[發(fā)明專利]基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的交互式肝臟圖像分割方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010104060.3 | 申請日: | 2020-02-20 |
| 公開(公告)號: | CN111340812A | 公開(公告)日: | 2020-06-26 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 廖勝輝;鄒忠全;韓付昌;申鍇鑌;蔣義勇;劉姝;趙于前 | 申請(專利權(quán))人: | 中南大學(xué) |
| 主分類號: | G06T7/10 | 分類號: | G06T7/10;G06N3/08 |
| 代理公司: | 長沙永星專利商標(biāo)事務(wù)所(普通合伙) 43001 | 代理人: | 周詠;米中業(yè) |
| 地址: | 410083 湖南*** | 國省代碼: | 湖南;43 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 基于 深度 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) 交互式 肝臟 圖像 分割 方法 | ||
1.一種基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的交互式肝臟圖像分割方法,包括如下步驟:
S1.采用LITS數(shù)據(jù)集作為訓(xùn)練數(shù)據(jù),并對LITS數(shù)據(jù)集中的數(shù)據(jù)進行預(yù)處理;
S2.選定預(yù)分割網(wǎng)絡(luò)和修復(fù)網(wǎng)絡(luò),并對選定的網(wǎng)絡(luò)模型進行優(yōu)化;
S3.對步驟S1中預(yù)處理后的數(shù)據(jù)進行再處理,從而解決數(shù)據(jù)不均衡的問題;
S4.在空間域上對特征圖中需要加強相應(yīng)的像素進行增強并得到初步分割結(jié)果,從而突出特征提取結(jié)果,進而提升分割精度;
S5.對步驟S4得到的初步分割結(jié)果進行變換,從而將交互式操作信息轉(zhuǎn)換為能夠進行多通道融合的圖像,并將所述的能夠進行多通道融合的圖像、原圖和初步分割結(jié)果一同作為修復(fù)網(wǎng)絡(luò)的輸入數(shù)據(jù);
S6.采用修復(fù)網(wǎng)絡(luò)對初步分割結(jié)果進行進一步修復(fù),從而得到最終的肝臟圖像分割結(jié)果。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的交互式肝臟圖像分割方法,其特征在于步驟S1所述的對LITS數(shù)據(jù)集中的數(shù)據(jù)進行預(yù)處理,具體為獲取的肝臟圖像數(shù)據(jù)信息,剪切出感興趣的區(qū)域,然后統(tǒng)一圖像數(shù)據(jù)的分辨率,最后對統(tǒng)一分辨率后的圖像重采樣至設(shè)定體素,從而得到一個序列圖像。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的交互式肝臟圖像分割方法,其特征在于步驟S2所述的選定預(yù)分割網(wǎng)絡(luò)和修復(fù)網(wǎng)絡(luò),具體為選定DenseVnet網(wǎng)絡(luò)作為預(yù)分割網(wǎng)絡(luò)和修復(fù)網(wǎng)絡(luò)。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的交互式肝臟圖像分割方法,其特征在于步驟S3所述的對步驟S1中預(yù)處理后的數(shù)據(jù)進行再處理,具體為利用NVIDIA聚合通信庫NCCL2.x中的算法,實現(xiàn)跨GPU同步BatchNormalization,擴大Mini batchsize,解決正負(fù)樣本比例嚴(yán)重不均衡等問題。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的交互式肝臟圖像分割方法,其特征在于步驟S4所述的在空間域上對特征圖中需要加強相應(yīng)的像素進行增強,具體為利用注意力機制,在空間域上,對特征圖中越需要加強響應(yīng)的像素賦以越大的權(quán)重。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的交互式肝臟圖像分割方法,其特征在于步驟S5所述的對步驟S4得到的初步分割結(jié)果進行變換,從而將交互式操作信息轉(zhuǎn)換為能夠進行多通道融合的圖像,具體為對步驟S4得到的初步分割結(jié)果,采用測地距離變換將交互式操作信息轉(zhuǎn)換為能夠進行多通道融合的圖像。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的交互式肝臟圖像分割方法,其特征在于所述的測地距離變換,具體為采用如下算式作為測地距離變換公式:
式中min為取最小值操作;Ωi為用戶交互的前景點或背景點;x為圖像中的任意一個體素點;l為體素點坐標(biāo);F為前景點坐標(biāo)集合;B為前景點坐標(biāo)集合;d(s,x)的計算公式為其中Cs,x(p)表示連接s和x的路徑,W為融入交互信息的權(quán)重。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的交互式肝臟圖像分割方法,其特征在于在訓(xùn)練階段,將交互式操作的種子點設(shè)定為預(yù)分割結(jié)果與GroundTruth差別區(qū)域的隨機位置,且種子點個數(shù)與差別區(qū)域像素個數(shù)之間滿足如下算式:
式中N為種子點個數(shù),n為差別區(qū)域的像素個數(shù)。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的交互式肝臟圖像分割方法,其特征在于步驟S6所述的采用修復(fù)網(wǎng)絡(luò)對初步分割結(jié)果進行進一步修復(fù),具體使用Dense CRF算法,對分割結(jié)果中出現(xiàn)的空洞和雜質(zhì)區(qū)域進行優(yōu)化。
10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的交互式肝臟圖像分割方法,其特征在于所述的Dense CRF算法,具體為采用如下算式作為能量函數(shù)表達式:
式中為每一個體素只與自身類別相關(guān)的Unary能量函數(shù);為每一個體素的類別信息與其他所有體素的類別信息的相關(guān)信息。
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