[發(fā)明專利]基于單堿基替換特征的腫瘤標志物篩選方法及應(yīng)用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010151690.6 | 申請日： | 2020-03-06 |
| 公開（公告）號： | CN113362884A | 公開（公告）日： | 2021-09-07 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 張清政;白健;吳琳 | 申請（專利權(quán)）人： | 福建和瑞基因科技有限公司 |
| 主分類號： | G16B5/00 | 分類號： | G16B5/00;G16B20/20;G16B20/30;G16B20/50;G16B40/00;C12Q1/6886;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京超凡宏宇專利代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人： | 潘浩 |
| 地址： | 350000 福建省福州市長*** | 國省代碼： | 福建;35 |
| 權(quán)利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 基于 堿基 替換 特征 腫瘤 標志 篩選 方法 應(yīng)用 | ||
1.一種腫瘤標志物或其組合的篩選方法，所述方法滿足以下條件：
1)利用包含單堿基替換特征在內(nèi)的一種或多種指標篩選腫瘤相關(guān)標志物；和/或
2)包含檢測單堿基替換特征的步驟。
2.一種腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷模型的構(gòu)建方法，其特征在于，所述構(gòu)建方法使用如權(quán)利要求1所述的篩選方法篩選得到的腫瘤標志物或其組合構(gòu)建所述腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷模型。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法獲得的腫瘤標志物的組合。
4.一種腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷方法，其特征在于，所述方法：
1)包括使用腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷模型的步驟，所述腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷模型是根據(jù)權(quán)利要求2所述的構(gòu)建方法構(gòu)建的腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷模型；和/或
2)使用如權(quán)利要求1所述的篩選方法得到的腫瘤標志物或其組合或者根據(jù)權(quán)利要求3所述的腫瘤標志物的組合。
5.用于特異性檢測腫瘤標志物或其組合的試劑在制備腫瘤風險預(yù)測試劑盒、篩查試劑盒和/或診斷試劑盒中的用途，其特征在于，所述腫瘤標志物或其組合是根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法得到的腫瘤標志物或其組合，或者是根據(jù)權(quán)利要求3所述的腫瘤標志物的組合，或者是根據(jù)權(quán)利要求2所述的構(gòu)建方法構(gòu)建的腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷模型中的腫瘤標志物或其組合。
6.一種腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包含用于特異性檢測腫瘤標志物或其組合的試劑，所述腫瘤標志物或其組合是根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法得到的腫瘤標志物或其組合，或者是根據(jù)權(quán)利要求3所述的腫瘤標志物組合，或者是根據(jù)權(quán)利要求2所述的構(gòu)建方法構(gòu)建的腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷模型中的腫瘤標志物或其組合。
7.一種用于腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷的系統(tǒng)或裝置，其特征在于，所述系統(tǒng)或裝置包括：
獲取模塊，用于獲取受試者的腫瘤標志物或其組合的測定數(shù)據(jù)，所述腫瘤標志物或其組合是根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法得到的腫瘤標志物或其組合，或者是根據(jù)權(quán)利要求3所述的腫瘤標志物的組合，或者是根據(jù)權(quán)利要求2所述的構(gòu)建方法構(gòu)建的腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷模型中的腫瘤標志物或其組合，所述測定數(shù)據(jù)是單堿基替換特征；
數(shù)據(jù)分析模塊，用于將所述腫瘤標志物或其組合的測定數(shù)據(jù)輸入根據(jù)權(quán)利要求2所述的構(gòu)建方法構(gòu)建的腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷模型中，以得出篩查結(jié)果。
8.一種計算機可讀存儲介質(zhì)，其包括存儲的計算機程序，所述計算機程序包含：
1)用于執(zhí)行如權(quán)利要求1所述的腫瘤標志物或其組合的篩選方法的程序；和/或
2)用于執(zhí)行如權(quán)利要求2所述的腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷模型的構(gòu)建方法的程序；和/或
3)用于執(zhí)行如權(quán)利要求4所述的癌癥風險預(yù)測、篩查和/或診斷方法的程序。
9.一種設(shè)備，其包括處理器、存儲器以及存儲在所述存儲器中的計算機程序，所述計算機程序包含：
1)用于執(zhí)行根據(jù)權(quán)利要求1所述的腫瘤標志物或其組合的篩選方法的程序；和/或
2)用于執(zhí)行根據(jù)權(quán)利要求2所述的腫瘤風險預(yù)測、篩查和/或診斷模型的構(gòu)建方法的程序；和/或
3)用于執(zhí)行根據(jù)權(quán)利要求4所述的癌癥風險預(yù)測、篩查和/或診斷方法的程序。
10.一種單堿基替換特征的量化方法，其特征在于，使用單堿基替換類型的豐度、單堿基替換類型的出現(xiàn)位點數(shù)、單堿基替換類型的讀段(read)支持數(shù)或者單堿基替換類型的占比對所述單堿基替換特征進行量化。
該專利技術(shù)資料僅供研究查看技術(shù)是否侵權(quán)等信息，商用須獲得專利權(quán)人授權(quán)。該專利全部權(quán)利屬于福建和瑞基因科技有限公司，未經(jīng)福建和瑞基因科技有限公司許可，擅自商用是侵權(quán)行為。如果您想購買此專利、獲得商業(yè)授權(quán)和技術(shù)合作，請聯(lián)系【客服】
本文鏈接：http://www.szxzyx.cn/pat/books/202010151690.6/1.html，轉(zhuǎn)載請聲明來源鉆瓜專利網(wǎng)。
