[發明專利]細胞核分割方法、裝置、設備及存儲介質在審
| 申請號: | 202010190989.2 | 申請日: | 2020-03-18 |
| 公開(公告)號: | CN111429468A | 公開(公告)日: | 2020-07-17 |
| 發明(設計)人: | 李秀林;韓文廷;文可;陳俊仕;王朝暉;石軍;郝曉宇;高騰 | 申請(專利權)人: | 合肥凱碧爾高新技術有限公司 |
| 主分類號: | G06T7/12 | 分類號: | G06T7/12;G06T7/13 |
| 代理公司: | 北京集佳知識產權代理有限公司 11227 | 代理人: | 薛嬌 |
| 地址: | 230026 安徽省合肥市中國科學*** | 國省代碼: | 安徽;34 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 細胞核 分割 方法 裝置 設備 存儲 介質 | ||
1.一種細胞核分割方法,其特征在于,包括:
對顯微圖像進行特征提取,得到特征圖像;
利用所述特征圖像進行細胞核分割,得到初始的細胞核分割結果;
利用所述特征圖像進行輪廓檢測,得到細胞核輪廓檢測結果;
利用所述細胞核輪廓檢測結果對所述初始的細胞核分割結果進行修正,得到最終的細胞核分割結果。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述利用所述細胞核輪廓檢測結果對所述初始的細胞核分割結果進行修正,得到最終的細胞核分割結果,包括:
利用所述細胞核輪廓檢測結果中的各個細胞核輪廓對所述初始的細胞核分割結果中的細胞核區域進行分割,得到所述最終的細胞核分割結果。
3.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述對顯微圖像進行特征提取,得到特征圖像;利用所述特征圖像進行細胞核分割,得到初始的細胞核分割結果;利用所述特征圖像進行輪廓檢測,得到細胞核輪廓檢測結果,包括:
利用分割模型對所述顯微圖像進行處理,得到所述初始的細胞核分割結果和所述細胞核輪廓檢測結果;
所述分割模型具有對所述顯微圖像進行特征提取,得到特征圖像;利用所述特征圖像進行細胞核分割,得到初始的細胞核分割結果;利用所述特征圖像進行輪廓檢測,得到細胞核輪廓檢測結果的能力。
4.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述利用分割模型對所述顯微圖像進行處理,包括:
利用所述分割模型的編碼器對所述顯微圖像進行編碼,得到所述特征圖像;
利用所述分割模型的第一解碼器對所述特征圖像進行解碼,得到所述初始的細胞核分割結果;
利用所述分割模型的第二解碼器對所述特征圖像進行解碼,得到所述細胞核輪廓檢測結果。
5.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,所述編碼器由N個編碼塊串聯構成;所述第一解碼器和所述第二解碼器均由N個解碼塊和一個分類塊串聯構成;
所述N個解碼塊中的第一個解碼塊的輸入為所述N個編碼塊中的第N個解碼塊的輸出;
所述N個解碼塊中的第i個解碼塊的輸入為第i-1個解碼塊的輸出和所述N個編碼塊中的第N+1-i個解碼塊的輸出;
所述分類塊的輸入為所述N個解碼塊中的第N個解碼塊的輸出。
6.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述分割模型通過如下方法訓練得到:
通過所述分割模型對顯微圖像樣本進行特征提取,得到樣本特征圖像;
通過所述分割模型利用所述樣本特征圖像進行細胞核分割,得到初始的樣本細胞核分割結果;
通過所述分割模型利用所述樣本特征圖像進行輪廓檢測,得到樣本細胞核輪廓檢測結果;
通過所述分割模型以所述初始的樣本細胞核分割結果趨近于所述顯微圖像樣本對應的細胞核標簽,所述樣本細胞核輪廓檢測結果趨近于所述顯微圖像樣本對應的細胞輪廓標簽為目標,對所述分割模型進行參數更新。
7.根據權利要求6所述的方法,其特征在于,所述顯微圖像樣本為通過顯微掃描得到的第一類顯微圖像,或者,通過對所述第一類顯微圖像進行如下任意一種變換得到的第二類顯微圖像:對稱翻轉、旋轉、縮放、扭曲、動態模糊。
8.一種細胞核分割裝置,其特征在于,包括:
特征提取模塊,用于對顯微圖像進行特征提取,得到特征圖像;
分割模塊,用于利用所述特征圖像進行細胞核分割,得到初始的細胞核分割結果;
檢測模塊,用于利用所述特征圖像進行輪廓檢測,得到細胞核輪廓檢測結果;
修正模塊,用于利用所述細胞核輪廓檢測結果對所述初始的細胞核分割結果進行修正,得到最終的細胞核分割結果。
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