[發明專利]綿羊GHR基因插入/缺失多態性的檢測引物對、試劑盒、方法和應用

有效

• 申請號: 202010135539.3
• 申請日: 2020-03-02
• 公開（公告）號: CN111154895B
• 公開（公告）日: 2023-04-28
• 發明（設計）人: 張清峰;藍康澍;潘傳英;曹如;林春建;郝坤杰;韓旭飛;蘭天鑫
• 申請（專利權）人: 天津奧群牧業有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 天津盛理知識產權代理有限公司 12209
• 代理人: 李晶

本發明涉及一種綿羊GHR基因插入/缺失多態性檢測用引物對，所述引物對能夠用于PCR擴增綿羊GHR基因NC_019473.1:g.31984400_31984422位23?bp插入/缺失多態性位點。本發明能夠簡單、快速、低成本、精確地檢測所述插入/缺失多態性位點的基因型，檢測的插入/缺失多態性位點能夠作為綿羊產羔數的分子標記位點，從而加快建立產羔數性狀優良的綿羊種群，提高良種選育速度。

技術領域

本發明屬于生物技術與家畜育種技術領域，尤其是一種綿羊GHR基因插入/缺失多態性的檢測引物對、試劑盒、方法和應用。

背景技術

綿羊以其產肉、產奶和產絨性能深受消費者的喜愛，隨著人們生活水平的提高，社會對羊肉、羊奶、羊絨等產品的需求越來越高。為了實現高產、優質和高效的綿羊育種目標，人們對綿羊的研究已在分子水平上，以DNA的多態性為標記對綿羊進行基因結構和功能的遺傳分析和研究，通過篩查與綿羊產羔數性狀密切相關的DNA標記位點并進行檢測，并根據其基因多態性與產羔數性狀的關聯，從而可以加快建立優良產羔數性狀綿羊種群，這類標記具有存在較為普遍、遺傳穩定、準確度高等優點，因而被廣泛應用于各個領域。

分子標記輔助選擇(MAS)作為分子遺傳標記的常用方法，通過對目標基因所連鎖的分子標記的基因型分析從而進行育種，使用這種方法可以大幅度地縮短育種年限，針對某一性狀專一選擇，從而能夠有效地提高育種效率。

近年來，隨著測序技術的不斷升級與測序成本的降低，插入/缺失(indel)突變作為一種重要的分子遺傳標記而逐漸受到人們的重視。插入和缺失(InDels)構成自然突變庫的重要組成部分，InDels是由于聚合酶滑移、轉座子、不均等交叉等導致的在整個基因組中大量分布的結構，有時可能導致生物體功能的獲得或喪失。InDels最常見的類別包括單堿基對插入和缺失，單體堿基對擴展和多堿基對擴展，然而在基因組中包含隨機序列和轉座子插入的InDel相對較少。由于可以簡單地使用凝膠對InDels進行基因分型鑒定，使InDels更具價值。在以前的一些研究中，還發現InDels比微衛星標記更具多態性。如今，InDels已在多種應用中使用，包括種群遺傳學、分類學診斷標記、遺傳圖譜構建和不同農作物中的關聯圖譜，在動物繁殖性狀的選育方面的indel標記的研究和應用較少。在羊上已有的部分關于indels的報道顯示：在生長方面，有報道在陜北白絨山羊KDM6A基因內含子區域存在一個16bp的indel可以顯著地影響山羊的體高、胸深、體長等生長性狀(Wang.et?al.,2018)；在繁殖方面，有報道山羊CTNNB1存在一26bp的indel與山羊第一胎產羔數極顯著相關(Zhang.et?al.,2018)；還有chen等對山羊SPEF2三個indel位點進行了關聯分析，發現SPEF12對山羊的產羔數有顯著影響(chen?et?al.,2018)。這些研究都表明InDels對動物分子育種具有重要的意義和參考價值。

生長激素受體(growth?hormone?receptor,GHR)基因生長激素受體(growthhormone?receptor，GHR)是Ⅰ類細胞因子受體超家族(classⅠcytokine?receptorsuperfamily)中的一員，大多數哺乳動物GHR基因由10個外顯子和9個內含子組成。