[發明專利]基于BagPix2Pix自學習模型的彎曲染色體圖像拉直方法、系統、存儲介質及裝置

在審

• 申請號: 202010360518.1
• 申請日: 2020-04-30
• 公開（公告）號: CN111612745A
• 公開（公告）日: 2020-09-01
• 發明（設計）人: 蘇炯龍;馬飛;孟佳;宋思凡;黃戴赟;時長軍;肖晟;楊春瀟
• 申請（專利權）人: 西交利物浦大學;蘇州精準醫療科技有限公司
• 主分類號: G06T7/00
• 分類號: G06T7/00;G06T7/12;G06T7/62;G06T5/00
• 代理公司: 南京艾普利德知識產權代理事務所(特殊普通合伙) 32297
• 代理人: 陸明耀;顧祥安

1.基于BagPix2Pix自學習模型的彎曲染色體圖像拉直方法，其特征在于：包括如下步驟，

S1，接收彎曲染色體原圖，處理得到標記圖；

S2, 根據S1得到的標記圖，生成染色體骨架錨點圖；

S3，根據染色體骨架錨點圖，生成染色體拉直骨架圖；

S4，將染色體拉直骨架圖輸入訓練收斂的、接收骨架圖可輸出匹配的預測圖的彎曲染色體圖像拉直模型中，生成彎曲染色體拉直圖像。

2.根據權利要求1所述的基于BagPix2Pix自學習模型的彎曲染色體圖像拉直方法，其特征在于：所述S1包括：

S11,獲取顯微鏡拍攝的彎曲染色體圖像，并轉化為灰度圖；

S12，對S11得到的灰度圖進行標記，將圖中染色體標記為1值像素，雜質和背景部分標記為0值像素，獲得標記圖。

3.根據權利要求2所述的基于BagPix2Pix自學習模型的彎曲染色體圖像拉直方法，其特征在于：所述S2包括：

S21，記錄S12中標記圖的每一行的首個1值像素和末位1值像素；

S22，求出每一行的首個1值像素和末位1值像素的中間點的坐標（X,Y）；

S23，將所有求出的Y值平均分成n等分，形成n個均分點；

S24，將等分后，除第一個均分點和最后一個均分點之外的均分點定為彎曲染色體的骨架錨點；

S25，新建一張a×a大小的黑色背景圖片，在此圖片上定位所述S24中確定的骨架錨點，得到染色體骨架錨點圖。

4.根據權利要求3所述的基于BagPix2Pix自學習模型的彎曲染色體圖像拉直方法，其特征在于：所述S2中，若染色體彎曲幅度過大或骨架錨點定位在染色體部分之外，則人工標記目標數量個點作為骨架錨點。

5.根據權利要求3所述的基于BagPix2Pix自學習模型的彎曲染色體圖像拉直方法，其特征在于：所述S3包括

S31, 創建a×a大小的黑色背景圖片；

S32，計算出染色體骨架錨點圖中每兩個相鄰骨架錨點之間的距離；

S33，在S31的黑色背景圖片中，通過多條分別與一對相鄰骨架錨點之間的距離相等且位置居中的線段依次連接構成染色體拉直骨架圖。

6.根據權利要求5所述的基于BagPix2Pix自學習模型的彎曲染色體圖像拉直方法，其特征在于：每條所述線段的寬度為10像素，且多條所述線段的像素值漸大或漸小。

7.根據權利要求1-6任一所述的基于BagPix2Pix自學習模型的彎曲染色體圖像拉直方法，其特征在于：所述S4中，所述彎曲染色體圖像拉直模型基于對抗訓練方法學習從染色體骨架圖生成相應的染色體圖的模式，其包括一個生成器和一個判別器，且生成器包括一條編碼路徑和一條解碼路徑。

8.基于BagPix2Pix自學習模型的彎曲染色體圖像拉直系統，其特征在于：包括

預處理單元,用于接收彎曲染色體原圖，處理得到標記圖；

彎曲骨架圖生成單元，至少用于根據標記圖，生成染色體骨架錨點圖；

拉直骨架圖生成單元，用于根據染色體骨架錨點圖，生成染色體拉直骨架圖；

拉直染色體圖生成單元，用于將染色體拉直骨架圖輸入已訓練收斂的彎曲染色體圖像拉直模型中生成彎曲染色體拉直圖像。

9.可讀存儲介質，其特征在于：存儲有實現上述任一所述的基于BagPix2Pix自學習模型的彎曲染色體圖像拉直方法的程序。

10.圖像處理裝置，其特征在于：包括存儲器、處理器及通信總線；所述通信總線用于實現處理器和存儲器之間的連接通信；所述處理器用于執行存儲器中存儲的程序以實現上述任一所述的基于BagPix2Pix自學習模型的彎曲染色體圖像拉直方法。