[發(fā)明專利]一種用于鑒定待測植物樣品是否來源于SbSNAC1-382事件或其后代的方法

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• 申請日: 2020-04-22
• 公開（公告）號: CN111394500A
• 公開（公告）日: 2020-07-10
• 發(fā)明（設計）人: 王天宇;張登峰;曾廷儒;李永祥;李春輝;宋燕春;石云素;黎裕
• 申請（專利權(quán)）人: 中國農(nóng)業(yè)科學院作物科學研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245
• 代理人: 閆書寧

1.用于鑒定待測植物樣品是否來源于SbSNAC1-382事件或其后代的方法，包括如下步驟：檢測待測植物樣品的基因組DNA中是否含有DNA片段A和/或DNA片段B；然后進行如下判斷：如果待測植物樣品的基因組DNA含有DNA片段A和/或DNA片段B，則待測植物樣品來源于SbSNAC1-382事件或其后代；如果待測植物樣品的基因組DNA不含有DNA片段A和/或DNA片段B，則待測植物樣品不來源于SbSNAC1-382事件或其后代；

DNA片段A的核苷酸序列如序列表中序列3所示；

DNA片段B的核苷酸序列如序列表中序列4所示；

SbSNAC1-382事件為玉米Zea mays SbSNAC1-382 CGMCC No.17493。

2.如權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于：所述“檢測待測植物樣品的基因組DNA中是否含有DNA片段A和/或DNA片段B”的方法為S1)或S2)或S3)：

S1)直接測序；

S2)用引物對X和/或引物對Y對待測植物樣品的基因組DNA進行PCR擴增，然后進行如下判斷：如果得到目的擴增產(chǎn)物，則待測植物樣品來源于SbSNAC1-382事件或其后代；如果沒有得到目的擴增產(chǎn)物，則待測植物樣品不來源于SbSNAC1-382事件或其后代；

引物對X由上游引物FX和下游引物RX組成；上游引物FX為序列表中序列3自5’末端起第1-451位所示的DNA分子的一部分；下游引物RX為序列表中序列3自5’末端起第452-933位所示的DNA分子的一部分的反向互補序列；引物對X的目的擴增產(chǎn)物為DNA分子X；

引物對Y由上游引物FY和下游引物RY組成；上游引物FY為序列表中序列4自5’末端起第1-352位所示的DNA分子的一部分；下游引物RY為序列表中序列4自5’末端起第353-547位所示的DNA分子的一部分的反向互補序列；引物對Y的目的擴增產(chǎn)物為DNA分子Y；

S3)用能特異結(jié)合DNA分子X的探針甲和/或能特異結(jié)合DNA分子Y的探針乙對待測植物樣品的基因組DNA進行Southern雜交，然后進行如下判斷：如果得到雜交片段，則待測植物樣品來源于SbSNAC1-382事件或其后代；若不能得到雜交片段，則待測植物樣品不來源于SbSNAC1-382事件或其后代。

3.如權(quán)利要求2所述的方法，其特征在于：

所述引物對X為引物對X1、引物對X2和引物對X3中的至少一個；

引物對X1由引物P1和引物P2組成；

引物對X2由引物P3和引物P4組成；

引物對X3由引物P1和引物P4組成；

引物P1的核苷酸序列如序列表中序列5所示；

引物P2的核苷酸序列如序列表中序列6所示；

引物P3的核苷酸序列如序列表中序列7所示；

引物P4的核苷酸序列如序列表中序列8所示；

所述引物對Y為引物對Y1、引物對Y2、引物對Y3和引物對Y4中的至少一個；

引物對Y1由引物S1和引物S3組成；

引物對Y2由引物S2和引物S3組成；

引物對Y3由引物S1和引物S4組成；

引物對Y4由引物S2和引物S4組成；

引物S1的核苷酸序列如序列表中序列9所示；

引物S2的核苷酸序列如序列表中序列10所示；

引物S3的核苷酸序列如序列表中序列11所示；

引物S4的核苷酸序列如序列表中序列12所示。