[發明專利]一種基于三維卷積神經網絡的肺葉分割方法及系統有效
| 申請號: | 202010324982.5 | 申請日: | 2020-04-23 |
| 公開(公告)號: | CN111563902B | 公開(公告)日: | 2022-05-24 |
| 發明(設計)人: | 李彬;黃迪臻;田聯房 | 申請(專利權)人: | 華南理工大學 |
| 主分類號: | G06T7/11 | 分類號: | G06T7/11;G06T7/181;G06N3/04;G06N3/08;G06V10/774;G06V10/764;G06K9/62 |
| 代理公司: | 廣州市華學知識產權代理有限公司 44245 | 代理人: | 李斌 |
| 地址: | 510640 廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 三維 卷積 神經網絡 肺葉 分割 方法 系統 | ||
1.一種基于三維卷積神經網絡的肺葉分割方法,其特征在于,包括下述步驟:
構建肺葉分割的訓練圖像數據集;
構建基于三維卷積神經網絡的肺葉分割網絡并進行網絡訓練;
所述網絡訓練具體包括:
對訓練圖像數據集進行預處理;
基于U型結構搭建三維卷積神經網絡,對輸入數據進行下采樣提取特征,上采樣恢復原圖尺寸,輸出每個像素所屬類別概率圖;
采用Dice Loss損失函數計算每個像素所屬類別概率圖的損失,多個類別概率圖的損失進行加權得到總損失;
所述采用Dice Loss損失函數計算每個像素所屬類別概率圖的損失,多個類別概率圖的損失進行加權得到總損失,具體步驟包括:
采用邊界損失對邊界概率圖計算損失,邊界概率圖包括肺裂及肺邊界概率圖,邊界損失具體計算公式為:
其中,Lb表示肺裂及肺邊界損失,j表示類別,N表示所有體素點的數目,pij表示體素點i預測為第j類的概率,tij表示體素點i實際為第j類的概率,ε為正數;
采用左右肺損失對左右肺概率圖計算損失,左右肺損失具體計算公式為:
其中,k表示最后k層的概率圖,Llung(k)為最后k層的左右肺損失,j表示類別,N表示所有體素點的數目,pijk表示最后k層的概率圖中體素點i預測為第j類的概率,tijk表示最后k層的概率圖中體素點i實際為第j類的概率;
采用肺葉損失對肺葉概率圖計算損失,肺葉損失具體計算公式為:
其中,Llobe(k)為最后k層的肺葉損失,j表示類別,N表示所有體素點的數目,pijk表示最后k層的概率圖中體素點i預測為第j類的概率,tijk表示最后k層的概率圖中體素點i實際為第j類的概率;
采用深度監督損失對非最后一層的左右肺概率圖計算損失,深度監督損失具體計算公式為:
總損失的計算公式為:
L=λbLb+λlungLlung(1)+λlobeLlobe(1)+λdeepLdeep
其中,L為總損失,Lb、Llung(1)、Llobe(1)、Ldeep分別為肺裂及肺邊界損失、左右肺損失、肺葉損失和深度監督損失,λb、λlung、λlobe、λdeep為對應損失的權重;
設置權重衰減和學習率衰減,訓練網絡直至網絡收斂;
將待測圖像進行預處理后輸入到訓練好的肺葉分割網絡,輸出預測結果;
將預測結果經過后處理還原至待測圖像原始輸入尺寸,獲得最終分割結果。
2.根據權利要求1所述的基于三維卷積神經網絡的肺葉分割方法,其特征在于,所述構建肺葉分割訓練圖像數據集,具體步驟包括:
所述肺葉分割訓練圖像數據集標注肺區域及肺葉;
根據已標注的肺區域及肺葉,采用邊界提取算法提取左右肺邊界及肺裂,作為附加的標注內容。
3.根據權利要求2所述的基于三維卷積神經網絡的肺葉分割方法,其特征在于,所述采用邊界提取算法提取左右肺邊界及肺裂,具體步驟包括:所述邊界提取算法采用三維輪廓提取算法,先對二值化的標注區域填充孔洞,再提取三維輪廓,獲得右肺邊界及左肺邊界,肺裂像素點根據標注的肺葉區域進行提取,若像素點的設定鄰域內存在不同標簽的肺葉像素,則將像素點標注為肺裂像素點。
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