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[發明專利]ceRNA競爭模塊識別方法、裝置、電子設備及存儲介質有效

專利信息
申請號: 202010158035.3 申請日: 2020-03-09
公開(公告)號: CN111383709B 公開(公告)日: 2021-06-08
發明(設計)人: 張俊鵬;饒妮妮;王光斌 申請(專利權)人: 電子科技大學;大理大學
主分類號: G16B20/00 分類號: G16B20/00;G06K9/62
代理公司: 四川省成都市天策商標專利事務所 51213 代理人: 龔海月
地址: 610000 四川省成*** 國省代碼: 四川;51
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: cerna 競爭 模塊 識別 方法 裝置 電子設備 存儲 介質
【權利要求書】:

1.一種ceRNA競爭模塊識別方法,其特征在于,包括:

分別根據核糖核酸RNA1的表達矩陣和RNA2的表達矩陣獲取所述RNA1基因模塊和所述RNA2基因模塊,其中,所述RNA1和所述RNA2為微小核糖核酸miRNA靶基因;

根據先驗的miRNA-靶基因調控關系數據、miRNA表達矩陣、所述RNA1基因模塊和所述RNA2基因模塊,分別獲取RNA1-RNA1模塊的共享miRNAs顯著性值、典型相關系數值、敏感典型相關系數值和RNA2-RNA2模塊的共享miRNAs顯著性值、典型相關系數值、敏感典型相關系數值,從這些值識別得到滿足條件的內部ceRNA競爭模塊;

根據先驗的miRNA-靶基因調控關系數據、miRNA表達矩陣、所述RNA1基因模塊和所述RNA2基因模塊,分別獲取RNA1-RNA2模塊的共享miRNAs顯著性值、典型相關系數值、敏感典型相關系數值,從這些值識別得到滿足條件的外部ceRNA競爭模塊。

2.如權利要求1所述的方法,其特征在于,從RNA1-RNA1模塊和RNA2-RNA2模塊的共享miRNAs顯著性值、典型相關系數值、敏感典型相關系數值識別得到滿足條件的內部ceRNA競爭模塊,包括:

若所述RNA1-RNA1模塊和所述RNA2-RNA2模塊的所述共享miRNAs顯著性值小于第一閾值,所述典型相關系數值大于第二閾值,所述敏感典型相關系數值大于第三閾值,則確認所述RNA1-RNA1模塊和所述RNA2-RNA2模塊分別為所述RNA1-RNA1內部競爭模塊和所述RNA2-RNA2內部競爭模塊。

3.如權利要求1所述的方法,其特征在于,從RNA1-RNA2模塊的共享miRNAs顯著性值、典型相關系數值、敏感典型相關系數值識別得到滿足條件的外部ceRNA競爭模塊,包括:

若所述RNA1-RNA2模塊的所述共享miRNAs顯著性值小于第一閾值,所述典型相關系數值大于第二閾值,所述敏感典型相關系數值大于第三閾值,則確認所述RNA1-RNA2模塊為所述RNA1-RNA2外部競爭模塊。

4.一種電子設備,其特征在于,包括處理器、存儲介質和總線,所述存儲介質存儲有所述處理器可執行的機器可讀指令,當所述電子設備運行時,所述處理器與所述存儲介質之間通過所述總線通信,所述處理器執行所述機器可讀指令,以執行權利要求1-3任一項所述方法的步驟。

5.一種計算機可讀存儲介質,所述計算機可讀存儲介質上存儲有計算機程序,其特征在于,所述計算機程序被處理器運行時執行權利要求1-3任一項所述方法的步驟。

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