[發明專利]KRT14基因中與雞蛋蛋殼品質性狀相關的單倍型標記與應用

有效

• 申請號: 202010154602.8
• 申請日: 2020-03-08
• 公開（公告）號: CN111286543B
• 公開（公告）日: 2021-04-06
• 發明（設計）人: 吳艷;皮勁松;孫靜;張昊;肖紅衛;程詩彬;潘愛鑾;沈濤濤;黃濤;申杰;梁振華;杜金平;蒲躍進
• 申請（專利權）人: 湖北省農業科學院畜牧獸醫研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 武漢智嘉聯合知識產權代理事務所(普通合伙) 42231
• 代理人: 江慧

本發明提供了KRT14基因中與雞蛋蛋殼品質性狀相關的單倍型標記與應用，所述的單倍型標記位于雞KRT14基因的部分DNA序列中，所述單倍型標記的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，所述單倍型標記包括第184bp處存在T/C多態性位；第215bp處存在T/C多態性位點；第275bp處存在A/C多態性位點；第277bp處存在A/G多態性位點；本發明還提供了SNP檢測試劑盒，包括：如SEQ ID NO.2～3所示的引物對。本發明首次發掘了雞KRT14基因中與蛋殼品質性狀相關的單倍型標記，為蛋殼品質性狀的標記輔助育種提供了一個新的分子育種標記。

技術領域

本發明涉及單倍型標記篩選技術領域，尤其涉及KRT14基因中與雞蛋蛋殼品質性狀相關的單倍型標記與應用。

背景技術

雞蛋富含蛋白質、脂肪、卵磷脂等人體所需的多種營養物質，是我國居民飲食結構中的重要組成部分。但是雞蛋在收購、儲運和加工過程中約有6％-10％因為破損而直接損失掉，造成了嚴重的經濟損失。研究表明，雞蛋損失的主要原因是蛋殼薄，蛋殼破損或裂紋所引起的。蛋殼厚度、蛋殼強度、蛋殼百分比以及蛋比重是蛋殼質量的重要檢測指標，也是影響雞蛋儲運的重要因素。蛋殼厚度、蛋殼百分比、蛋比重與蛋殼強度的相關性系數分別為0.79、0.76、0.62，這表明，蛋殼厚度、蛋殼百分比、蛋比重比的值越大，蛋殼強度就越大。隨著我國居民生活水平的持續提高，對雞蛋的需求量也上升，預計到2035年，我國人均消費雞蛋的數量將達到363個/年，基本是每人每天消費一枚雞蛋。因此，如何提高蛋殼質量，提高蛋殼厚度和強度，減少在儲運過程中的損失顯得尤為重要。

單核苷酸多態性(Single Nucleotide Polymorphsim，SNP)是指基因組DNA序列中由于單個核苷酸(A、T、C或G)的突變而引起的多態性，包括單堿基的插入、缺失、轉化和顛換等。全基因組關聯分析(Gemome-Wide Association Study，GWAS)是應用基因組中數以百萬計的SNP為分子遺傳標記，進行全基因組水平的對照分析和相關分析。大量SNP標記的出現，使得以單個標記為中心的關聯分析方法逐漸轉變為以單倍型(haplotype)為主的關聯分析方法。單倍型是指在同一染色體上或一定區域內若干個決定同一性狀的且緊密相連鎖的SNPs，具有統計學關聯性。SNP標記及其組成的單倍型由于分布的廣泛性和穩定性，在動物分子標記輔助選擇(Marker Assisted Selection，MAS)育種上發揮著重要作用，成為加快蛋雞蛋殼品質性狀尤其是那些限性性狀遺傳改良的可行性技術。基于此，進一步鑒定與蛋雞經濟性狀相關的SNP標記及其單倍型組合，進而借助SNP標記及其單倍型組合序列作為篩選標記用于優良蛋雞經濟性狀的輔助選擇上，將大大提高選種的準確性，對于培育具有優良經濟性狀的蛋雞品種具有一定的意義。

角蛋白14(Keratin 14，KTR14)屬于富含半胱氨基酸殘基的I型(酸性)角蛋白，與角蛋白5組成角蛋白對，具有維持細胞形態和完整性的作用。已有研究表明KRT14與中間絲纖維蛋白有親緣關系，是人類癌癥發生、發展的上皮性標記物，與人的單純型大皰性表皮松解癥、肺損傷嚴重程度等密切相關。然而，KRT14基因在蛋雞上的研究卻未見報道，迄今為止，尚無有關蛋雞KRT14基因作為雞蛋蛋殼品質性狀的分子標記的研究。

發明內容

本發明的目的在于克服現有技術之缺陷，提供了KRT14基因中與雞蛋蛋殼品質性狀相關的單倍型標記與應用，本發明發掘了KRT14基因中與雞蛋蛋殼品質性狀相關的單倍型標記，為蛋殼品質性狀的單倍型標記輔助育種提供了一種新的單倍型標記。

本發明的目的之一在于提供一種KRT14基因中與雞蛋蛋殼品質性狀相關的單倍型標記，所述的單倍型標記位于位于蛋雞KRT14基因部分編碼區序列中，所述的單倍型標記的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，該序列長度為993bp，所述單倍型標記包括：

SNP1位點：在SEQ ID NO.1所示序列中第184bp處存在T/C多態性位；

SNP2位點：在SEQ ID NO.1所示序列中第215bp處存在T/C多態性位點；