[發明專利]一種基于融合注意力機制的乳腺MRI自動輔助診斷新方法有效
| 申請號: | 202010345214.8 | 申請日: | 2020-04-27 |
| 公開(公告)號: | CN111401480B | 公開(公告)日: | 2023-07-25 |
| 發明(設計)人: | 王培軍;薛宏偉;高燕;吳曉芬;陳浩;錢光武 | 申請(專利權)人: | 上海市同濟醫院;深圳視見醫療科技有限公司 |
| 主分類號: | G06V10/774 | 分類號: | G06V10/774;G06V10/764;G06V10/77;G16H30/20;G16H50/20;G06N3/0464 |
| 代理公司: | 上海卓陽知識產權代理事務所(普通合伙) 31262 | 代理人: | 周春洪 |
| 地址: | 200065 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 融合 注意力 機制 乳腺 mri 自動 輔助 診斷 新方法 | ||
1.一種基于融合注意力機制的乳腺MRI自動輔助診斷新方法,其特征在于,所述的乳腺MRI自動輔助診斷新方法包括以下步驟:
S1:人工選取乳腺分割數據集,訓練DenseUNet模型,將乳腺的TSE序列輸入到訓練好的DenseUNet模型進行乳腺分割,并去除胸腔中干擾腫瘤檢測的器官;
S2:將S1得到的分割結果映射到DCE序列,得到分割后的乳腺組織,將其輸入到具有注意力機制的DenseUNet模型ADUNet進行腫瘤分割,針對類不平衡和困難樣本問題,在訓練過程中采用Focal?Loss以防止模型偏移;
S3:將S2得到的結果輸入到一個輕量級的神經網絡中,進行良惡性判斷,得到輔助診斷結果;
所述的步驟S2中的ADUNet中具有注意力塊的上采樣塊UB操作包括:
S241:將低級特征圖x通過步長為2的3×3卷積,得到分辨率和高級特征圖g一樣的新特征圖x1;
S242:將高級特征圖g通過1×1卷積降低其通道數,使其和S241得到的新特征圖x1的通道上一致,并與其相加,得到新特征圖f1;
S243:將S242得到的新特征圖f1依次通過1個步長為1的1×1卷積和Sigmoid激活函數,得到一個單通道的空間方向的注意力權重圖m1,通過雙線性插值的方法將注意力系數圖m1的長和寬擴大兩倍的到注意力權重圖m2;
S244:將高級特征圖g依次通過全局平均池化,1×1卷積和Sigmoid激活函數,得到一個1×1×c的通道方向想的注意力系數向量v1,c表示低級特征圖x的通道數;
S245:將低級特征圖x與注意力權重圖m2和注意力系數向量v1相乘,得到注意力塊的輸出,即低級特征圖x2,高級特征圖擁有豐富的語義信息,通過注意力塊,低級特征圖中的前景區域在高級特征圖的指導下可以得到增強;
S246:通過上采樣將高級特征圖的長和寬擴大兩倍,得到新的高級特征圖g2;
S247:將高級特征圖g2和x2進行拼接,組成新的特征圖f2,并將其依次通過3×3卷積,組標準化GN,ReLU激活函數和dropout層,進而融合上下文信息,GN是批標準化BN的替代品,并且不要求很大的批量Batch?size,Dropout層可以降低過擬合情況。
2.根據權利要求1所述的乳腺MRI自動輔助診斷新方法,其特征在于,所述的步驟S1具體包括:
S11:采用無監督的經典方法對TSE序列進行乳腺分割,并人工選取分割結果較好的作為數據集;
S12:根據S11得到的數據集對DenseUNet訓練,將所有病人的TSE序列輸入到訓練好的DenseUNet中,得到每一個TSE序列對應的二值乳腺掩膜。
3.根據權利要求1所述的乳腺MRI自動輔助診斷新方法,其特征在于,所述的步驟S2具體包括:
S21:將每一個病人的TSE序列與DCE序列配準,根據配準結果,將S12得到的二值乳腺掩膜也做相應變換,并與DCE序列進行點乘,以去除DCE序列中的干擾組織和器官;
S22:將S21得到的DCE序列進行統一剪裁,以去除部分黑色背景,降低負樣本的個數;
S23:將DCE序列的腫瘤標注圖做S22中同樣的剪裁操作,與S22得到的剪裁后的DCE圖像構成腫瘤分割的數據集;
S24:利用預訓練DenseNet-161中前160層的權重對所提出的ADUNet的編碼器進行初始化;
S25:根據S23得到的數據集進行三通道的圖像表示,并將其輸入到ADUNet進行訓練,對所有病人的DCE序列進行新的圖像表示,輸入到訓練好的ADUNet中,得到腫瘤的分割結果。
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