[發明專利]RNA序列編碼潛力的計算方法及系統有效
| 申請號： | 202010075959.7 | 申請日： | 2020-01-21 |
| 公開（公告）號： | CN111276182B | 公開（公告）日： | 2023-06-20 |
| 發明（設計）人： | 諶先敢;陽小飛;牛艷慶;劉李漫;李智 | 申請（專利權）人： | 中南民族大學 |
| 主分類號： | G16B20/00 | 分類號： | G16B20/00;G16B30/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 武漢智權專利代理事務所(特殊普通合伙) 42225 | 代理人： | 邱云雷 |
| 地址： | 430000 湖北*** | 國省代碼： | 湖北;42 |
| 權利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | rna 序列 編碼 潛力 計算方法 系統 | ||
1.一種RNA序列編碼潛力的計算方法，其特征在于，包括以下步驟：
對訓練數據中的部分數據進行過采樣，得到新訓練數據；
計算新訓練數據的序列特征，將該序列特征及標簽輸入分類器進行訓練；
采用訓練所得到的模型對測試數據的特征進行預測；
將預測的標簽與真實的標簽進行比較，得到評估結果；
所述訓練數據包含編碼RNAs和非編碼RNAs，按照ORF長度是否大于303的條件，編碼RNAs分為ORF長度小于303的數據和其他ORF長度的數據；非編碼RNAs分為ORF長度位于151-303之間的數據和其他長度的數據；
所述對訓練數據中的部分數據進行過采樣，包括以下步驟：
對訓練數據中ORF長度小于303的編碼RNAs進行過采樣，使之達到與ORF長度在151-303之間的非編碼RNAs同樣的數目；
所述對訓練數據中的部分數據進行過采樣，還包括以下步驟：
在除ORF長度和ORF完整性以外的特征值上，加一定比例的擾動值，生成新的樣本點；
在除ORF長度和ORF完整性以外的特征值上，加一定比例的擾動值，數學公式如下：
Fnew＝F+Fother*a，
其中，Fnew是加入擾動之后的新特征值，F是原來的特征值，Fother是除ORF長度和ORF完整性以外的其他特征值，a是擾動的系數。
2.一種RNA序列編碼潛力的計算系統，其特征在于，包括：
過采樣單元，用于：對訓練數據中的部分數據進行過采樣，得到新訓練數據；
訓練單元，用于：計算新訓練數據的序列特征，將該序列特征及標簽輸入分類器進行訓練；
預測單元，用于：采用訓練所得到的模型對測試數據的特征進行預測；
評估單元，用于：將預測的標簽與真實的標簽進行比較，得到評估結果；
所述訓練數據包含編碼RNAs和非編碼RNAs，按照ORF長度是否大于303的條件，編碼RNAs分為ORF長度小于303的數據和其他ORF長度的數據；非編碼RNAs分為ORF長度位于151-303之間的數據和其他長度的數據；
所述對訓練數據中的部分數據進行過采樣，包括以下步驟：
對訓練數據中ORF長度小于303的編碼RNAs進行過采樣，使之達到與ORF長度在151-303之間的非編碼RNAs同樣的數目；
所述過采樣單元對訓練數據中的部分數據進行過采樣，還包括以下步驟：
在除ORF長度和ORF完整性以外的特征值上，加一定比例的擾動值，生成新的樣本點；
在除ORF長度和ORF完整性以外的特征值上，加一定比例的擾動值，數學公式如下：
Fnew＝F+Fother*a，
其中，Fnew是加入擾動之后的新特征值，F是原來的特征值，Fother是除ORF長度和ORF完整性以外的其他特征值，a是擾動的系數。
該專利技術資料僅供研究查看技術是否侵權等信息，商用須獲得專利權人授權。該專利全部權利屬于中南民族大學，未經中南民族大學許可，擅自商用是侵權行為。如果您想購買此專利、獲得商業授權和技術合作，請聯系【客服】
本文鏈接：http://www.szxzyx.cn/pat/books/202010075959.7/1.html，轉載請聲明來源鉆瓜專利網。
