[發明專利]與谷子葉夾角基因緊密連鎖的分子標記SIsv0523

在審

• 申請號: 202010105919.2
• 申請日: 2020-02-20
• 公開（公告）號: CN113278719A
• 公開（公告）日: 2021-08-20
• 發明（設計）人: 鄒洪鋒;杜國華;李澤樺;蔡偉;崔巨多;常鋒;侯軍亮
• 申請（專利權）人: 深圳市華大農業應用研究院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 張立

本發明涉及分子生物學領域，具體涉及一種與谷子葉夾角基因緊密連鎖的分子標記。所提供的分子標記含有SEQ ID NO:1所示序列。還提供了一種擴增與谷子葉夾角基因緊密連鎖的分子標記的引物，包括SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示序列。所提供的分子標記和引物可以用于谷子葉夾角基因定位以及谷子的輔助育種領域，可以做到谷子的早甄別和早診斷。

技術領域

本發明涉及分子生物學領域，具體涉及一種與谷子葉夾角基因緊密連鎖的分子標記。還涉及擴增該分子標記的引物，該分子標記和引物在谷子葉夾角基因定位或谷子遺傳育種中的用途。

背景技術

谷子是起源于我國的重要糧食作物，也是特色抗旱作物，種子萌發只需要占其重量26％的水分，而高粱、小麥和玉米的種子萌發分別需要其重量的40％、45％和48％的水分，同時谷子對低土壤肥力的忍耐力較高。谷子是環境友好型C4作物，也是二倍體自花授粉作物，基因組約470M，非常適合作為基因組研究對象。

許多作物如小麥、水稻和玉米等作物通過培育理想株型新品種使其抗倒性、光能利用效率和產量水平得到顯著提高。目前生產上應用的谷子品種大多是披散株型，對光照資源利用率低的品種，對光能利用效率不到1％。但谷子是C4植物，具有超高產的遺傳生理。因此，培育具有理想株型的高光效谷子新品種對提高谷子單產水平具有重要意義。以作物葉片的著生角度及其在植株上的垂直分布為表征的葉群結構是決定作物株形的主要因素。它對群體內部的光分布和光合生產起重要作用。

葉夾角是高產和穩產的重要農藝性狀，直接關系到谷子光能利用效率和抗倒性。針對谷子葉夾角分子標記及相關研究還需要進一步改進。

發明內容

谷子葉夾角作為高產和穩產的重要農藝性狀，直接關系到谷子光能利用效率和抗倒。在谷子抽穗時，植株倒三葉葉片葉夾角小于25度，挺拔上沖，中下部葉片隨葉位的降低適當增大與莖的夾角，屬于葉夾角緊湊株型，從而使各葉層的入射光分布均勻，減少遮蔽，可以最大限度地利用光能。在谷子抽穗時，植株倒三葉葉片葉夾角大于25度為葉夾角非緊湊株型。借助分子生物學的手段，辨別緊湊型葉夾角以及非緊湊型葉夾角，應用于谷子作物的育種中，可以做到早甄別，早診斷。本發明的發明人通過研究發現與谷子葉夾角緊湊型基因緊密連鎖的分子標記SIsv0523，借助該分子標記運用谷子全基因組分子輔助育種技術培育具有理想株型的谷子高產新品種。

在本發明的第一方面，本發明提供了一種與谷子葉夾角基因緊密連鎖的分子標記，所述分子標記含有SEQ ID NO:1所示序列，優選地，所述分子標記為SEQ ID NO:1所示序列。SEQ ID NO:1序列如下所示：

TATCATTGGCACAAGGGACTAGTGCAATTATGTTATGATCCAAGGATAAATAGTTCTTCAATCTTTTTTGTCTGCTTCCTCTCCATCTGGATTGCCTAATCTTTTAGGATTCCAGATGGAATCATTAAGGTTCCTTTAACATTCCTTTAGGCCTCGTTCGTTTCACCAGGATTGGATTCCAGCTAGGATTACTTCCAGGTTCGGTTTGAGTGATTCCACCCGTATCACTCAATCCGGTCAGGATTCATTCCAAGGGTGAGGAGGTATGGTTTCAATCCGGGCCATCTAATGTAGAAGGATTCCAATCCAGGCCGGTTTTCGTTCCAGGCCAGACTAAAACGAACAACACTTTCAATGCAAGTCTGGTTTCAAATCGGGTCACTTCAAACCATCCGGAATGGACCTCATTCCGGGCCAATCCGGTGAAAACGAACGAGGTCTTAACAGGGTCTTGGTTGTGTTTCGTTTCTGTCCAACTTTTGTGTTTTCCGGATGACCTTAAATTGGTCTGAATCTGGCAACTCGGGTTGAATCGCTGCAAGTGCTCGCATCGTTGGGGCACTCAGTCTGGTGTCTAGATTCCAGGAGTGCGTAGATTGTTGCTGC(SEQ ID NO:1)。