[發明專利]一種利用熒光RPA鑒定白紋伊蚊的方法有效
| 申請號: | 202010327634.3 | 申請日: | 2020-04-23 |
| 公開(公告)號: | CN111534603B | 公開(公告)日: | 2022-07-26 |
| 發明(設計)人: | 曹曉梅;張曉龍;李穎;楊燕;慈穎;劉瑩瑩;劉麗娟;王靜;楊宇 | 申請(專利權)人: | 中國檢驗檢疫科學研究院 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12Q1/6844;C12N15/11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 利用 熒光 rpa 鑒定 白紋伊蚊 方法 | ||
本發明公開了一種利用熒光RPA鑒定白紋伊蚊的方法,屬于生物技術領域。本發明公開的一種利用熒光RPA鑒定白紋伊蚊的方法,設計了白紋伊蚊檢測特異性引物和探針,建立了檢測白紋伊蚊的熒光RPA方法,在39℃,20min即可完成檢測;操作簡便,靈敏度高,特異性強,重復性好。
技術領域
本發明涉及生物技術領域,更具體的說是涉及一種利用熒光RPA鑒定白紋伊蚊的方法。
背景技術
白紋伊蚊(
重組酶聚合酶擴增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA)技術是一種新型的在恒溫下可以使核酸快速擴增的方法。該技術在恒溫下,利用重組酶可與引物DNA緊密結合,形成酶和引物的復合體,當引物在模板DNA上搜索到與之完全互補的序列時,在單鏈DNA結合蛋白(single stranded DNA binding,SSB)的幫助下,使模板DNA解鏈,并在DNA聚合酶的作用下,形成新的DNA互補鏈。反應產物呈指數級增長,整個反應過程無需特殊的輔助儀器,操作簡便。
因此,提供一種利用熒光RPA鑒定白紋伊蚊的方法是本領域技術人員亟需解決的問題。
發明內容
有鑒于此,本發明提供了一種利用熒光RPA鑒定白紋伊蚊的方法,操作簡便,靈敏度高,特異性強,重復性好。
為了實現上述目的,本發明采用如下技術方案:
一種利用熒光RPA鑒定白紋伊蚊的引物探針組合物,所述引物序列如下:
上游引物:5’-GTCGTGGTTGATGAGTACATCCCAAACCGGAGT-3’;SEQ ID NO.3;
下游引物:5’-GAGCCCACTGAGAGTTCCAGGTGACTGTTCC-3’;SEQ ID NO.4;
所述探針序列如下:
5’-CCCGTGTGTGAGTTGTGCGGTGCGGTGTCG[FAM-dT]GG[THF]A[BHQ1-dT]TAGGCGCGTGCGCG-3’-PHO。
進一步,含有上述引物探針組合物的試劑盒。
進一步,一種利用熒光RPA鑒定白紋伊蚊的方法,步驟如下:
(1)提取樣品DNA;
(2)以樣品DNA為模板,利用上述的引物探針組合進行擴增;在39℃條件下反應20min。
經由上述的技術方案可知,與現有技術相比,本發明公開提供了一種利用熒光RPA鑒定白紋伊蚊的方法,設計了白紋伊蚊檢測特異性引物和探針,建立了檢測白紋伊蚊的熒光RPA方法,在39℃,20 min即可完成檢測。對目的DNA的檢測限為0.01ng/μL,3個平行的差異系數值均≤4.85%,顯示了良好的重復性。本發明還用相同的引物,采用RPA Basic方法進行了檢測,在33℃,25min可完成檢測,并經測序、BLAST結果顯示均為白紋伊蚊ITS2序列,進一步驗證了熒光RPA方法的檢測結果,并且與基于DNA條形碼的方法檢測結果一致。熒光RPA方法和RPA Basic的方法相比,省去了DNA純化和凝膠電泳的繁瑣步驟而更加簡便。
附圖說明
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