[發(fā)明專利]一種預(yù)測胎盤源性疾病的評估和預(yù)測的方法和試劑盒

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202010084924.X
• 申請日: 2020-02-10
• 公開（公告）號: CN113249458B
• 公開（公告）日: 2023-07-07
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 張翼;吳凱;常璐媛;劉佳;金婉
• 申請（專利權(quán)）人: 北京優(yōu)樂復(fù)生科技有限責(zé)任公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;G16H50/20
• 代理公司: 北京林達(dá)劉知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11277
• 代理人: 劉新宇;李茂家

1.一種檢測待測樣品中的至少一個人類基因組區(qū)域上的、攜帶DNA甲基化修飾或其豐度或DNA甲基化單倍型或其修飾豐度的試劑在制備用于檢測、監(jiān)測或預(yù)測受試者是否患有胎盤源性妊娠期病癥的試劑或試劑盒中的用途；其中，所述DNA甲基化修飾或所述DNA甲基化單倍型來源于正常妊娠孕婦胎盤和患有胎盤源性妊娠期疾病孕婦胎盤的甲基化差異區(qū)域；

所述待測樣品來源于所述受試者；

所述甲基化差異區(qū)域?yàn)槿绺奖?所示的基因組區(qū)域；

所述DNA甲基化修飾為如附表1所示的基因組區(qū)域內(nèi)CpG位點(diǎn)的甲基化修飾；

所述DNA甲基化單倍型為如附表1所示的基因組區(qū)域所覆蓋的DNA甲基化單倍型；

所述DNA甲基化修飾或其豐度或DNA甲基化單倍型或其修飾豐度能區(qū)分正常妊娠孕婦胎盤和患有胎盤源性妊娠期病癥的孕婦胎盤；

所述胎盤源性妊娠期病癥為子癇前期；

所述附表1所示的基因組區(qū)域?yàn)榛贕RCh37版本進(jìn)行編號的基因組區(qū)域。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用途，其中，所述待測樣品來源于所述受試者；

所檢測的所述DNA甲基化修飾或DNA甲基化單倍型位于選自如下(i)-(iii)所示的區(qū)域中的一個或多個區(qū)域：

(i)位于LTR12轉(zhuǎn)座子家族區(qū)域；

(ii)位于FLT1基因及其調(diào)控區(qū)域；

(iii)位于LIFR基因及其調(diào)控區(qū)域。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的用途，其中，所述LTR12轉(zhuǎn)座子為LTR12C轉(zhuǎn)座子或LTR12E轉(zhuǎn)座子；和/或，所述FLT1基因及其調(diào)控區(qū)域?yàn)槿祟惾旧wchr13:28800000bp-302000000bp之間的區(qū)域；和/或，所述LIFR基因及其調(diào)控區(qū)域?yàn)槿祟惾旧wchr5:38370000bp–38840000bp之間的區(qū)域。

4.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的用途，其中，所述待測樣品選自來源于血液、尿液、糞便、唾液、口腔拭子、宮頸分泌物、宮頸涂片、羊水穿刺、胎兒絨毛或胎兒循環(huán)細(xì)胞的樣品。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的用途，其中，所述血液為外周血。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的用途，其中，所述外周血為血漿。

7.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的用途，其中，檢測所述來源于正常妊娠孕婦胎盤和患有胎盤源性妊娠期疾病孕婦胎盤的甲基化差異區(qū)域的試劑選自DNA甲基化狀態(tài)顯示劑；或

檢測來自受試者樣品中DNA甲基化修飾的存在的試劑。

8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的用途，其中，所述檢測來自受試者樣品中DNA甲基化修飾的存在的試劑為富集特征DNA所需的試劑。

9.根據(jù)權(quán)利要求7所述的用途，其中，所述DNA甲基化狀態(tài)顯示劑選自識別甲基化DNA的抗體或結(jié)合蛋白、亞硫酸氫鹽、具有DNA催化氧化作用的酶類、具有DNA脫氨基作用的酶類或甲基化敏感酶，或其組合。

10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的用途，其中，所述甲基化敏感酶選自甲基化敏感的限制性內(nèi)切酶。

11.根據(jù)權(quán)利要求10所述的用途，其中，所述甲基化敏感的限制性內(nèi)切酶選自HpaII或BstUI，或其組合。

12.根據(jù)權(quán)利要求8所述的用途，其中，所述富集特征DNA所需的試劑選自雜交探針捕獲法所需的試劑、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增法所需的試劑、錨定核酸擴(kuò)增法所需的試劑、用于邊合成邊測序檢測的試劑，或用于單分子測序的試劑，或其組合。

13.根據(jù)權(quán)利要求8所述的用途，其中，所述富集特征DNA所需的試劑為探針或探針組。

14.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的用途，其中，所述檢測為產(chǎn)前檢測。