[發明專利]炎性腸病特異性腸道微生物檢測靶標及其應用

在審

• 申請號: 202010072903.6
• 申請日: 2020-01-15
• 公開（公告）號: CN113122646A
• 公開（公告）日: 2021-07-16
• 發明（設計）人: 馬占山;李文迪
• 申請（專利權）人: 中國科學院昆明動物研究所
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;G16B30/00
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

本發明涉及生物信息技術及醫療健康領域，公開了一類炎性腸病(IBD)特異性微生物檢測靶標及其應用，其特征在于這類靶標涉及Clostridium tertium，Odoribacter splanchnicus，Ruminococcus gnavus和Flavonifractor plautii四種細菌中的任意一種或數種。本發明基于微生物物種組成及物種間復雜網絡結構等分析，通過比較IBD患者和健康對照腸道黏膜菌群間存在的差異，從眾多候選微生物中篩選出上述四種細菌。這四種細菌與IBD的發病及病情惡化間存在顯著的相關性。通過檢測糞便或腸道黏膜內這四種細菌的變化，可輔助IBD的診斷和相關治療效果的評估。這四種細菌也可作為治療靶標，用于包括藥物、益生菌及糞便移植等在內的任何IBD治療當中，同時也為IBD相關治療制劑和治療策略的研發提供了思路和基礎。

技術領域

本發明涉及生物信息技術和醫療健康領域，特別涉及可用于炎性腸病診斷和治療的特異性微生物靶標及其應用，其中該類靶標主要由Clostridium tertium，Odoribactersplanchnicus，Ruminococcus gnavus和Flavonifractor plautii四個細菌物種中的任意一種或數種構成。

背景技術

炎癥性腸病(IBD)是一種慢行非特異性腸道炎癥性疾病，包括潰瘍性結腸炎(UC)、克羅恩病(CD)和未定型結腸炎。IBD的發病率在全球范圍內呈上升趨勢，其病因和發病機制卻仍不明確，但初步認為是環境、感染等理化因素作用于具有遺傳易感性的個體，引發免疫系統異常反應，導致腸道非特異性炎癥。IBD不僅會引起腹痛、腹瀉、血便等消化道癥狀，甚至會引發高熱、貧血、肛周病變、腸病性關節炎、原發性硬化性膽管炎等腸外表現。

人體腸道菌群在營養代謝、防止病原體入侵和免疫系統發育等方面起著關鍵作用。現有研究已發現腸道菌群失調與IBD發生發展間存在密切的聯系。與健康人相比，IBD患者腸道微生物菌群結構發生了明顯改變，并且腸道菌群失調導致條件致病菌增多，從而還會引發與IBD相關的一系列免疫損傷。傳統的IBD治療包括類皮質激素、氨基水楊酸、免疫抑制劑等，但因缺乏明確的治療靶標，導致副作用較強，臨床治療效果欠佳。近年來，伴隨腸道菌群研究的深入，許多基于微生物的療法逐漸發展起來，例如益生菌和糞便微生物移植。這些療法可以通過抑制腸道致病菌、改善腸黏膜屏障功能及免疫調節等恢復腸道菌群的穩態，從而一定程度上有效緩解了IBD的臨床癥狀。但同樣因缺乏針對性和相對較高的成本，一些菌群相關的療法只是作為輔助治療，或只適用于個別臨床病例，未大規模普及。

針對上述提到診治缺乏針對性的問題，本發明提供了一類特異性針對IBD的微生物檢測靶標，其中主要包括Clostridium tertium，Odoribacter splanchnicus，Ruminococcus gnavus和Flavonifractor plautii四個細菌物種。這四個物種是在腸道菌群中發現與IBD疾病發生、發展密切相關的潛在病原體。該類檢測靶標可用于IBD的特異性診斷、治療和愈后評估，具有很好的臨床應用價值。

發明內容

本發明的目的在于：

缺乏炎性腸病(IBD)診斷和治療針對性的問題，提供IBD特異性腸道微生物檢測靶標，及其在IBD診斷、治療和愈后效果評估中的應用。

為實現上述發明目的，本發明的技術方案為：