[發明專利]一種先天性心臟病基因拷貝數變異及易感者篩選的多重連接探針擴增探針組合及試劑盒

在審

• 申請號: 202010133425.5
• 申請日: 2020-02-27
• 公開（公告）號: CN111334568A
• 公開（公告）日: 2020-06-26
• 發明（設計）人: 黃際衛;唐寧;曾定元;崖嬌練;羅穎花;李靜文
• 申請（專利權）人: 柳州市婦幼保健院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6844;C12N15/11
• 代理公司: 南寧新途專利代理事務所(普通合伙) 45119
• 代理人: 方明

1.一種先天性心臟病基因拷貝數變異及易感者篩選的多重連接探針擴增探針組合，其特征在于：所述多重連接探針擴增探針組合分別是針對內參基因GAPDH，目標基因MALAT1的rs619586位點、NKX2-6、GATA1、SON、TBX1、RCAN1、GJA5、DGCR8、SRY、TBX6、NHS、CRKL、GATA6、MYH11、DTNA而設計的特異性序列；所述多重連接探針擴增探針組共有17組，其中，針對GAPDH基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示，針對MALAT1基因rs619586位點AA型多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ IDNO:3和SEQ ID NO:4所示，針對MALAT1基因rs619586位點GG型多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示，針對NKX2-6基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示，針對GATA1基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示，針對SON基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12所示，針對TBX1基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14所示，針對RCAN1基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16所示，針對GJA5基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18所示，針對DGCR8基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:19和SEQID NO:20所示，針對SRY基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:22所示，針對TBX6基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ IDNO:23和SEQ ID NO:24所示，針對NHS基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26所示，針對CRKL基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:28所示，針對GATA6基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:29和SEQ ID NO:30所示，針對MYH11基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:31和SEQ ID NO:32所示，針對DTNA基因的多重連接探針擴增探針組合的核苷酸序列如SEQ ID NO:33和SEQ ID NO:34所示。

2.一種先天性心臟病基因拷貝數變異及易感者篩選基因標志物的試劑盒，其特征在于：其包括權利要求1所述的多重連接探針擴增探針組合和通用引物，所述通用引物中，正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:35，反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:36所示。

3.一種先天性心臟病基因拷貝數變異及易感者篩選基因標志物的檢測方法，其特征在于：其使用權利要求1或2任一所述的多重連接探針擴增探針組合或試劑盒實現。

4.根據權利要求3所述的一種先天性心臟病基因拷貝數變異及易感者篩選基因標志物的檢測方法，所述使用方法為非治療和診斷目的的方法，其特征在于：所述使用權利要求1或2任一所述的多重連接探針擴增探針組合或試劑盒實現包括：

提取待測樣本的DNA溶液后，進行變性處理，得到變性后的基因組DNA；

利用所述多重連接探針擴增探針組合或試劑盒中的多重連接探針擴增探針組合與變性后的基因組DNA進行雜交連接反應，獲得連接產物；

將得到連接產物進行PCR反應后，對PCR擴增產物進行毛細管電泳，得到毛細管電泳結果；

對毛細管電泳結果進行分析后，判斷待測樣本是否發生先天性心臟病基因拷貝數變異。