[發明專利]一種基于代謝組全局分析的植物性別鑒定方法有效
| 申請號: | 202010213466.5 | 申請日: | 2020-03-24 |
| 公開(公告)號: | CN111323509B | 公開(公告)日: | 2021-12-03 |
| 發明(設計)人: | 閆建斌;杜然;廖慶剛;黃三文 | 申請(專利權)人: | 中國農業科學院農業基因組研究所 |
| 主分類號: | G01N30/02 | 分類號: | G01N30/02;G01N30/72;G01N30/86 |
| 代理公司: | 北京布瑞知識產權代理有限公司 11505 | 代理人: | 孫式洪 |
| 地址: | 518108 廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 代謝 全局 分析 植物 性別 鑒定 方法 | ||
1.一種基于代謝組全局分析的植物性別鑒定方法,其特征在于,包含如下步驟:
1)非靶向代謝組檢測待測銀杏的葉片中的代謝物;
2)對非靶向代謝組數據進行定量校準;所述對非靶向代謝組數據進行定量校準包括采用基于內標校正的MRM監控技術對步驟1)檢測出的非靶向代謝物進行基于離子對信息的靶向含量校準;
3)將步驟2)中的數據處理與已知性別銀杏的非靶向代謝數據處理進行對比判定待測銀杏的性別;
采用超高分辨質譜進行代謝物的檢測;其中,提取溶劑為80%濃度甲醇;色譜質譜條件包括:BEH C18色譜柱,流動相A為甲醇,流動相B為5mmol/L的乙酸銨,所述流動相A和B的體積比從50:50逐步提升至95:5。
2.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述步驟1)包括:分別提取銀杏樹幼苗葉片和內參葉片的代謝物后進行代謝組非靶向檢測。
3.如權利要求2中所述的方法,其特征在于,所述的內參葉片為與待測銀杏屬于同一品種的已經確定性別的銀杏樹的葉子。
4.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述步驟1)中所述代謝組鑒定和數據處理包括:采用質譜分析軟件抽提質譜信息,并建立檢測到物質的定性和定量離子對。
5.如權利要求4所述的方法,其特征在于,所述色譜質譜條件為:采用型號為100×2.1mm,1.7μm的BEH C18色譜柱進行分離;流速為0.3ml/min,進樣量1μl,柱溫45℃;HESI源在負離子模式下運行,碰撞氣壓力1.5 mTorr,噴霧電壓2.8 kV,毛細管溫度320℃,加熱器溫度300℃。
6.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述色譜質譜條件為:采用型號為100×2.1mm,1.7μm的BEH C18色譜柱進行分離;流速為0.3ml/min,進樣量1μl,柱溫45℃;HESI源在負離子模式下運行,碰撞氣壓力1.5 mTorr,噴霧電壓2.8 kV,毛細管溫度320℃,加熱器溫度300℃。
7.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述步驟3)中的具體方法為:以已知雌雄性別的銀杏葉代謝組檢測數據作為參考,待檢測的銀杏樣品中,其代謝組在統計學處理后,與雄性已知銀杏樣品經系統聚類分析劃分在同一個分支下的則判定為雄性;與雌性已知銀杏樣品劃分在同一個分支下的則判定為雌性。
8.如權利要求7所述的方法,其特征在于,所述系統聚類分析采用Ward聚類算法。
9.權利要求1-8任意一項所述的方法在銀杏性別鑒定中的應用。
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