算方法逐步縮小分析范圍，在此基礎上進行濕實驗的驗證，是目前最行之有效的方式。轉錄組學層面的數據類型、種類繁多，最常見的即為以生物學網絡為代表的多種在線公開數據及以第一、二、三代測序技術產生的數據為代表的高通量數據。

現有的基于蛋白質網絡的藥物靶標確定方法或者或者以基因為研究對象進行分析的方法大都基于復雜疾病的某一特征或藥物的某個分子通路進行作用靶點的篩選，結論過于片面。

發明內容

本發明要解決的技術問題在于，針對現有技術的上述部分技術缺陷，提供一種基于生物學網絡數據的藥物作用靶點篩選方法、裝置、電子設備及存儲介質。

本發明解決其技術問題所采用的技術方案是：構造一種基于生物學網絡數據的藥物作用靶點篩選方法，包括：

S1、基于某一復雜疾病進行初步篩選以得到其所對應的多種基礎疾病和/或癥狀，檢索第一數據庫以獲取與多種所述基礎疾病和/或癥狀分別對應的多個第一生物基因集合；

S2、將多個所述第一生物基因集合進行并集運算，以得到所述復雜疾病對應的第二生物基因集合；

S3、根據第二數據庫建立若干背景生物網絡數據集，并將所述第二生物基因集合作為輸入進行概率運算，以獲取輸出結果滿足預設閾值的背景生物網絡數據集作為所述復雜疾病對應的第一生物網絡數據；

S4、基于所述復雜疾病獲取對應的預設藥物名稱，并根據所述預設藥物名稱和所述基礎疾病和/或癥狀設定第一檢索關鍵詞，根據所述第一檢索關鍵詞檢索第三數據庫以獲取與所述預設藥物名稱和所述復雜疾病相對應的第二生物網絡數據所對應的名稱列表；

S5、將所述名稱列表作為第二檢索關鍵詞檢索所述第二數據庫以獲取與所述預設藥物名稱對應的第三生物網絡數據；

S6、將所述第一生物網絡數據和所述第三生物網絡數據通過第四數據庫映射，以獲取所述第一生物網絡數據和所述第三生物網絡數據的網絡節點的對應關系；

S7、將所述第二數據庫進行網絡有向性轉換以獲取對應的生物網絡，根據所述第一生物網絡數據和所述第三生物網絡數據的對應關系獲取所述第一生物網絡數據和所述第三生物網絡數據的交集，并根據所述生物網絡構建對應的復合網絡；

S8、獲取所述復合網絡的節點所對應的度，并獲取滿足第一預設條件的度所對應的第一節點，并將所述第一節點作為所述預設藥物名稱的藥物作用靶點；或/和