[發(fā)明專利]用于鼻咽癌篩查的方法和裝置在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010428924.7 | 申請日: | 2014-10-03 |
| 公開(公告)號: | CN111560418A | 公開(公告)日: | 2020-08-21 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | R·H·W·黃 | 申請(專利權(quán))人: | 世程發(fā)展公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6851 | 分類號: | C12Q1/6851;C12Q1/70;C12R1/01 |
| 代理公司: | 北京市鑄成律師事務(wù)所 11313 | 代理人: | 章凱;楊陽 |
| 地址: | 加拿大*** | 國省代碼: | 暫無信息 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 用于 鼻咽癌 方法 裝置 | ||
公開了用于鼻咽癌篩查的方法和裝置。所述方法包括提供來自于受試者的鼻咽樣品,從所述樣品分離DNA,使用實時PCR由所述DNA擴增并檢測至少一個EBV靶序列,其中小于或等于31.5的實時PCR循環(huán)閾值次數(shù)表明所述受試者有鼻咽癌或發(fā)展鼻咽癌的風險。用于獲得刷拭活檢樣品的裝置包括具有第一端和第二端的縱軸,其中至少兩個刷頭從所述軸的第二端延伸。
本申請為2014年10月3日提交的,發(fā)明名稱為“用于鼻咽癌篩查的方法和裝置”,申請?zhí)枮?014800574061的專利申請的分案申請。
相關(guān)申請案的交叉引用
本申請要求保護2013年10月4日提交的美國臨時申請第 61/886,807號的優(yōu)先權(quán)的權(quán)益,其內(nèi)容通過引用整體并入本文。
技術(shù)領(lǐng)域
本公開涉及用于篩查鼻咽癌的方法、組合物和裝置。
發(fā)明背景
鼻咽癌癥(NPC)是流行地區(qū)如太平洋和地中海沿岸國家及亞北極地區(qū)中年受試者高度流行的惡性腫瘤。NPC是中國南方因病死亡的主要原因。遺傳和環(huán)境因素促成腫瘤風險,并且在NPC流行區(qū)的高發(fā)病率和高人口密度使得NPC成為全球的常見癌癥。估計全球的高危人群為13-15億人。每年在北美約有500個新病例,在香港和臺灣有5000個病例并且全世界有100,000個病例(Ung1999)。NPC因為其與人γ皰疹病毒4、愛波斯坦-巴爾病毒(Epstein-Barr Virus)(EBV) 密切、接近絕對的關(guān)聯(lián),所以是不常見的癌癥,每個腫瘤細胞隱匿多個拷貝的在早期、侵襲前病變中已經(jīng)可檢測的相同病毒克隆 (Pathmanathan1995)。NPC出現(xiàn)在鼻后遠側(cè)空間,這里NPC可發(fā)展很少癥狀,并且在轉(zhuǎn)移組織中首次診出并不罕見,因此預(yù)后不良 (Skinner1990;Ho1998)。盡管在相關(guān)人口中發(fā)病率和意識越來越高,但是NPC的現(xiàn)實仍受后期診斷而控制,通常通過鼻咽鏡檢查,在早期檢測到的腫瘤預(yù)后良好(Liu1998)。
數(shù)十年來,EBV和NPC之間的密切關(guān)聯(lián)已經(jīng)吸引了為改進對 NPC風險的臨床診斷的嘗試。Raab-Traub(1987)證明所有組織學子集的NPC均含EBV DNA。雖然EBV血清學的大型調(diào)查描繪了顯著關(guān)聯(lián)(例如Zeng 1986),但是幾乎所有人類的泛在EBV載體狀態(tài)妨礙EBV血清學得到臨床應(yīng)用(Ho1998)。血清學高度靈敏但是缺乏特異性。
1992年首次證明了通過分子生物學手段檢測EBV基因組進行鼻后活檢的診斷希望(Feinmesser1992)。雖然生物樣品中EBV基因組的分子檢測已經(jīng)成為健全常規(guī)程序,但是從小型學術(shù)研究(Tune1999) 到常規(guī)流動式應(yīng)用的轉(zhuǎn)變因為缺乏專用、一次性活檢儀器并且需要快速、局部DNA分離以免DNA降解,所以很困難。兩者均提出挑戰(zhàn),尤其是在具有不同技術(shù)基礎(chǔ)設(shè)施水平的流行區(qū)。
發(fā)明概述
本發(fā)明人已經(jīng)開發(fā)了一種用于篩查鼻咽癌癥的高特異性和高靈敏度方法。
因此,本公開提供了一種在測試受試者中檢測NPC或發(fā)展NPC 的風險的方法,其包括(a)提供鼻咽樣品,(b)從所述樣品分離DNA 及(c)使用實時PCR由所述DNA擴增并檢測至少一個EBV靶序列,其中小于或等于31.5的實時PCR循環(huán)閾值次數(shù)表明所述測試受試者有鼻咽癌或發(fā)展鼻咽癌的風險。
在一個實施方案中,28至31.5的實時PCR循環(huán)閾值次數(shù)表明所述測試受試者有發(fā)展鼻咽癌的風險。
在另一個實施方案中,小于或等于28的實時PCR循環(huán)閾值次數(shù)表明所述測試受試者有鼻咽癌。
循環(huán)閾值(Ct)可用于計算愛波斯坦-巴爾病毒檢測水平(EDL)。具體而言,Ct值可用于通過使用以對照EBV樣品生成的標準曲線測定EBV拷貝數(shù)。EBV拷貝數(shù)的對數(shù)提供了EDL。表15展示了Ct值、 EBV拷貝和EDL之間的相關(guān)性。
在一個實施方案中,大于或等于2.7的EDL表明受試者患有NPC。
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