[發明專利]一種前列腺癌術后GS升級的預測方法

有效

• 申請號: 202010113531.7
• 申請日: 2020-02-24
• 公開（公告）號: CN111254191B
• 公開（公告）日: 2023-10-03
• 發明（設計）人: 陳征;龐俊;高新;卓育敏
• 申請（專利權）人: 陳征
• 主分類號: C12Q1/6869
• 分類號: C12Q1/6869
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.一種前列腺癌術后GS升級的預測方法，其具體預測方法步驟包括：

步驟一，提取臨床腫瘤DNA標本，對提取臨床腫瘤DNA標本進行處理優化；

步驟二，進行焦磷酸測序模板PCR擴增，擴增PCR焦磷酸測序，設計甲基化檢測PCR引物和測序引物，并對測序引物進行標記；

步驟三，進行焦磷酸測序，將PCR產物與配體親和介質混合孵育后進行焦磷酸測序，通過焦磷酸檢測，得到各病例啟動子定量甲基化值；

步驟四，根據定量甲基化值設定特異性甲基化檢測及分析位點。

2.如權利要求1所述的一種前列腺癌術后GS升級的預測方法，其特征在于，根據焦磷酸測序后的檢測到相關位點甲基化值，選擇其中甲基化頻率最高的兩個點位作為GS升級的預測方法的參考點位。

3.如權利要求2所述的一種前列腺癌術后GS升級的預測方法，其特征在于，根據焦磷酸測序后的檢測到相關位點甲基化值，選擇其中甲基化頻率最高的兩個點位的甲基化值的平均值作為析和判斷的依據進行前列腺癌術后GS升級的預測。

4.如權利要求1-3任一項所述的一種前列腺癌術后GS升級的預測方法，其特征在于，步驟一中在提取臨床腫瘤DNA標本后，對所述臨床腫瘤DNA標本進行DNA純度檢測。

5.如權利要求1-3任一項所述的一種前列腺癌術后GS升級的預測方法，其特征在于，所述步驟一中對提取臨床腫瘤DNA標本進行處理優化步驟包括進行DNA修飾,在DNA修飾后進行MSP檢測。

6.如權利要求1-3任一項所述的一種前列腺癌術后GS升級的預測方法，其特征在于，所述步驟二中的進行焦磷酸測序模板PCR擴增，PCR產物進行1.5％瓊脂糖凝膠電泳分析。

7.如權利要求1-3任一項所述的一種前列腺癌術后GS升級的預測方法，其特征在于，焦磷酸測序步驟中包括將PCR產物與配體親和介質混合孵育。

8.如權利要求1-3任一項所述的一種前列腺癌術后GS升級的預測方法，其特征在于，所述測序引物圍繞不同位點設計有7對測序引物。

9.如權利要求1所述的一種前列腺癌術后GS升級的預測方法，其特征在于，該方法還包括步驟五：選定最終甲基化檢測及分析位點，最終甲基化檢測及分析位點選定為位點-848和-841。

10.如權利要求2所述的一種前列腺癌術后GS升級的預測方法，其特征在于，該方法還包括根據兩個位點-848和-841的平均甲基化值進行分析和判斷的依據進行前列腺癌術后GS升級的預測。