[發明專利]一種基于菌毛抗原基因分布對尿路感染部位進行定位判斷的方法在審
| 申請號： | 202010106384.0 | 申請日： | 2020-02-21 |
| 公開（公告）號： | CN111020028A | 公開（公告）日： | 2020-04-17 |
| 發明（設計）人： | 王荃;李曉;周開臣 | 申請（專利權）人： | 天津醫科大學 |
| 主分類號： | C12Q1/6883 | 分類號： | C12Q1/6883;C12Q1/689;G16B40/00 |
| 代理公司： | 天津市杰盈專利代理有限公司 12207 | 代理人： | 朱紅星 |
| 地址： | 300700 *** | 國省代碼： | 天津;12 |
| 權利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 基于 抗原 基因 分布 尿路感染 部位 進行 定位 判斷 方法 | ||
【權利要求書】：
1.一種基于菌毛抗原基因分布對尿路感染部位進行定位判斷的方法，其特征在于利用特異性PCR引物，對尿路致病性大腸桿菌基因的存在與否進行檢測，并利用機器學習XGBoost算法，對這22種菌毛抗原基因特征進行分類，通過分析UPEC菌株的菌毛抗原基因的分布，對尿路感染進行感染部位的預測；主要步驟包括：
細菌基因組提取；
PCR擴增；
PCR產物電泳檢測；
22種菌毛抗原基因的檢測；
上下尿路感染來源菌株的分組；
聚類分析；
機器學習建模；
所述的聚類分析指的是：根據PCR結果判斷每個菌株的這22個菌毛抗原基因的有無，將“有”視為“1”，“無”視為“0”，建立二進制矩陣；通過R語言中的Hcluster函數對這90個UPEC菌株進行22個菌毛抗原基因進行聚類，計算Euclidean距離，并用ward.D方法進行聚類并畫樹狀圖；
所述的機器學習建模指的是：對90個UPEC菌株進行了5次隨機分組，每次分為三組，分別為訓練集、驗證集和測試集，然后利用Pyhon3.8中的XGBoost算法，對上下尿路兩組UPEC菌株的22種菌毛抗原基因進行分類學習。
2.權利要求1所述的利用機器學習XGBoost算法對UPEC的菌毛抗原基因特征進行分類。
下載完整專利技術內容需要扣除積分，VIP會員可以免費下載。
該專利技術資料僅供研究查看技術是否侵權等信息，商用須獲得專利權人授權。該專利全部權利屬于天津醫科大學，未經天津醫科大學許可，擅自商用是侵權行為。如果您想購買此專利、獲得商業授權和技術合作，請聯系【客服】
本文鏈接：http://www.szxzyx.cn/pat/books/202010106384.0/1.html，轉載請聲明來源鉆瓜專利網。
- 上一篇：麥椒套種辣椒移栽機及應用其的辣椒移栽方法
- 下一篇：一種環保污水處理設備
