[發明專利]針對IGF1基因檢測豬背膘厚和眼肌面積的SNP標記及引物序列

在審

• 申請號: 202010085909.7
• 申請日: 2020-02-09
• 公開（公告）號: CN112941196A
• 公開（公告）日: 2021-06-11
• 發明（設計）人: 唐中林;劉思遠;易國強;楊亞嵐
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院農業基因組研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京康思博達知識產權代理事務所(普通合伙) 11426
• 代理人: 劉冬梅;范國鋒

1.一種與豬背膘厚和100kg體重眼肌面積相關的SNP標記，其特征在于，所述SNP標記位于IGF1基因上。

2.根據權利要求1所述的SNP標記，其特征在于，所述SNP標記位于國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome5：81,780,255處，具有T/C多態性。

3.根據權利要求2所述的SNP標記，其特征在于，所述位于國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome5：81,780,255處的SNP位點的基因型為CC的豬，相較于基因型為TT和TC型的豬，具有較低的背膘厚和較高的眼肌面積。

4.一種用于檢測權利要求1至3之一所述SNP標記的引物對，其特征在于，

所述用于檢測位于國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome5：81,780,255處的SNP標記的引物對為P1和P2，其核苷酸序列分別如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。

5.一種權利要求1至3之一所述SNP標記或權利要求4所述引物對在鑒定豬背膘厚和眼肌面積，或者在豬繁殖育種中的應用。

6.一種篩選權利要求1至3之一所述SNP標記的方法，其特征在于，所述方法包括以下步驟：

步驟1，提取豬的基因組DNA；

步驟2，進行基因分型；

步驟3，進行基因型數據和表型數據的關聯分析。

7.一種鑒定或輔助鑒定豬背膘厚和100kg體重眼肌面積的方法，所述方法包括確定待測豬位于國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome5：81,780,255處SNP標記的基因型的步驟。

8.一種權利要求1至3之一所述SNP標記或權利要求6所述方法篩選得到的SNP標記在篩選低背膘厚和高眼肌面積豬群體方面的應用。

9.根據權利要求8所述的應用，其特征在于，所述應用包括以下步驟：

步驟I，提取待測豬的基因組DNA；

步驟II，檢測待測豬位于國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome5：81,780,255處SNP標記的基因型；

步驟III，根據基因型篩選低背膘厚和高眼肌面積豬群體。

10.一種豬背膘厚和眼肌面積性狀的遺傳改良方法，其特征在于，所述方法包括確定豬位于國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome5：81,780,255處的SNP標記的基因型，并根據基因型進行相應選擇的步驟；

優選地，種豬的繼代選擇國際豬基因組10.2版本參考序列5號染色體上第81,780,255處的SNP位點的基因型為CC的個體，淘汰該SNP位點基因型為TT和TC的個體。