[發明專利]分子生成方法、裝置及計算機可讀存儲介質和終端設備

有效

• 申請號: 202010311281.8
• 申請日: 2020-04-20
• 公開（公告）號: CN111508568B
• 公開（公告）日: 2023-08-29
• 發明（設計）人: 王碩;謝昌諭;張勝譽;廖奔犇;姚小軍
• 申請（專利權）人: 騰訊科技（深圳）有限公司
• 主分類號: G16C20/50
• 分類號: G16C20/50
• 代理公司: 深圳翼盛智成知識產權事務所(普通合伙) 44300
• 代理人: 蔡艾瑩

1.一種分子生成方法，其特征在于，包括：

(a)對種子分子進行形狀變化處理，得到生成分子集，所述生成分子集中包括生成分子；

(b)確定所述生成分子集中生成分子的活性信息；

(c)根據所述生成分子集中生成分子的活性信息，計算活性最高的至少一個生成分子的第一藥效團特征與所述種子分子的第二藥效團特征的相似度參數；

(d)根據所述相似度參數，當確定某一生成分子的第一藥效團特征與所述第二藥效團特征的相似度在預置范圍內，將所述某一生成分子作為新的種子分子；

針對所述新的種子分子，執行所述(a)-(d)的步驟；

所述對種子分子進行形狀變化處理，得到生成分子集，具體包括：

調用形狀變化編碼模型和字幕解碼模型；

所述形狀變化編碼模型根據所述種子分子和種子分子中的藥效團進行形狀變化編碼，得到編碼后特征信息；

所述字幕解碼模型根據所述編碼后特征信息進行解碼，得到生成分子集中各個生成分子的字符串表示。

2.如權利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法還包括：

確定形狀變化編碼初始模型和字幕解碼初始模型；

確定訓練樣本，所述訓練樣本中包括多個種子分子樣本及各個種子分子樣本對應的受體分子樣本；

通過所述形狀變化編碼初始模型對所述種子分子樣本進行形狀變化編碼，得到編碼后樣本特征信息，通過字幕解碼初始模型對所述編碼后樣本特征信息進行解碼，得到生成分子樣本集的信息；

根據所述字幕解碼初始模型得到的生成分子樣本集及所述受體分子樣本，調整所述形狀變化編碼初始模型和字幕解碼初始模型的參數值，以得到最終的形狀變化編碼模型和字幕解碼模型。

3.如權利要求2所述的方法，其特征在于，所述方法還包括：

確定性質預測模型，所述性質預測模型用于根據所述編碼后樣本特征信息進行藥物性質的預測，得到性質預測結果。

4.如權利要求3所述的方法，其特征在于，所述根據所述字幕解碼初始模型得到的生成分子樣本集及所述受體分子樣本，調整所述形狀變化編碼初始模型和字幕解碼初始模型的參數值，具體包括：

根據所述性質預測結果、所述字幕解碼初始模型得到的生成分子樣本集及所述受體分子樣本，計算與所述形狀變化編碼初始模型和字幕解碼初始模型相關的損失函數；

根據所述損失函數調整所述形狀變化編碼初始模型和字幕解碼初始模型的參數值。

5.如權利要求2所述的方法，其特征在于，當對所述參數值的調整次數等于預置的次數時，或若當前調整的固定參數值與上一次調整的固定參數值的差值小于一閾值時，則停止對所述固定參數值的調整。

6.如權利要求1至5任一項所述的方法，其特征在于，所述確定所述生成分子集中生成分子的活性信息，具體包括：

將所述生成分子與對應靶點進行對接，得到對接后分子；

根據所述對接后分子與預置的打分函數進行打分，得到對接分數，所述生成分子的活性信息包括所述對接分數。

7.如權利要求1至5任一項所述的方法，其特征在于，所述確定所述生成分子集中生成分子的活性信息，具體包括：

根據所述生成分子和對應靶點文件生成另一個格式文件；

根據所述另一格式文件預測所述生成分子的親和力值，所述活性信息包括所述親和力值。

8.如權利要求1至5任一項所述的方法，其特征在于，所述計算活性最高的至少一個生成分子的第一藥效團特征與所述種子分子的第二藥效團特征的相似度參數，具體包括：

計算所述至少一個生成分子的第一藥效團特征與第二藥效團特征之間的均方根偏差，當某一生成分子對應的均方根偏差為負1，則所述某一生成分子的第一藥效團特征與第二藥效團特征的相似度在預置范圍內。