[發明專利]一種檢測人類免疫缺陷病毒的試劑盒在審
| 申請號: | 202010128132.8 | 申請日: | 2020-02-28 |
| 公開(公告)號: | CN111206117A | 公開(公告)日: | 2020-05-29 |
| 發明(設計)人: | 劉一博;金鑫浩;任魯風;張未來;于軍 | 申請(專利權)人: | 寧波胤瑞生物醫學儀器有限責任公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/93 |
| 代理公司: | 北京精金石知識產權代理有限公司 11470 | 代理人: | 張黎 |
| 地址: | 315300 浙江省寧波市慈溪*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 人類 免疫 缺陷 病毒 試劑盒 | ||
1.一種檢測人類免疫缺陷病毒的試劑盒,其特征在于,所述的試劑盒包括引物探針預混液;
所述的引物探針預混液包括HIV-cDNA的引物對、人GAPDH基因的引物對、HIV-cDNA的熒光探針和人GAPDH基因的熒光探針;
所述HIV-cDNA的引物對為:
上游引物:5’-TTGACTAGCGGAGGCTAGA-3’;
下游引物:5’-CCCTGGCCTTAACCGAAT-3’;
所述人GAPDH基因的引物對為:
上游引物:5’-CTAGCTGGCCCGATTTCTCC-3’;
下游引物:5’-CGCCCAATACGACCAAATCAGA-3’;
所述HIV-cDNA的熒光探針的核苷酸序列為:
5’-CTGACGCTC+TCGCACCCATCTCTC-3’;
所述人GAPDH基因的熒光探針的核苷酸序列為:
5’-TCCGGGTGA+TGCTTTTCCTAGA-3’;
其中“+”表示3’端的堿基為鎖核酸修飾堿基。
2.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述HIV-cDNA和/或人GAPDH基因的熒光探針的5’端含有熒光報告基團FAM和/或CY3,3’端含有熒光淬滅基團BHQ-1和/或BHQ-2。
3.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述的HIV-cDNA的熒光探針的5’端含有熒光報告基團FAM,3’端含有熒光淬滅基團BHQ-1;
所述的人GAPDH基因的熒光探針的5’端含有熒光報告基團CY3,3’端含有熒光淬滅基團BHQ-2。
4.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述的引物探針預混液中用于檢測HIV-cDNA的引物對、人GAPDH基因的引物對、HIV-cDNA的熒光探針和人GAPDH基因的熒光探針的濃度比為2:2:1:1。
5.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述的試劑盒還包括陽性質控品和陰性質控品;
所述的陽性質控品是由包含20000copies/μL的HIV-cDNA片段的質粒與等體積的10ng/μL的人正常T淋巴細胞系DNA混合而成;所述的陰性質控品是10ng/μL的人正常T淋巴細胞系DNA。
6.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述的試劑盒還包括反應預混液:dATP、dCTP、dGTP、dUTP、BSA、熱啟動Taq酶、尿嘧啶-DNA-糖基酶、ROX、TritonX-100和熱穩定焦磷酸酶。
7.根據權利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述的反應預混液中dATP、dCTP、dGTP、dUTP濃度均為0.4mM,BSA濃度為10μg/μL,ROX濃度為100nM,TritonX-100濃度百分比為0.2%,熱穩定焦磷酸酶為0.2U。
8.根據權利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述的熱啟動Taq酶和尿嘧啶-DNA-糖基酶的濃度比為0.5-1.5:1。
9.根據權利要求1-8任意一項所述的試劑盒在芯片式數字PCR平臺上檢測HIV-cDNA中的應用。
10.一種利用權利要求1-8任意一項所述的試劑盒檢測人類免疫缺陷病毒的方法,其特征在于,所述的方法包括如下步驟:
(1)制備數字PCR反應體系:將待測的DNA模板與權利要求1-8任意一項所述的試劑盒中的引物探針預混液和反應預混液混合,得到數字PCR反應體系;
所述的PCR反應體系中待測的DNA模板、引物探針預混液、反應預混液的體積比為1:2:4-6;
(2)根據步驟(1)得到的數字PCR反應體系,制作PCR微反應單元,進行PCR擴增反應,得到擴增產物;
擴增條件為:37℃UDG消化300s,95℃熱啟動10min,1個循環;95℃變性15s,60℃延伸45s,共進行40個循環;10℃終止反應;
(3)對步驟(2)得到的擴增產物進行熒光信號收集,根據熒光信號的類型判斷待測樣品中是否含有人類免疫缺陷病毒的DNA模板及其數量和含量。
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