[發(fā)明專利]一種人體腸道菌群檢測(cè)方法、裝置及存儲(chǔ)介質(zhì)

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010120418.1
• 申請(qǐng)日: 2020-02-26
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN111370069B
• 公開(kāi)（公告）日: 2023-09-12
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 羅文;韓麗娟;鄧煜盛
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 康美華大基因技術(shù)有限公司
• 主分類號(hào): G16B50/00
• 分類號(hào): G16B50/00;G16B20/00
• 代理公司: 廣州市越秀區(qū)哲力專利商標(biāo)事務(wù)所(普通合伙) 44288
• 代理人: 孫柳

1.一種人體腸道菌群檢測(cè)方法，其特征在于，所述檢測(cè)方法包括：

樣本獲取步驟：獲取大量人體的糞便樣本，并根據(jù)每個(gè)糞便樣本得出對(duì)應(yīng)的腸道菌群信息以及對(duì)應(yīng)的人體基本信息；其中，腸道菌群信息是通過(guò)對(duì)對(duì)應(yīng)人體的糞便樣本進(jìn)行腸道菌群基因提取、比對(duì)基因庫(kù)得出的；

腸型劃分步驟：根據(jù)無(wú)監(jiān)督聚類方法對(duì)所有的糞便樣本進(jìn)行聚類得出每個(gè)糞便樣本所屬的腸型，進(jìn)而得出每個(gè)腸型對(duì)應(yīng)的糞便樣本的腸道菌群信息；

菌群分布計(jì)算步驟：首先根據(jù)每個(gè)糞便樣本對(duì)應(yīng)的人體基本信息劃分為肥胖人群組或正常人群組；然后分別計(jì)算正常人群的菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)和肥胖人群的菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)，進(jìn)而得出肥胖人群與正常人群的菌群多樣性分布趨勢(shì)圖；

檢測(cè)步驟：獲取待檢測(cè)樣本的腸道菌群信息，并根據(jù)待檢測(cè)樣本的腸道菌群信息以及系統(tǒng)中每個(gè)腸型對(duì)應(yīng)的糞便樣本得出待檢測(cè)樣本的所屬腸型以及根據(jù)待檢測(cè)樣本的腸道菌群信息和系統(tǒng)中的肥胖人群與正常人群的菌群多樣性分布趨勢(shì)圖得出待檢測(cè)樣本的檢測(cè)結(jié)果。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述一種人體腸道菌群檢測(cè)方法，其特征在于，所述檢測(cè)方法包括：報(bào)告生成步驟：根據(jù)待檢測(cè)樣本的檢測(cè)結(jié)果以及現(xiàn)有的研究文獻(xiàn)得出對(duì)應(yīng)的科學(xué)建議，進(jìn)而生成檢測(cè)報(bào)告；所述現(xiàn)有的研究文獻(xiàn)包括每個(gè)菌種與飲食、生活習(xí)慣相關(guān)的資料。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述一種人體腸道菌群檢測(cè)方法，其特征在于，所述腸型包括普氏菌屬腸型、擬桿菌屬腸型和胃球菌屬腸型。

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述一種人體腸道菌群檢測(cè)方法，其特征在于，所述菌群分布計(jì)算步驟包括：

計(jì)算步驟：對(duì)肥胖人群組或正常人群組采用三西格瑪方法去除異常樣本，再?gòu)膶?duì)應(yīng)組中隨機(jī)抽取50％的樣本并計(jì)算得出肥胖人群組或正常人群組的菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)，并為菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)設(shè)置對(duì)應(yīng)的置信區(qū)間；

平均步驟：對(duì)于肥胖人群組或正常人群組重復(fù)多次執(zhí)行計(jì)算步驟，并對(duì)肥胖人群組或正常人群組每次計(jì)算出的菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)取平均值得出肥胖人群組的菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)或正常人群組的菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)；

分布圖計(jì)算步驟：根據(jù)肥胖人群組的菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)和正常人群組的菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)得出肥胖人群與正常人群的菌群多樣性分布趨勢(shì)圖，同時(shí)將肥胖人群組的菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)與正常人群組的菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)的交匯點(diǎn)作為肥胖人群與正常人群的菌群多樣性分布趨勢(shì)圖的閾值。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述一種人體腸道菌群檢測(cè)方法，其特征在于，置信區(qū)間為95％。

6.根據(jù)權(quán)利要求4所述一種人體腸道菌群檢測(cè)方法，其特征在于，所述菌群多樣性參考標(biāo)準(zhǔn)包括香農(nóng)指數(shù)、厚壁菌門(mén)豐度值、擬桿菌門(mén)豐度值和肥胖相關(guān)核心菌種豐度值均值；所述菌群多樣性分布趨勢(shì)圖包括香農(nóng)指數(shù)分布趨勢(shì)圖、厚壁菌門(mén)分布趨勢(shì)圖、擬桿菌門(mén)分布趨勢(shì)圖和肥胖相關(guān)核心菌種分布趨勢(shì)圖。

7.根據(jù)權(quán)利要求1所述一種人體腸道菌群檢測(cè)方法，其特征在于，所述菌群分布計(jì)算步驟包括：根據(jù)體重指數(shù)將每個(gè)樣本劃分到正常人群組或肥胖人群組中。

8.根據(jù)權(quán)利要求7所述一種人體腸道菌群檢測(cè)方法，其特征在于，所述體重指數(shù)＝體重/(身高)²。

9.一種人體腸道菌群檢測(cè)裝置，包括存儲(chǔ)器和處理器，所述存儲(chǔ)器上存儲(chǔ)有可在處理器上運(yùn)行的人體腸道菌群檢測(cè)程序，所述人體腸道菌群檢測(cè)程序?yàn)橛?jì)算機(jī)程序，其特征在于：所述處理器執(zhí)行所述人體腸道菌群檢測(cè)程序時(shí)實(shí)現(xiàn)如權(quán)利要求1-8中任一項(xiàng)所述的一種人體腸道菌群檢測(cè)方法的步驟。

10.一種存儲(chǔ)介質(zhì)，所述存儲(chǔ)介質(zhì)為計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì)，其上存儲(chǔ)有人體腸道菌群檢測(cè)程序，所述人體腸道菌群檢測(cè)程序?yàn)橛?jì)算機(jī)程序，其特征在于：所述人體腸道菌群檢測(cè)程序被處理器執(zhí)行時(shí)實(shí)現(xiàn)如權(quán)利要求1-8中任一項(xiàng)所述的一種人體腸道菌群檢測(cè)方法的步驟。