[發明專利]一種檢測生物芯片樣本的方法、裝置及存儲介質

有效

• 申請號: 202010200328.3
• 申請日: 2020-03-20
• 公開（公告）號: CN111257296B
• 公開（公告）日: 2023-04-11
• 發明（設計）人: 吳瓊;侯孟軍;馬小惠;王友學
• 申請（專利權）人: 京東方科技集團股份有限公司
• 主分類號: G01N21/64
• 分類號: G01N21/64;G01B11/00;G01B11/26
• 代理公司: 北京同達信恒知識產權代理有限公司 11291
• 代理人: 黃麗

本發明公開了一種檢測生物芯片樣本的方法、裝置及存儲介質，該方法包括：獲得生物芯片對應的生物芯片圖像；確定所述生物芯片圖像中每個反應腔室的位置信息，以及與所述生物芯片圖像的四個邊角對應的邊角腔室；確定所述邊角腔室的偏轉角度；用所述偏轉角度對所述生物芯片圖像的偏轉角進行校正；對校正后的生物芯片圖像中所有反應腔室的陰陽性進行識別。

技術領域

本發明涉及生物醫療技術領域，尤指一種檢測生物芯片樣本的方法、裝置及存儲介質。

背景技術

在生物醫療領域中，陣列型生物芯片技術是對基因分析及疾病進行精確診斷的一種重要工具，能夠克服傳統方法需要多次重復試驗的弊端，有效節約人力、樣本量，提高了檢測精度，是現代生物醫療領域中進行生物樣本檢測的重要手段之一。

陣列型生物芯片技術是將一定數量的生物化學反應空間(又被稱之為反應單元或反應腔室)固定于一定面積的基片。在使用時，加載測試樣本到芯片上，并提供反應條件令其發生反應，然后利用現有技術可檢測到的光、電信號等作為反應發生強度，或反應發生與否的判斷依據，間接獲取測試樣本的生物信息。

在對生物芯片樣本點進行檢測時，主要有以下三種方法：參數依賴的方法、標記輔助的方法、自動檢測的方法。

參數依賴的方法依賴于人工設定或輸入的參數，如行列坐標、反應腔室位置模板等，在使用時必須知曉芯片參數并準確輸入方能得到檢測結果，這在芯片種類多樣或參數缺失的情況下會造成人力成本的提高。

標記輔助的方法需要在芯片上設計輔助標記，但目前芯片可能來自不同的生產方，不同生產方標記的設計方式不唯一，所以這種方法更適用于分析來自單一生產方的芯片，使得其靈活性較差。

自動檢測的方法是通過提取圖像特征，自主得到芯片行列數目、位置信息，對樣本點的陰陽性進行檢測和分析，這種方法可以分析多種陣列式生物芯片，其兼容性好、靈活性強，節約人力、生物樣本成本，目前的自動檢測方法主要是基于神經網絡的方法，和二值化結果的投影直方圖的網格劃分法。

然而在采用上述自動檢測的方法時，由于受光照影響使得提取的圖像特征存在偏差，造成檢測結果的準確度不高。

鑒于此，如何有效提高對生物芯片上的樣本進行檢測的準確度，成為一個亟待解決的技術問題。

發明內容

本發明實施例提供一種檢測生物芯片樣本的方法、裝置及存儲介質，用以解決現有技術中存在檢測生物芯片樣本的準確度較低的技術問題。

第一方面，為解決上述技術問題，本發明實施例提供一種檢測生物芯片樣本的方法，該方法包括：

獲得生物芯片對應的生物芯片圖像；

確定所述生物芯片圖像中每個反應腔室的位置信息，以及與所述生物芯片圖像的四個邊角對應的邊角腔室；

確定所述邊角腔室的偏轉角度；

用所述偏轉角度對所述生物芯片圖像的偏轉角進行校正；

對校正后的生物芯片圖像中所有反應腔室的陰陽性進行識別。

可選地，獲得生物芯片對應的生物芯片圖像，包括：

采集發生了生物化學反應的生物芯片的熒光圖像；其中，所述生物芯片為四邊形，所述生物芯片上呈陣列排布有多個反應腔室；

對所述熒光圖像進行灰度處理，獲得所述生物芯片圖像。

可選地，獲得所述生物芯片圖像之前，還包括：

對進行了灰度處理的熒光圖像進行降噪處理。

可選地，確定所述生物芯片圖像中每個反應腔室的位置信息，以及與所述生物芯片圖像的四個邊角對應的邊角腔室，包括：