[發明專利]一種用于血流感染病原診斷的血漿游離DNA標志物

在審

• 申請號: 202010315822.4
• 申請日: 2020-04-21
• 公開（公告）號: CN111411144A
• 公開（公告）日: 2020-07-14
• 發明（設計）人: 申奧;王曉鳳;吳紅龍
• 申請（專利權）人: 深圳華大因源醫藥科技有限公司;華大生物科技（武漢）有限公司
• 主分類號: C12Q1/24
• 分類號: C12Q1/24;C12Q1/6869;C12Q1/689;C12Q1/14;C12Q1/10;C12Q1/04
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 張立娜

1.一種血漿游離DNA的處理方法，包括如下步驟：從待測血漿游離DNA中選擇大小為60-140bp的片段。

2.一種通過血漿游離DNA進行血流感染病原體檢測的樣本前處理方法，包括如下步驟：

(A1)從待測血漿中提取游離DNA，進行末端修復和加A，并連接接頭，得到DNA文庫；

(A2)從所述DNA文庫中選擇所述游離DNA片段大小為60-140bp的片段，得到測序文庫，所述測序文庫即為處理后樣本。

3.一種提高血漿游離DNA中病原體檢出率的方法，包括如下步驟：

(A1)從待測血漿中提取游離DNA，進行末端修復和加A，并連接接頭，得到DNA文庫；

(A2)從所述DNA文庫中選擇所述游離DNA片段大小為60-140bp的片段，得到測序文庫；

(A3)對所述測序文庫進行上機測序，從測序結果中獲得所述待測血漿中病原體的檢測結果。

4.一種通過血漿游離DNA檢測血流感染病原體的系統，包括

(B1)用于從血漿中提取游離DNA的試劑和/或儀器；

(B2)用于對游離DNA進行末端修復和加A，并連接接頭，得到DNA文庫的試劑和/或儀器；

(B3)能夠從所述DNA文庫中選擇游離DNA片段大小為60-140bp的片段作為測序文庫的試劑和/或儀器；

(B4)能夠對所述測序文庫進行上機測序，從測序結果中獲得待測血漿中病原體的檢測結果的裝置。

5.根據權利要求4所述的系統，其特征在于：所述(B4)中，所述裝置中設有結論輸出模塊；

所述結論輸出模塊用于按照如下輸出結論：如果所述測序結果中含有某種病原體的特異性序列信息，則所述待測血漿中含有或候選含有對應的病原體；如果所述測序結果中不含有某種病原體的特異性序列信息，則所述待測血漿中不含有或候選不含有對應的病原體。

6.一種提高血漿游離DNA中病原體檢出率的方法，包括如下步驟：

(C1)從待測血漿中提取游離DNA；

(C2)以所述游離DNA為模板，采用病原體特異性引物對進行PCR擴增；所述引物對擴增目的片段的大小為60-140bp；

(C3)根據PCR擴增結果獲得所述待測血漿中病原體的檢測結果。

7.權利要求4或5所述系統在制備用于通過血漿游離DNA檢測血流感染病原體的產品中的應用。

8.權利要求4或5所述系統和記載有權利要求3所述方法的可讀性介質在制備用于通過血漿游離DNA檢測血流感染病原體的產品中的應用；或

用于對血漿游離DNA進行PCR擴增所用試劑和/或儀器與記載有權利要求6所述方法的可讀性介質在制備用于通過血漿游離DNA檢測血流感染病原體的產品中的應用。

9.根據權利要求1-8中任一所述的方法或系統或應用，其特征在于：所述大小為60-140bp是大小為64-132bp；和/或

所述病原體選自如下：大腸埃希菌、肺炎克雷伯菌、金黃色葡萄球菌、屎腸球菌和/或鮑曼不動桿菌感染。

10.血漿中病原體游離DNA的分布特征在如下任一中的應用：

(D1)開發通過血漿游離DNA檢測血流感染病原體的產品；

(D2)開發通過血漿游離DNA診斷感染性疾病的產品；

(D3)提升現有通過血漿游離DNA檢測血流感染病原體的產品的性能；

(D4)制備血漿游離DNA中病原體模擬樣本。