[發(fā)明專利]抗原結(jié)合能力根據(jù)化合物的濃度而變化的抗原結(jié)合分子及其文庫

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202010168341.5
• 申請日: 2014-12-04
• 公開（公告）號(hào): CN111304752A
• 公開（公告）日: 2020-06-19
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 井川智之;丹波茂郎;清水駿;辰巳加奈子;門野正次郎;河內(nèi)宏樹;大原一宏;松下正行;江村岳;上村將樹
• 申請（專利權(quán)）人: 中外制藥株式會(huì)社
• 主分類號(hào): C40B40/08
• 分類號(hào): C40B40/08;C40B40/10;C40B50/06;A61K39/395;A61P35/00;A61P29/00
• 代理公司: 中科專利商標(biāo)代理有限責(zé)任公司 11021
• 代理人: 張瑩

1.一種文庫，主要包含：

(i)序列彼此不同的多個(gè)抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域或包含抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域的抗原結(jié)合分子；或

(ii)編碼該序列彼此不同的多個(gè)抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域或包含抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域的抗原結(jié)合分子的核酸；

該文庫的特征在于，所述抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域或抗原結(jié)合分子是抗原結(jié)合活性根據(jù)低分子化合物的濃度而變化的抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域或包含抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域的抗原結(jié)合分子。

2.權(quán)利要求1所述的文庫，其是由包括下述步驟(a)和(b)的方法制造的：

步驟(a)鑒定抗原結(jié)合活性根據(jù)低分子化合物的濃度而變化的抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域或具有低分子化合物結(jié)合活性的抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域中滿足以下(i)至(iii)中任一者以上的氨基酸位點(diǎn)；

(i)未參與結(jié)合該低分子化合物的1個(gè)或多個(gè)氨基酸位點(diǎn)，

(ii)在親本抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域所屬的動(dòng)物種的抗體譜中具有氨基酸出現(xiàn)頻率的多樣性的1個(gè)或多個(gè)氨基酸位點(diǎn)，

(iii)對(duì)于經(jīng)典結(jié)構(gòu)的形成不重要的1個(gè)或多個(gè)氨基酸位點(diǎn)；和

步驟(b)設(shè)計(jì)文庫，該文庫包含：在所述抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域中，編碼未改變體的核酸以及分別編碼在步驟(a)中鑒定的1個(gè)或多個(gè)氨基酸位點(diǎn)具有改變的、序列彼此不同的所述抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域或包含抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域的抗原結(jié)合分子的多個(gè)改變體的核酸。

3.權(quán)利要求2所述的文庫，其是由包括下述步驟(a)至(d)的方法制造的：

步驟(a)鑒定抗原結(jié)合活性根據(jù)低分子化合物的濃度而變化的抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域或具有低分子化合物結(jié)合活性的抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域中滿足以下(i)至(iii)中任一者以上的氨基酸位點(diǎn)；

(i)未參與結(jié)合該低分子化合物的1個(gè)或多個(gè)氨基酸位點(diǎn)，

(ii)在親本抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域所屬的動(dòng)物種的抗體譜中具有氨基酸出現(xiàn)頻率的多樣性的1個(gè)或多個(gè)氨基酸位點(diǎn)，

(iii)對(duì)于經(jīng)典結(jié)構(gòu)的形成不重要的1個(gè)或多個(gè)氨基酸位點(diǎn)；

步驟(b)制作在步驟(a)中鑒定的1個(gè)或多個(gè)氨基酸位點(diǎn)具有改變的、序列彼此不同的所述抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域或包含抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域的抗原結(jié)合分子的多個(gè)改變體；

步驟(c)鑒定實(shí)質(zhì)上不對(duì)所述各改變體的該低分子化合物結(jié)合活性造成變化的1個(gè)或多個(gè)氨基酸的改變；和

步驟(d)制造文庫，該文庫包含：編碼未改變體的核酸以及編碼在步驟(c)中鑒定的1個(gè)或多個(gè)氨基酸具有改變的、序列彼此不同的所述抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域或包含抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域的抗原結(jié)合分子的多個(gè)改變體的核酸。

4.權(quán)利要求1所述的文庫，其是由包括下述步驟1)和2)的方法制造的：

步驟1)使包含多個(gè)抗原結(jié)合分子的文庫與低分子化合物接觸，所述抗原結(jié)合分子具有低分子化合物結(jié)合活性；和

步驟2)由該文庫濃縮核酸，所述核酸編碼具有低分子化合物結(jié)合活性的抗原結(jié)合分子的多個(gè)改變體。

5.權(quán)利要求4所述的文庫，其中，所述抗原結(jié)合分子是包含抗體的重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū)的抗原結(jié)合分子，且是通過包括下述步驟1)至3)的任1步驟的方法制造的：

步驟1)從權(quán)利要求4所述的文庫濃縮編碼具有低分子化合物結(jié)合活性的抗原結(jié)合分子的多個(gè)改變體的核酸來設(shè)計(jì)文庫，其中權(quán)利要求4所述的文庫是包含編碼位于重鏈可變區(qū)的氨基酸經(jīng)改變的1個(gè)或多個(gè)改變體的核酸的文庫；

步驟2)從權(quán)利要求4所述的文庫濃縮編碼具有低分子化合物結(jié)合活性的抗原結(jié)合分子的多個(gè)改變體的核酸來設(shè)計(jì)文庫，其中權(quán)利要求4所述的文庫是包含編碼位于輕鏈可變區(qū)的氨基酸經(jīng)改變的1個(gè)或多個(gè)改變體的核酸的文庫；

步驟3)組合由步驟1)和步驟2)的各可變區(qū)文庫濃縮得到的編碼抗原結(jié)合分子的核酸，由此設(shè)計(jì)文庫。

6.權(quán)利要求1至5中任一項(xiàng)所述的文庫，其特征在于，所述抗原結(jié)合分子是抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域與病毒外殼蛋白的至少一部分的融合多肽。

7.權(quán)利要求1至5中任一項(xiàng)所述的文庫，其中，所述抗原結(jié)合分子是包含抗體的重鏈和輕鏈的抗原結(jié)合分子，且該文庫進(jìn)一步包括設(shè)計(jì)所述重鏈和/或輕鏈的合成文庫的步驟。