[發明專利]使用凝聚核酸顆粒的裝置制備

在審

• 申請號: 202010071135.2
• 申請日: 2014-09-12
• 公開（公告）號: CN111394444A
• 公開（公告）日: 2020-07-10
• 發明（設計）人: G.羅;M.塞多瓦;D.萊特;R.瓊斯;M.阿蘭賈里
• 申請（專利權）人: 生命技術公司
• 主分類號: C12Q1/6874
• 分類號: C12Q1/6874
• 代理公司: 北京市柳沈律師事務所 11105
• 代理人: 何偉;曹立莉

一種對核酸鏈進行測序的方法包括接收具有耦聯到聚合物基質的核酸鏈的顆粒，將所述顆粒暴露于包括凝聚劑的溶液，以及將所述顆粒施加到表面，所述顆粒沉積在所述表面上。

本申請是中國發明專利申請(申請日：2014年9月12日；申請號：201480057632.X(國際申請號：PCT/US2014/055485)；發明名稱：使用凝聚核酸顆粒的裝置制備)的分案申請。

相關申請交叉參考

本申請要求于2013年9月13日提交的美國臨時申請第61/877,745號的權益，所述申請以全文引用的方式并入本文中。

本申請要求于2014年7月2日提交的美國臨時申請第62/020,292號的權益，所述申請以全文引用的方式并入本文中。

技術領域

本公開總體涉及用于制備適用于核酸測序的裝置的系統和方法，具體地涉及用于制備利用含核酸的顆粒的此類裝置的系統和方法。

背景技術

核酸鏈(尤其DNA)的測序在包括醫學、農業和生物研究的先進領域中已變得愈來愈重要。然而，常規的用于對核酸鏈進行測序的凝膠技術已證實耗時且昂貴。最新的研發依賴于含核酸的樣品沉積在襯底上。依據測序技術，可通過測量對核酸添加的離子響應或通過測量由核酸添加引起的螢光發射來確定核酸樣品的序列。

然而，依賴于核酸樣本沉積在襯底上的此類技術具有由一些核酸鏈結合到襯底表面的失敗造成的缺陷或由鏈非常接近于彼此地結合造成的缺陷。此類缺陷可導致襯底的未充分利用、不精確的數據、損失或不完全的樣品或其他不準確性。

因而，改進的用于制備測序裝置的系統和方法將是合乎需要的。

附圖說明

通過參考附圖，可更好地理解本發明，并且使本領域的技術人員清楚其眾多特征和優勢。

圖1包括用于沉積核酸樣品的示例性方法的圖解。

圖2包括用于制備核酸顆粒和制備用于測序的裝置的示例性裝置的圖示。

圖3包括在暴露于六氨合鈷期間珠粒或顆粒的圖像。

圖4、圖5、圖6、圖7和圖8包括珠粒或顆粒對暴露于六氨合鈷的尺寸響應的圖表圖解。

圖9包括在暴露于或不暴露于六氨合鈷兩者的情況下，核酸結合珠粒或顆粒的離解動力學的曲線圖解。

圖10和圖11包括凝聚劑對珠粒尺寸影響的曲線圖解。

在不同附圖中使用相同參考符號指示相似或相同的物件。

具體實施方式

在一個實施例中，方法包括制備核酸珠粒或顆粒、凝聚核酸珠粒以及將凝聚的核酸珠粒沉積在傳感器襯底上。在另一個實例中，該方法包括將核酸珠粒沉積在傳感器襯底上以及凝聚沉積的核酸珠粒。核酸珠粒或顆粒包括結合到一個或多個核酸鏈的珠粒。凝聚核酸珠粒可包括凝聚結合到珠粒的核酸、收縮珠粒的聚合物，或其組合，有效地減小核酸珠粒的尺寸。沉積之后，可洗滌凝聚的核酸珠粒，這可展開凝聚的核酸珠粒。隨后，帶有沉積的核酸珠粒的傳感器襯底可用于核酸試驗，如測序，例如合成測序。凝聚核酸珠粒或顆粒可包括將核酸珠粒或顆粒暴露于凝聚劑。凝聚試劑可凝聚核酸珠粒或顆粒的方面，例如凝聚核酸、顆粒的聚合物基質或其組合。在一個實例中，凝聚劑包括具有3⁺電荷的金屬絡合物。舉例來說，金屬絡合物可為鈷絡合物，如鈷-胺絡合物。在另一實例中，凝聚劑包括的堿金屬鹽或堿土金屬鹽，如鎂鹽。在另一個實例中，凝聚試劑包括非離子聚合物試劑，如聚乙二醇類試劑。