[發(fā)明專(zhuān)利]水稻OsIDEF1基因強(qiáng)抗逆基因型分子標(biāo)記及其應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010217817.X
• 申請(qǐng)日: 2020-03-25
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN111270005A
• 公開(kāi)（公告）日: 2020-06-12
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 方軍;于洋;劉奕媺;沙漢景
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 中國(guó)科學(xué)院東北地理與農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/6895
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 哈爾濱華夏松花江知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 23213
• 代理人: 侯靜

水稻OsIDEF1基因強(qiáng)抗逆基因型分子標(biāo)記及其應(yīng)用，涉及一種鑒別水稻OsIDEF1基因強(qiáng)抗逆基因型的分子標(biāo)記及其應(yīng)用。本發(fā)明的目的是提供一種水稻OsIDEF1基因強(qiáng)抗逆基因型分子標(biāo)記及其應(yīng)用，用以鑒別水稻強(qiáng)抗逆基因型。用于特異性PCR擴(kuò)增該分子標(biāo)記的引物為：正向引物：5’?CACCCGCACAACCACAAC?3’，反向引物：5’?GAGTGTGACAAGGGTGAGGAG?3’。分子標(biāo)記在鑒定或篩選水稻強(qiáng)抗逆性?xún)?yōu)勢(shì)品種中的應(yīng)用。本發(fā)明發(fā)現(xiàn)了水稻耐堿轉(zhuǎn)錄因子基因OsIDEF1在調(diào)控植物應(yīng)答堿脅迫過(guò)程中具有重要作用，并發(fā)現(xiàn)OsIDEF1在自然界中存在不同基因型差異。本發(fā)明應(yīng)用于水稻抗逆育種領(lǐng)域。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及一種鑒別水稻OsIDEF1基因強(qiáng)抗逆基因型的分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

水稻是世界上食用人口最多、歷史最悠久的農(nóng)作物。全球25億以上的人口以水稻為主食。中國(guó)稻作歷史約有七千年，我國(guó)不僅是世界栽培稻起源地之一，也是世界上的產(chǎn)稻大國(guó)，稻作播種面積僅次于印度，約占世界水稻總面積的1/6，產(chǎn)量居世界第一，約占世界水稻總產(chǎn)量的27.5％。據(jù)估計(jì)，到2030年需要多生產(chǎn)40％的水稻以滿(mǎn)足人們?nèi)找嬖鲩L(zhǎng)的糧食需求。

我國(guó)大約有1億hm²鹽堿地與灘涂地，面積相當(dāng)于2017年我國(guó)糧食耕地面積的80％。其中東北松嫩平原是世界上蘇打鹽堿化土壤的最大集中分布區(qū)，鹽堿地面積高達(dá)765萬(wàn)hm²，約占我國(guó)鹽堿地面積的7.7％。科學(xué)合理地開(kāi)發(fā)和利用這些土地資源將為我國(guó)糧食安全提供更好地保障，創(chuàng)造巨大的經(jīng)濟(jì)效益、社會(huì)效益和生態(tài)效益。因此，如何提高作物耐堿性是我國(guó)乃至全世界農(nóng)業(yè)生產(chǎn)亟待解決的重大問(wèn)題。如何準(zhǔn)確、快速的鑒定具有強(qiáng)抗逆能力的基因型，將有利于抗逆水稻品種的選育，從而提高水稻抗逆育種的技術(shù)水平。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供一種水稻OsIDEF1基因強(qiáng)抗逆基因型分子標(biāo)記及其應(yīng)用，用以鑒別水稻強(qiáng)抗逆基因型。

本發(fā)明提供一種水稻OsIDEF1基因強(qiáng)抗逆基因型分子標(biāo)記，用于特異性PCR擴(kuò)增該分子標(biāo)記的引物為：

正向引物：5’-CACCCGCACAACCACAAC-3’

反向引物：5’-GAGTGTGACAAGGGTGAGGAG-3’

本發(fā)明還提供水稻OsIDEF1基因在調(diào)控水稻抗逆性中的應(yīng)用。

進(jìn)一步的，所述抗逆性為抗堿脅迫。

進(jìn)一步的，所述抗堿脅迫為抗NaHCO₃脅迫。體現(xiàn)為在NaHCO₃脅迫的條件下：轉(zhuǎn)基因植物的萌發(fā)率或存活率高于受體植物、轉(zhuǎn)基因植物的根長(zhǎng)長(zhǎng)于受體植物、轉(zhuǎn)基因植物的葉綠素含量高于受體植物。所述植物為水稻。

本發(fā)明還提供上述分子標(biāo)記在鑒定或篩選水稻強(qiáng)抗逆性?xún)?yōu)勢(shì)品種中的應(yīng)用。

進(jìn)一步的，所述抗逆性為抗堿脅迫。所述抗堿脅迫為抗NaHCO₃脅迫。

進(jìn)一步的，所述鑒定或篩選方法為：

一、提取待測(cè)水稻的基因組DNA；

二、以步驟一獲得的基因組DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增，擴(kuò)增引物為：正向引物5’-CACCCGCACAACCACAAC-3’，反向引物5’-GAGTGTGACAAGGGTGAGGAG-3’；

三、檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物，如果PCR產(chǎn)物大小為103bp，則待測(cè)水稻為長(zhǎng)白9號(hào)，屬于強(qiáng)抗逆性?xún)?yōu)勢(shì)品種。

其中步驟二所述PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為50μl：

步驟二所述PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?/p>