[發明專利]血液骨架蛋白基因甲基化作為腦卒中早期診斷的潛在標志物有效
| 申請號: | 202010156358.9 | 申請日: | 2020-03-09 |
| 公開(公告)號: | CN113373209B | 公開(公告)日: | 2023-03-28 |
| 發明(設計)人: | 楊蓉西;沈沖;劉春蘭;尹啟明 | 申請(專利權)人: | 南京騰辰生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;G16B5/00;G16H50/20 |
| 代理公司: | 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245 | 代理人: | 張立娜 |
| 地址: | 210032 江蘇省南京市江*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 血液 骨架 蛋白 基因 甲基化 作為 腦卒中 早期 診斷 潛在 標志 | ||
1.甲基化ACTB基因作為標志物在制備產品中的應用;所述產品具有如下任一功能:
(1)輔助診斷腦卒中;
(2)在臨床癥狀之前預警卒中。
2.根據權利要求1所述的應用,其特征在于:所述甲基化ACTB基因為ACTB基因中如下(e1)-(e5)所示片段中全部或部分CpG位點甲基化;
(e1)SEQ ID No.1所示的DNA片段;
(e2)SEQ ID No.2所示的DNA片段;
(e3)SEQ ID No.3所示的DNA片段;
(e4)SEQ ID No.4所示的DNA片段;
(e5)SEQ ID No.5所示的DNA片段。
3.根據權利要求2所述的應用,其特征在于:所述“全部或部分CpG位點”為如下任一:
(f1)SEQ ID No.1所示的DNA片段自5’端第128-129位所示CpG位點、SEQ ID No.1所示的DNA片段自5’端第180-181位所示CpG位點、SEQ ID No.1所示的DNA片段自5’端第231-232位所示CpG位點、SEQ ID No.1所示的DNA片段自5’端第313-314位所示CpG位點、SEQ IDNo.1所示的DNA片段自5’端第362-363位所示CpG位點、SEQ ID No.1所示的DNA片段自5’端第367-368位所示CpG位點,或SEQ ID No.1所示的DNA片段自5’端第428-429位所示CpG位點;
(f2)SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第53-54位所示CpG位點、SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第57-58位所示CpG位點、SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第125-126位所示CpG位點、SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第232-233位所示CpG位點、SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第260-261位所示CpG位點,或SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第283-284位所示CpG位點;
(f3)SEQ ID No.3所示的DNA片段自5’端第61-62位所示CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段自5’端第87-88位所示CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段自5’端第103-104位所示CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段自5’端第147-148位所示CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段自5’端第171-172位所示CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段自5’端第186-187位所示CpG位點,或SEQ ID No.3所示的DNA片段自5’端第238-239位所示CpG位點;
(f4)SEQ ID No.4所示的DNA片段自5’端第39-40位所示CpG位點、SEQ ID No.4所示的DNA片段自5’端第41-42位所示CpG位點、SEQ ID No.4所示的DNA片段自5’端第69-70位所示CpG位點、SEQ ID No.4所示的DNA片段自5’端第107-108位所示CpG位點、SEQ IDNo.4所示的DNA片段自5’端第110-111位所示CpG位點、SEQ ID No.4所示的DNA片段自5’端第139-140位所示CpG位點、SEQ ID No.4所示的DNA片段自5’端第185-186位所示CpG位點,或SEQ IDNo.4所示的DNA片段自5’端第275-276位所示CpG位點;
(f5)SEQ ID No.5所示的DNA片段自5’端第44-45位所示CpG位點、SEQ ID No.5所示的DNA片段自5’端第175-176位所示CpG位點、SEQ ID No.5所示的DNA片段自5’端第266-267位所示CpG位點,或SEQ ID No.5所示的DNA片段自5’端第300-301位所示CpG位點;
(f6)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點和SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點;
(f7)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點和SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點;
(f8)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點和SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點;
(f9)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f10)SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點和SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點;
(f11)SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點和SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點;
(f12)SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f13)SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點和SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點;
(f14)SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f15)SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f16)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點、SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點和SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點;
(f17)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點、SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點和SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點;
(f18)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點、SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f19)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點和SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點;
(f20)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f21)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點、SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f22)SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點和SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點;
(f23)SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f24)SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點、SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f25)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點、SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點和SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點;
(f26)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點、SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f27)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點、SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點、SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f28)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點、SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f29)SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點、SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
(f30)SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點、SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點、SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點、SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點和SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點;
在(f6)-(f30)中,所述SEQ ID No.1所示的DNA片段的9個可區分CpG位點為:SEQ IDNo.1自5’端第128-129位所示CpG位點;第180-181位所示CpG位點;第203-204位所示CpG位點;第231-232位所示CpG位點;第313-314位所示CpG位點;第338-339位所示CpG位點;第362-363位和第367-368位所示CpG位點;第406-407位所示CpG位點;第428-429位所示CpG位點;
所述SEQ ID No.2所示的DNA片段的7個可區分CpG位點為:SEQ ID No.2自5’端第53-54位和第57-58位所示CpG位點;第96-97位和第101-102位所示CpG位點;第125-126位所示CpG位點;第232-233位所示CpG位點;第260-261位所示CpG位點;第283-284位所示CpG位點;第335-336位所示CpG位點;
所述SEQ ID No.3所示的DNA片段的12個可區分CpG位點為SEQ ID No.3自5’端第25-26位、第27-28位、第29-30位、32-33位和45-46位所示CpG位點;第61-62位所示CpG位點;第63-64位、第66-67位和第81-82位所示CpG位點;第87-88位和第103-104位所示CpG位點;第105-106位、第109-110位和第119-120位所示CpG位點;第147-148位所示CpG位點;第149-150位和第165-166位所示CpG位點;第171-172位所示CpG位點;第186-187位所示CpG位點;第192-193位、第194-195位、第198-199位和第201-202位所示CpG位點;第211-212位和第216-217位所示CpG位點;第238-239位所示CpG位點;
所述SEQ ID No.4所示的DNA片段的11個可區分CpG位點為SEQ ID No.4自5’端第39-40位和第41-42位所示CpG位點;第61-62位和第65-66位所示CpG位點;第69-70位所示CpG位點;第77-78位和第81-82位所示CpG位點;第107-108位和第110-111位所示CpG位點;第122-123位所示CpG位點;第139-140位所示CpG位點;第185-186位所示CpG位點;第213-214位和第219-220位所示CpG位點;第275-276位所示CpG位點;第304-305位所示CpG位點;
所述SEQ ID No.5所示的DNA片段的5個可區分CpG位點為:SEQ ID No.5自5’端第44-45位所示CpG位點;第175-176位所示CpG位點;第266-267位所示CpG位點;第292-293位所示CpG位點;第300-301位所示CpG位點。
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