[發(fā)明專利]與小麥籽粒灌漿速率QTL QGfr.sicau-7D.1緊密連鎖的分子標(biāo)記及應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010340855.4
• 申請(qǐng)日: 2020-04-26
• 公開（公告）號(hào): CN111471790B
• 公開（公告）日: 2022-07-08
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 劉亞西;林宇;蔣孝軍;李彩霞;陶陽(yáng);楊希蘭;王智強(qiáng);武方琨
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12N15/11
• 代理公司: 北京路浩知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002
• 代理人: 陳征

1.與小麥籽粒灌漿速率QTL QGfr.sicau-7D.1緊密連鎖的分子標(biāo)記，命名為KASP705，其特征在于，分子標(biāo)記KASP705與小麥籽粒灌漿速率QTL QGfr.sicau-7D.1共定位于7D染色體上標(biāo)記SNP5701～SNP6093區(qū)段內(nèi)，所述分子標(biāo)記KASP705位于小麥籽粒灌漿速率QTLQGfr.sicau-7D.1置信區(qū)間內(nèi)；

所述分子標(biāo)記位于核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的第18位，其多態(tài)性為A/G。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記，其特征在于，所述小麥籽粒灌漿速率QTLQGfr.sicau-7D.1能顯著增加小麥籽粒灌漿速率，LOD值大于4，解釋12.62%的表型變異。

3.用于擴(kuò)增權(quán)利要求1~2任一項(xiàng)所述分子標(biāo)記的特異性引物組，其特征在于，所述特異性引物組包括序列如SEQ ID NO.2-4所示的引物。

4.權(quán)利要求1~2任一項(xiàng)所述分子標(biāo)記或權(quán)利要求3所述特異性引物組的如下任一種應(yīng)用：

（1）在鑒定小麥籽粒灌漿速率QTL QGfr.sicau-7D.1中的應(yīng)用；

（2）在篩選或鑒定籽粒快速灌漿的小麥品種中的應(yīng)用；

（3）在小麥分子標(biāo)記輔助育種中的應(yīng)用；

（4）在小麥種質(zhì)資源改良中的應(yīng)用。

5.一種鑒定小麥籽粒灌漿速率QTL QGfr.sicau-7D.1的方法，其特征在于，以待測(cè)小麥的基因組DNA為模板，采用權(quán)利要求3所述的特異性引物組進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增，根據(jù)PCR擴(kuò)增結(jié)果對(duì)待測(cè)小麥進(jìn)行基因分型；含有小麥籽粒快速灌漿QTL QGfr.sicau-7D.1的小麥品種均出現(xiàn)與SEQ ID NO.2所示引物標(biāo)記的熒光探針相同的熒光信號(hào)，而不含有小麥籽粒灌漿速率QTL QGfr.sicau-7D.1的小麥品種均出現(xiàn)與SEQ ID NO.2所示引物標(biāo)記的熒光探針明顯不同的熒光信號(hào)。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法，其特征在于，所述熒光定量PCR擴(kuò)增的反應(yīng)體系：2×KASP Mastermix 5μL，KASP Assay Mix 0.14μL，模板DNA 50ng、Dnase/RNase-free去離子水加至總量為10μL；其中，KASP Assay Mix中含有引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2-4所示，三條引物體積比為2:2:5；和/或

熒光定量PCR程序：95℃活化15min；95℃變性20s，65℃退火延伸60s，循環(huán)10次，每次退火延伸溫度降低1℃；94℃變性20s，57℃退火延伸60s，循環(huán)30次；37℃ 60s，采集熒光信號(hào)。