[發明專利]一種基于lncRNA評分體系在預測腫瘤免疫治療效果中的應用

有效

• 申請號: 202010134831.3
• 申請日: 2020-03-02
• 公開（公告）號: CN111321225B
• 公開（公告）日: 2021-08-17
• 發明（設計）人: 姚和瑞;宋爾衛;余運芳;區綺云;李岸霖;張文達
• 申請（專利權）人: 中山大學孫逸仙紀念醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 廣州三環專利商標代理有限公司 44202
• 代理人: 顏希文

1.一組預測腫瘤免疫治療療效或預后的lncRNA，其特征在于，由以下lncRNA組成：DLGAP1-AS1、RAMP2-AS1、BVES-AS1、LIPE-AS1、LINC01118、FGD5-AS1、AL513365.2、EMC1-AS1、FTX、SNHG15、TMEM147-AS1、TTN-AS1、FLG-AS1、CDKN2B-AS1、USP2-AS1、SBF2-AS1、AC113382.1、NOP14-AS1、AC012636.1、LINC01605、PCAT1、BRWD1-AS2、USP3-AS1、VPS9D1-AS1、AC093249.6、SNHG8、FUT8-AS1、NKILA、SLFNL1-AS1。

2.一種預測腫瘤免疫治療療效或預后的評分體系的構建方法，其特征在于，通過以下步驟實現：

(1)收集腫瘤患者數據；具體方法為：收集腫瘤患者所有lncRNA基因表達、CTL表達、腫瘤微環境免疫分子表達和基因表達數據及患者的生存預后信息數據；

(2)篩選與接受免疫治療患者的生存具有顯著相關性的長鏈非編碼RNA(lncRNA)；具體方法為：通過單變量Cox回歸模型檢驗篩選lncRNA，當其P值0.05時，認定該lncRNA與接受免疫治療患者的生存具有顯著相關性；最終篩選出如所述權利要求1所述的29個lncRNA；

(3)獲得lncRNA評分公式，即為本發明可預測腫瘤免疫治療療效或預后的評分體系；所述lncRNA評分公式為：

LncRNA得分＝–(DLGAP1-AS1×0.0388404669)–(RAMP2-AS1×0.1155662963)–(BVES-AS1×0.0553720312)–(LIPE-AS1×0.1033882346)+(LINC01118×0.0796557151)–(FGD5-AS1×0.0289597115)–(AL513365.2×0.20586808)–(EMC1-AS1×0.0694844742)+(FTX×0.0852566063)+(SNHG15×0.1004314629)–(TMEM147-AS1×0.0720185014)+(TTN-AS1×0.0540188921)+(FLG-AS1×0.0526396975)–(CDKN2B-AS1×0.0064524961)+(USP2-AS1×0.0747066713)–(SBF2-AS1×0.1293691962)–(AC113382.1×0.2179618875)+(NOP14-AS1×0.0644565543)+(AC012636.1×0.1939511817)–(LINC01605×0.0168478032)+(PCAT1×0.1453946597)+(BRWD1-AS2×0.0298250867)–(USP3-AS1×0.0691270103)+(VPS9D1-AS1×0.0003103997)–(AC093249.6×0.0139283015)–(SNHG8×0.0014401603)–(FUT8-AS1×0.0852427371)+(NKILA×0.1318600645)–(SLFNL1-AS1×0.0472823654)。

3.如權利要求2所述的方法，其特征在于，所述步驟(3)中建立lncRNA評分公式的具體方法為：使用LASSO算法從步驟(2)篩選出的lncRNA中鑒定出29個lncRNA以構建有效的評分體系。